MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1 chromosome

Total Repeats: 6538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010531	CGCT	2	8	1161179	1161186	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_010531	TTA	2	6	1161245	1161250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_010531	GGC	2	6	1161261	1161266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_010531	GAT	2	6	1161267	1161272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_010531	ATT	2	6	1161312	1161317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_010531	GTTCT	2	10	1161390	1161399	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5007	NC_010531	ACT	2	6	1161421	1161426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_010531	TGG	2	6	1161469	1161474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_010531	TACATG	2	12	1161477	1161488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5010	NC_010531	TCA	2	6	1161537	1161542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_010531	CTT	2	6	1161574	1161579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_010531	ACTGTT	2	12	1161716	1161727	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5013	NC_010531	AGC	2	6	1161736	1161741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_010531	TGC	2	6	1161775	1161780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_010531	CGG	2	6	1161781	1161786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_010531	GCA	2	6	1161794	1161799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_010531	GGC	2	6	1161800	1161805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_010531	ATC	2	6	1161815	1161820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_010531	CCA	2	6	1161824	1161829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_010531	T	6	6	1161918	1161923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_010531	CTG	2	6	1161993	1161998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_010531	TCG	2	6	1162055	1162060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_010531	ATG	2	6	1162087	1162092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_010531	GTT	2	6	1162111	1162116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_010531	GCC	2	6	1162147	1162152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_010531	TAA	2	6	1162370	1162375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_010531	ATT	2	6	1162438	1162443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_010531	GCG	2	6	1162456	1162461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_010531	TGC	2	6	1162494	1162499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_010531	TCT	2	6	1162511	1162516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_010531	TCC	2	6	1162542	1162547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_010531	ACT	2	6	1162603	1162608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_010531	TGTT	2	8	1162655	1162662	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_010531	TTA	2	6	1162684	1162689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_010531	GC	3	6	1162706	1162711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_010531	GCAG	2	8	1162716	1162723	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_010531	TCT	2	6	1162973	1162978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_010531	AGT	2	6	1163021	1163026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_010531	TCA	2	6	1163095	1163100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_010531	GTT	2	6	1163159	1163164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_010531	AATC	2	8	1163169	1163176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_010531	GCT	2	6	1163236	1163241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_010531	TGCA	2	8	1163250	1163257	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_010531	CCA	2	6	1163335	1163340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_010531	CCA	2	6	1163374	1163379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_010531	CT	3	6	1163391	1163396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_010531	AACGCC	2	12	1163399	1163410	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_010531	CATT	2	8	1163435	1163442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_010531	GCA	2	6	1163461	1163466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_010531	AATC	2	8	1163471	1163478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_010531	TTC	2	6	1163496	1163501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_010531	GCG	2	6	1163529	1163534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_010531	ATT	2	6	1163571	1163576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_010531	AGC	2	6	1163590	1163595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_010531	CAT	2	6	1163597	1163602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_010531	GA	3	6	1163648	1163653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_010531	T	6	6	1163692	1163697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_010531	TCCA	2	8	1163740	1163747	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_010531	TAG	2	6	1163750	1163755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_010531	CCG	2	6	1163756	1163761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_010531	ATC	2	6	1163782	1163787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_010531	TCCA	2	8	1163913	1163920	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_010531	AAT	2	6	1163967	1163972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_010531	CTT	2	6	1163986	1163991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_010531	A	6	6	1163996	1164001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_010531	AAT	2	6	1164047	1164052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_010531	TCCC	2	8	1164262	1164269	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5068	NC_010531	AGC	2	6	1164275	1164280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_010531	GAATG	2	10	1164299	1164308	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_010531	AG	3	6	1164381	1164386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_010531	GCCC	2	8	1164388	1164395	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5072	NC_010531	A	6	6	1164445	1164450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_010531	CCT	2	6	1164451	1164456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_010531	ACT	2	6	1164482	1164487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_010531	A	7	7	1164554	1164560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_010531	A	6	6	1164606	1164611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_010531	GCAT	2	8	1164644	1164651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5078	NC_010531	AGG	2	6	1164679	1164684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_010531	GAT	2	6	1164699	