MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Parvibaculum lavamentivorans DS-1 chromosome

Total Repeats: 7992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009719	TTG	2	6	29	34	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009719	AGG	2	6	43	48	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009719	TTC	2	6	104	109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009719	CCG	2	6	120	125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009719	ATAA	2	8	466	473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009719	CGA	2	6	488	493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009719	GCG	2	6	587	592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009719	CG	3	6	591	596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009719	AAG	2	6	614	619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009719	GC	3	6	638	643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009719	ATGT	2	8	649	656	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009719	CAT	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009719	TTC	2	6	735	740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009719	GCTT	2	8	742	749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009719	AAC	2	6	774	779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009719	GGA	2	6	783	788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009719	T	6	6	805	810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009719	TCC	2	6	846	851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_009719	CAGA	2	8	871	878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009719	TTA	2	6	908	913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009719	GCA	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009719	CGG	3	9	947	955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009719	GGGC	2	8	1474	1481	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009719	CGG	2	6	1498	1503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009719	ACGG	2	8	1505	1512	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009719	CGGG	2	8	3181	3188	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009719	CG	3	6	3223	3228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009719	GCC	2	6	3274	3279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009719	GC	3	6	3375	3380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009719	GCC	2	6	3471	3476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_009719	GCC	2	6	3485	3490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009719	GCAA	2	8	3491	3498	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009719	AG	3	6	3516	3521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009719	AGA	2	6	4663	4668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009719	A	6	6	6531	6536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009719	GC	3	6	9105	9110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009719	GAC	2	6	13502	13507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009719	A	6	6	13530	13535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009719	GCG	2	6	15276	15281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009719	CAA	2	6	15282	15287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009719	T	6	6	15324	15329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009719	GAG	2	6	15352	15357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009719	GAC	2	6	15426	15431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009719	AACGG	2	10	17170	17179	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009719	CG	3	6	17180	17185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009719	GC	3	6	17272	17277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009719	GAA	2	6	17281	17286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009719	GCG	2	6	17396	17401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009719	TCCG	2	8	18063	18070	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009719	GC	3	6	18071	18076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009719	CG	3	6	18087	18092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009719	G	6	6	18120	18125	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009719	TGTC	2	8	18150	18157	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009719	GGC	2	6	18210	18215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009719	CG	3	6	18804	18809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009719	TTG	2	6	18840	18845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009719	CAGG	2	8	18890	18897	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009719	GC	3	6	20036	20041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009719	GGC	2	6	20049	20054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009719	GA	3	6	20056	20061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009719	TC	3	6	25366	25371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009719	CGG	2	6	25391	25396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009719	CAA	2	6	25444	25449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009719	CGC	2	6	25518	25523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009719	CGC	2	6	25536	25541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009719	GCC	2	6	25591	25596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009719	A	6	6	26971	26976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009719	AAC	2	6	27029	27034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009719	A	6	6	27111	27116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009719	GGA	2	6	27120	27125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009719	CCG	2	6	28407	28412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_009719	GCCGG	2	10	28439	28448	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_009719	AAC	2	6	29904	29909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009719	GAT	2	6	29981	29986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009719	CG	3	6	30000	30005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009719	GCG	2	6	30014	30019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009719	AGGG	2	8	30041	30048	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009719	AACG	2	8	30066	30073	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009719	GGT	2	6	30124	30129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009719	GGC	2	6	30157	30162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009719	TCC	2	6	30165	30170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009719	AGA	2	6	30171	30176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009719	CGG	2	6	30239	30244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009719	GCG	2	6	30286	30291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009719	CAGA	2	8	32677	32684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009719	GCC	2	6	32692	32697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009719	CGG	2	6	32705	32710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009719	T	6	6	32713	32718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009719	CGC	2	6	32726	32731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009719	CTC	2	6	34884	34889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_009719	GAA	2	6	34902	34907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009719	CGCC	2	8	35619	35626	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_009719	GCGG	2	8	35637	35644	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009719	TGA	2	6	37378	37383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009719	GCC	2	6	37387	37392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009719	C	6	6	37462	37467	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_009719	CCG	2	6	37473	37478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_009719	