MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1 chromosome

Total Repeats: 6538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010531	TGA	2	6	110291	110296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010531	GGC	2	6	110300	110305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_010531	GA	3	6	110317	110322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010531	AGAT	2	8	110326	110333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010531	CTT	2	6	110424	110429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_010531	CGT	2	6	110459	110464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_010531	CAT	3	9	110474	110482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_010531	TGG	2	6	110506	110511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010531	ATT	2	6	110517	110522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_010531	AT	3	6	110563	110568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010531	CTA	2	6	110575	110580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_010531	GA	3	6	110585	110590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010531	TGC	2	6	110625	110630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_010531	TAA	3	9	110633	110641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_010531	CAT	2	6	110653	110658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_010531	ATGG	2	8	110664	110671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_010531	A	6	6	110762	110767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010531	TGC	2	6	110944	110949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_010531	TTG	2	6	110966	110971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010531	TGG	2	6	110994	110999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010531	TAA	2	6	111043	111048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_010531	TCTCG	2	10	111074	111083	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
523	NC_010531	TGT	2	6	111202	111207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010531	T	6	6	111265	111270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010531	TTG	2	6	111330	111335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010531	GCTA	2	8	111377	111384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
527	NC_010531	AGC	2	6	111473	111478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_010531	ATCC	2	8	111512	111519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_010531	TGT	2	6	111536	111541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010531	GTT	2	6	111677	111682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010531	CAT	2	6	111710	111715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_010531	TTC	2	6	111764	111769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_010531	ATT	2	6	111785	111790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010531	A	6	6	111799	111804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010531	TCTT	2	8	111831	111838	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_010531	GGTA	2	8	111891	111898	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010531	AAT	2	6	111899	111904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010531	GGC	2	6	111929	111934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_010531	ATG	2	6	111939	111944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_010531	GCC	2	6	112023	112028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_010531	TTCTG	2	10	112043	112052	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
542	NC_010531	TC	3	6	112099	112104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_010531	AT	3	6	112117	112122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010531	TCG	2	6	112191	112196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_010531	AGG	2	6	112656	112661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010531	CAAT	2	8	112700	112707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_010531	ATTT	2	8	112776	112783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010531	GCC	2	6	112786	112791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_010531	AGA	2	6	112795	112800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010531	GGC	2	6	112839	112844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_010531	AAAT	2	8	112899	112906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010531	CTAGCT	2	12	112928	112939	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010531	CAA	2	6	113001	113006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_010531	TTA	2	6	113089	113094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010531	CTG	2	6	113110	113115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_010531	A	6	6	113310	113315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010531	GTTG	2	8	113356	113363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010531	GTT	2	6	113368	113373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010531	TTG	2	6	113558	113563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010531	AAC	2	6	113631	113636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_010531	TGA	2	6	113685	113690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010531	CTT	2	6	113718	113723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_010531	TTG	2	6	113819	113824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010531	CAT	2	6	113853	113858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_010531	TGC	2	6	113898	113903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_010531	TTG	2	6	113915	113920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010531	CCA	2	6	113971	113976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_010531	A	6	6	113976	113981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_010531	CAA	2	6	114011	114016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_010531	A	6	6	114015	114020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010531	ACA	2	6	114059	114064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_010531	GTTG	2	8	114456	114463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010531	CTT	2	6	114481	114486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_010531	GTGC	2	8	114512	114519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
575	NC_010531	TGC	2	6	114550	114555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_010531	TCC	2	6	114631	114636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_010531	CAG	2	6	114674	114679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010531	ATTT	2	8	114754	114761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010531	CT	3	6	114773	114778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_010531	A	6	6	114824	114829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010531	ATG	2	6	114863	114868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010531	TGA	2	6	114890	114895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010531	T	6	6	115567	115572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010531	AC	3	6	115580	115585	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_010531	CAT	2	6	115595	115600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_010531	CAC	2	6	115658	115663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_010531	TCAA	2	8	115665	115672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_010531	GC	3	6	115823	115828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_010531	TGA	2	6	115928	115933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010531	A	6	6	115938	115943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_010531	AG	4	8	115961	115968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010531	TGG	2	6	116012	116017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010531	CAG	2	6	116019	116024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_010531	GT	3	6	116027	116032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010531	TGT	2	6	116071	116076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010531	GTG	2	6	116109	116114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010531	TGC	2	6	116166	116171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_010531	GC	3	6	116193	116198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_010531	ATT	2	6	116238	116243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010531	GCTC	2	8	116283	116290	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
601	NC_010531	CTGG	2	8	116319	116326	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
602	NC_010531	CCTT	2	8	117981	117988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_010531	GA	3	6	118717	118722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010531	TGA	2	6	120968	120973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010531	TGT	2	6	120984	120989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010531	TGT	2	6	120995	121000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_010531	AAAT	2	8	121021	121028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010531	ATT	2	6	121659	121664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010531	GGT	2	6	122142	122147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010531	CAC	2	6	122169	122174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_010531	TCA	2	6	122202	122207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_010531	CCT	2	6	122214	122219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_010531	TAGT	2	8	122228	122235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010531	ATG	2	6	122455	122460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010531	AGT	2	6	123786	123791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010531	CTT	2	6	124956	124961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_010531	CAA	2	6	124985	124990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010531	ACC	2	6	125085	125090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_010531	CTG	2	6	125099	125104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_010531	ACC	2	6	125185	125190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_010531	AAGC	2	8	125209	125216	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
622	NC_010531	AGC	2	6	125218	125223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_010531	AACT	2	8	125434	125441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
624	NC_010531	AAAAG	2	10	125496	125505	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010531	GCC	2	6	125512	125517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_010531	A	7	7	125531	125537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_010531	ATT	2	6	125575	125580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_010531	T	7	7	125598	125604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010531	A	7	7	125625	125631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010531	TCT	2	6	125640	125645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_010531	AATA	2	8	125669	125676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010531	GGT	2	6	125740	125745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010531	AG	3	6	125805	125810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_010531	C	6	6	125822	125827	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
635	NC_010531	TCAG	2	8	125848	125855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_010531	TCC	2	6	125880	125885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_010531	GGA	2	6	125900	125905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_010531	GCT	2	6	126058	126063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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