1164704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_010531	GCA	2	6	1164801	1164806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_010531	CTT	2	6	1164820	1164825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_010531	CCA	2	6	1164843	1164848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_010531	ACCAG	2	10	1164956	1164965	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5084	NC_010531	TGC	2	6	1164980	1164985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_010531	AT	4	8	1164994	1165001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_010531	ATT	2	6	1165018	1165023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_010531	A	6	6	1165043	1165048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_010531	CTG	2	6	1165064	1165069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_010531	ATT	2	6	1165082	1165087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_010531	A	6	6	1166526	1166531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_010531	GAA	2	6	1166559	1166564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_010531	ACT	2	6	1167030	1167035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_010531	CAT	2	6	1167049	1167054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_010531	TTA	2	6	1167060	1167065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_010531	A	8	8	1169866	1169873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_010531	GAT	2	6	1169885	1169890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_010531	CTC	2	6	1169911	1169916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_010531	ATTA	2	8	1175918	1175925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_010531	GTC	2	6	1175936	1175941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_010531	TA	3	6	1176012	1176017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_010531	TGC	2	6	1178679	1178684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_010531	ACG	2	6	1178732	1178737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_010531	CCACG	2	10	1178755	1178764	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5104	NC_010531	CTC	2	6	1178803	1178808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_010531	GGT	2	6	1178815	1178820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_010531	CAC	2	6	1178824	1178829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_010531	AGCA	2	8	1178835	1178842	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_010531	G	6	6	1178857	1178862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_010531	GTA	2	6	1178895	1178900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_010531	ACT	2	6	1178948	1178953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_010531	A	6	6	1178954	1178959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_010531	A	6	6	1178978	1178983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_010531	CTG	2	6	1179003	1179008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_010531	GCC	2	6	1179141	1179146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_010531	A	6	6	1180312	1180317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_010531	GAA	2	6	1180346	1180351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_010531	GCT	2	6	1180476	1180481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_010531	AC	3	6	1180555	1180560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_010531	CT	3	6	1180607	1180612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_010531	AACC	2	8	1180683	1180690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_010531	CAA	2	6	1180777	1180782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_010531	CCA	2	6	1180804	1180809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_010531	GCT	2	6	1180855	1180860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_010531	CAC	2	6	1181020	1181025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_010531	GCA	2	6	1181052	1181057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_010531	T	7	7	1181082	1181088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_010531	TAC	2	6	1181141	1181146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_010531	AAG	2	6	1181162	1181167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_010531	TAAT	2	8	1181209	1181216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_010531	ATC	2	6	1181294	1181299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5133	NC_010531	GTCA	2	8	1181648	1181655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5146	NC_010531	GGAT	2	8	1184532	1184539	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5255	NC_010531	CCTAAC	2	12	1206373	1206384	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5257	NC_010531	TTA	2	6	1206491	1206496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5392	NC_010531	GCA	2	6	1250148	1250153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5393	NC_010531	GCC	2	6	1250245	1250250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5394	NC_010531	ATC	2	6	1250350	1250355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5395	NC_010531	TGA	2	6	1250378	1250383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5396	NC_010531	TGC	2	6	1250435	1250440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5397	NC_010531	TGA	2	6	1250456	1250461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_010531	CTG	2	6	1250463	1250468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5399	NC_010531	AAG	2	6	1250469	1250474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5400	NC_010531	ATTG	2	8	1250494	1250501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5401	NC_010531	A	7	7	1250511	1250517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5402	NC_010531	GCG	2	6	1250531	1250536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5442	NC_010531	T	6	6	1254344	1254349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5453	NC_010531	A	6	6	1258347	1258352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5462	NC_010531	TGA	2	6	1258661	1258666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5469	NC_010531	TATT	2	8	1264158	1264165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5470	NC_010531	ATT	2	6	1264169	1264174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5478	NC_010531	A	7	7	1267906	1267912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5485	NC_010531	TCAA	2	8	1269500	1269507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5493	NC_010531	A	6	6	1271427	1271432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_010531	CCGA	2	8	1271439	1271446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5498	NC_010531	GTT	2	6	1274489	1274494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5499	NC_010531	A	6	6	1276631	1276636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_010531	GTA	2	6	1277680	1277685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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