TG	3	6	37534	37539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009719	GGC	2	6	38933	38938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009719	T	6	6	38950	38955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009719	GCC	2	6	39038	39043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009719	GCC	2	6	39059	39064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_009719	GAC	2	6	39104	39109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009719	CGA	2	6	39154	39159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009719	ACA	2	6	39167	39172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009719	GGA	2	6	39173	39178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009719	GGC	2	6	41217	41222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009719	GGC	2	6	41245	41250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009719	GCC	3	9	41957	41965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009719	CAG	2	6	41996	42001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009719	GCC	2	6	42913	42918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009719	CG	3	6	42919	42924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009719	CCT	2	6	42932	42937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_009719	GAG	2	6	42946	42951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009719	AAGC	2	8	45357	45364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009719	AGCGT	2	10	45374	45383	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009719	GCC	2	6	45389	45394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009719	CGC	2	6	47520	47525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_009719	GAAAAA	2	12	47617	47628	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009719	GC	3	6	47659	47664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009719	GAG	2	6	47682	47687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009719	TCCCC	2	10	49036	49045	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
123	NC_009719	GGGGA	2	10	49066	49075	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009719	CCT	2	6	49144	49149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_009719	TTG	2	6	50205	50210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009719	TCC	2	6	50236	50241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009719	C	6	6	51094	51099	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_009719	TG	3	6	51122	51127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009719	TGC	2	6	51132	51137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009719	CGCGC	2	10	51159	51168	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_009719	CGA	2	6	52774	52779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009719	CGC	2	6	52780	52785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_009719	C	6	6	52791	52796	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
134	NC_009719	GC	3	6	52874	52879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009719	CCG	2	6	52890	52895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_009719	GTT	2	6	52913	52918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009719	A	6	6	52919	52924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009719	TCC	2	6	54286	54291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_009719	GCG	2	6	54416	54421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009719	GA	3	6	54456	54461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009719	GCT	2	6	55289	55294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009719	T	6	6	55310	55315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009719	ATG	2	6	55360	55365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009719	G	6	6	55411	55416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009719	GA	3	6	55459	55464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009719	CAT	3	9	55468	55476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009719	CCT	2	6	55518	55523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_009719	AAAT	2	8	55528	55535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009719	G	6	6	57357	57362	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_009719	CTGC	2	8	132880	132887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
433	NC_009719	TA	3	6	132892	132897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_009719	AGG	2	6	132930	132935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_009719	TTC	2	6	132981	132986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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444	NC_009719	G	6	6	134734	134739	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_009719	CGCGG	2	10	135489	135498	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
451	NC_009719	AACG	2	8	135503	135510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_009719	GACT	2	8	135575	135582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
453	NC_009719	CGCCC	2	10	135620	135629	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
454	NC_009719	GA	3	6	136127	136132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
455	NC_009719	CTC	2	6	138863	138868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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457	NC_009719	TCT	2	6	139266	139271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
458	NC_009719	GCC	2	6	139284	139289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
459	NC_009719	GTT	2	6	140543	140548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_009719	T	6	6	140687	140692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_009719	TAC	2	6	140702	140707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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464	NC_009719	A	6	6	140795	140800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_009719	CGC	2	6	140920	140925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
469	NC_009719	CGA	2	6	140977	140982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_009719	GCC	2	6	141032	141037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
471	NC_009719	A	6	6	141056	141061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_009719	TCT	2	6	141100	141105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_009719	ATC	2	6	141114	141119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
474	NC_009719	TCA	2	6	141151	141156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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476	NC_009719	CTT	2	6	141217	141222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
477	NC_009719	ACCA	2	8	141228	141235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
478	NC_009719	CGC	2	6	141245	141250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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487	NC_009719	TTG	2	6	147054	147059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
488	NC_009719	GGC	2	6	155968	155973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_009719	GAA	2	6	155981	155986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
490	NC_009719	T	6	6	156357	156362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_009719	TC	4	8	160680	160687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
492	NC_009719	GCG	2	6	162434	162439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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494	NC_009719	CGA	2	6	163845	163850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
495	NC_009719	AAC	2	6	165766	165771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
496	NC_009719	CG	3	6	165785	165790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
497	NC_009719	CAG	2	6	165826	165831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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