MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1 chromosome

Total Repeats: 6538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010531	CATT	2	8	1278451	1278458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_010531	AGT	2	6	1280562	1280567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_010531	GCA	2	6	1280618	1280623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_010531	GTT	2	6	1280702	1280707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_010531	CTG	2	6	1280793	1280798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_010531	GCGA	2	8	1280833	1280840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_010531	CT	3	6	1280880	1280885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_010531	CTC	2	6	1280958	1280963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_010531	CTT	2	6	1280967	1280972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_010531	GAG	2	6	1281004	1281009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_010531	CCA	2	6	1281038	1281043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_010531	CAA	2	6	1283116	1283121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_010531	AATG	2	8	1283182	1283189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_010531	TG	3	6	1283188	1283193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_010531	A	8	8	1285135	1285142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_010531	TGT	2	6	1285153	1285158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_010531	TGA	2	6	1285161	1285166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_010531	A	6	6	1285223	1285228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_010531	T	6	6	1285243	1285248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_010531	T	6	6	1285834	1285839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_010531	ATTC	2	8	1285874	1285881	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_010531	AATG	2	8	1286999	1287006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_010531	T	6	6	1288982	1288987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_010531	TGG	2	6	1289688	1289693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_010531	AGG	2	6	1289699	1289704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_010531	TCTA	2	8	1289748	1289755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5527	NC_010531	AGTC	2	8	1289812	1289819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5528	NC_010531	CAGC	2	8	1289828	1289835	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_010531	CAA	2	6	1290664	1290669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_010531	A	7	7	1290668	1290674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_010531	CGG	2	6	1297841	1297846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_010531	AAC	2	6	1297958	1297963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_010531	CAA	2	6	1297978	1297983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_010531	TAG	2	6	1297997	1298002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_010531	TTTG	2	8	1298106	1298113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_010531	TATT	2	8	1298226	1298233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_010531	CAT	2	6	1298284	1298289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5539	NC_010531	ACC	2	6	1298309	1298314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_010531	TTG	2	6	1298336	1298341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_010531	GCA	2	6	1298391	1298396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_010531	TTGA	2	8	1298435	1298442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_010531	AAAG	2	8	1298566	1298573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_010531	TGG	2	6	1301816	1301821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_010531	ACCCC	2	10	1301895	1301904	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5546	NC_010531	C	6	6	1301901	1301906	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5547	NC_010531	AGA	2	6	1301993	1301998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_010531	TG	3	6	1302015	1302020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_010531	GAG	2	6	1302071	1302076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_010531	GTC	2	6	1302080	1302085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_010531	AGG	2	6	1302154	1302159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_010531	CT	3	6	1302170	1302175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_010531	GAA	2	6	1302205	1302210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_010531	AGT	2	6	1302244	1302249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5557	NC_010531	GTG	2	6	1302372	1302377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_010531	TGA	2	6	1302435	1302440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5560	NC_010531	ATG	2	6	1302506	1302511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_010531	TGA	2	6	1302599	1302604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_010531	GGT	2	6	1302615	1302620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_010531	TGC	2	6	1302629	1302634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_010531	CAT	2	6	1302635	1302640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_010531	ATT	2	6	1302651	1302656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_010531	CTG	2	6	1302658	1302663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5568	NC_010531	AGA	2	6	1302701	1302706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_010531	TGC	2	6	1302734	1302739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_010531	AGA	2	6	1302773	1302778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_010531	GAA	2	6	1302786	1302791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_010531	TAC	2	6	1302927	1302932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5574	NC_010531	ACT	2	6	1302971	1302976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5579	NC_010531	A	7	7	1304382	1304388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5583	NC_010531	AG	3	6	1304477	1304482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_010531	TTGG	2	8	1304501	1304508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_010531	AG	3	6	1304546	1304551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5594	NC_010531	TTTG	2	8	1311551	1311558	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5596	NC_010531	A	6	6	1317904	1317909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_010531	TGA	2	6	1317949	1317954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_010531	GTAT	2	8	1319176	1319183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_010531	AT	3	6	1319182	1319187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_010531	TA	4	8	1319199	1319206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_010531	T	6	6	1319218	1319223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_010531	TA	3	6	1320759	1320764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_010531	T	6	6	1322184	1322189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_010531	CCA	2	6	1322269	1322274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5609	NC_010531	TCT	2	6	1324962	1324967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_010531	TAAA	2	8	1324993	1325000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_010531	TA	3	6	1325002	1325007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_010531	TAA	2	6	1325057	1325062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_010531	TA	3	6	1325100	1325105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_010531	ATC	2	6	1325134	1325139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_010531	T	6	6	1325145	1325150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_010531	TTCA	2	8	1326529	1326536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5617	NC_010531	GAA	2	6	1326537	1326542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_010531	T	7	7	1326648	1326654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_010531	AAT	2	6	1326656	1326661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_010531	GAA	2	6	1326693	1326698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5622	NC_010531	TAGT	2	8	1326764	1326771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_010531	GAAAA	2	10	1326795	1326804	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_010531	A	6	6	1326801	1326806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_010531	AAATGC	2	12	1326861	1326872	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5626	NC_010531	CAA	2	6	1326893	1326898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_010531	AATA	2	8	1326921	1326928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_010531	GTT	2	6	1326948	1326953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_010531	CTAC	2	8	1326967	1326974	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5630	NC_010531	TCAT	2	8	1327002	1327009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5631	NC_010531	TTGA	2	8	1327111	1327118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_010531	ATTG	2	8	1327329	1327336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5633	NC_010531	GAA	2	6	1327372	1327377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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