MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1 chromosome

Total Repeats: 6538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010531	AGC	2	6	822932	822937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_010531	TGC	2	6	823005	823010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_010531	ATT	2	6	823021	823026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_010531	ATT	2	6	823063	823068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_010531	CTAT	2	8	823103	823110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_010531	CGG	2	6	823128	823133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_010531	TTGA	2	8	823174	823181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_010531	ACT	2	6	823202	823207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_010531	CCAT	2	8	823211	823218	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_010531	CAT	2	6	823290	823295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_010531	TGA	2	6	823347	823352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_010531	GCT	2	6	823372	823377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_010531	ATG	2	6	823385	823390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_010531	CA	3	6	823411	823416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_010531	ATG	2	6	823448	823453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_010531	GAA	2	6	823501	823506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_010531	TTGG	2	8	823625	823632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_010531	CAT	2	6	823710	823715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_010531	TGC	2	6	823728	823733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_010531	ACG	2	6	823870	823875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_010531	TG	3	6	823921	823926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_010531	CA	3	6	823952	823957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_010531	TGC	2	6	823973	823978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_010531	CTAAAG	2	12	824002	824013	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3525	NC_010531	CAG	2	6	824065	824070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_010531	TTA	2	6	825266	825271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_010531	CTTTTC	2	12	825835	825846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_010531	GCTC	2	8	825900	825907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_010531	CAA	3	9	826067	826075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_010531	GAA	2	6	826122	826127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_010531	GAG	2	6	826226	826231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_010531	AACATC	2	12	826358	826369	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_010531	ATG	2	6	826385	826390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_010531	ACA	2	6	826461	826466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_010531	CG	3	6	826566	826571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_010531	T	7	7	826603	826609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_010531	TTC	2	6	826620	826625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_010531	AACC	2	8	826667	826674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_010531	CAC	2	6	826794	826799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_010531	ATT	2	6	826850	826855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_010531	TGG	2	6	826879	826884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_010531	T	7	7	826928	826934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_010531	AGG	2	6	827024	827029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_010531	ATT	2	6	827386	827391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_010531	TGA	2	6	828800	828805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_010531	AAAAG	2	10	828842	828851	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_010531	CGGTAG	2	12	828861	828872	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3548	NC_010531	CAA	2	6	828989	828994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_010531	ATT	2	6	829001	829006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_010531	GCC	2	6	829019	829024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_010531	CAT	2	6	829052	829057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_010531	ATG	2	6	829092	829097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_010531	CTG	2	6	829108	829113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_010531	ACTG	2	8	829188	829195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_010531	TCG	2	6	829196	829201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_010531	TTG	2	6	829267	829272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_010531	CTG	2	6	829378	829383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_010531	TCGCAT	2	12	829385	829396	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_010531	CCA	2	6	829516	829521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_010531	GCC	2	6	829539	829544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_010531	ATG	2	6	829640	829645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_010531	TTA	2	6	829663	829668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_010531	GCA	2	6	829805	829810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_010531	CAT	2	6	829848	829853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_010531	GCC	2	6	829864	829869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_010531	CAG	2	6	829964	829969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_010531	GAA	2	6	830134	830139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_010531	TGT	2	6	830166	830171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_010531	CCA	2	6	830173	830178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_010531	GCA	2	6	830260	830265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_010531	TGG	2	6	830270	830275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_010531	TCT	2	6	830325	830330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_010531	GAA	2	6	831552	831557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_010531	TTTA	2	8	834264	834271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_010531	TAA	2	6	835136	835141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_010531	CTTA	2	8	835163	835170	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3577	NC_010531	TTTG	2	8	835203	835210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_010531	GCA	2	6	835220	835225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_010531	ACGA	2	8	835310	835317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3580	NC_010531	TAT	2	6	835321	835326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_010531	T	6	6	835326	835331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_010531	ACA	2	6	835332	835337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_010531	AAG	2	6	835405	835410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_010531	CAT	2	6	835492	835497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_010531	GCG	2	6	835528	835533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_010531	GAA	2	6	835557	835562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_010531	GAT	2	6	835663	835668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_010531	TGA	2	6	835765	835770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_010531	AGA	2	6	835786	835791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_010531	GC	3	6	835810	835815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_010531	GC	3	6	835901	835906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_010531	TCA	2	6	835960	835965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_010531	AAC	2	6	835980	835985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_010531	A	6	6	835995	836000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_010531	T	6	6	836004	836009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_010531	TTA	2	6	836017	836022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_010531	GATG	2	8	841930	841937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_010531	ATT	2	6	841960	841965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_010531	GCT	2	6	842027	842032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_010531	AGCGAT	2	12	842038	842049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3601	NC_010531	CAA	2	6	842100	842105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_010531	CAT	2	6	842160	842165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_010531	CT	3	6	842208	842213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_010531	AAT	2	6	842218	842223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_010531	CAG	2	6	842275	842280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_010531	T	6	6	842296	842301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_010531	GTT	2	6	842378	842383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_010531	CTT	2	6	842390	842395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_010531	ATC	2	6	842411	842416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_010531	ACT	2	6	842496	842501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_010531	TTA	2	6	842586	842591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_010531	GCA	2	6	842602	842607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_010531	GCA	2	6	842616	842621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_010531	GT	3	6	842642	842647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_010531	GCA	2	6	842677	842682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_010531	TAA	2	6	842762	842767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_010531	AGT	2	6	842770	842775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_010531	TTGG	2	8	842788	842795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_010531	TAA	2	6	844344	844349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_010531	CAG	2	6	844997	845002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_010531	CTG	2	6	845013	845018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_010531	GCA	2	6	845068	845073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_010531	GCT	2	6	845089	845094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_010531	T	6	6	845104	845109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_010531	ACA	2	6	845143	845148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_010531	CTT	2	6	845154	845159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_010531	AC	3	6	845187	845192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_010531	TCTT	2	8	845211	845218	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_010531	GCT	2	6	845219	845224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_010531	TTCAT	2	10	845288	845297	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3631	NC_010531	AGT	2	6	845329	845334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3633	NC_010531	AAGT	2	8	845407	845414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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