MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 11844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009512	A	6	6	487885	487890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009512	TGC	2	6	489963	489968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_009512	TG	3	6	489988	489993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_009512	TCG	2	6	489995	490000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_009512	AGG	2	6	490051	490056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009512	CAGG	2	8	490073	490080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_009512	ATG	2	6	490087	490092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009512	AGCT	2	8	490123	490130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_009512	GGGCA	2	10	490174	490183	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_009512	GA	3	6	492304	492309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_009512	TG	3	6	493207	493212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009512	GGC	2	6	493248	493253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_009512	CAG	2	6	493284	493289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_009512	TG	3	6	493346	493351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009512	CGG	2	6	494536	494541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_009512	AAGA	2	8	497455	497462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009512	CCG	2	6	497470	497475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_009512	GCA	2	6	497494	497499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_009512	CTCG	2	8	499478	499485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_009512	GAC	2	6	499495	499500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_009512	TCAG	2	8	499507	499514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_009512	C	6	6	499555	499560	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1023	NC_009512	CG	3	6	499717	499722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_009512	A	6	6	499746	499751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009512	TAC	2	6	500088	500093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_009512	AAT	2	6	501371	501376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009512	G	6	6	501396	501401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009512	G	8	8	501424	501431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009512	TGT	2	6	501432	501437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009512	GCCG	2	8	501442	501449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_009512	TTA	2	6	507438	507443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009512	ATA	2	6	507517	507522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009512	TGC	2	6	511109	511114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_009512	GCCTG	2	10	514237	514246	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1035	NC_009512	ACA	2	6	514356	514361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_009512	GAT	2	6	514375	514380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_009512	TC	3	6	514386	514391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_009512	TCT	2	6	514421	514426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_009512	CAA	2	6	514450	514455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_009512	ATA	2	6	515627	515632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009512	GT	3	6	516675	516680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009512	GC	3	6	518930	518935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_009512	CCGT	2	8	520478	520485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_009512	TGC	2	6	520499	520504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_009512	ATTG	2	8	522004	522011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009512	GCT	2	6	522014	522019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_009512	GGGCC	2	10	522086	522095	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1048	NC_009512	GCC	3	9	522128	522136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_009512	CGT	2	6	522197	522202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_009512	CGTTGG	2	12	524351	524362	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1051	NC_009512	GCCC	2	8	524387	524394	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1052	NC_009512	GCCC	2	8	524396	524403	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1053	NC_009512	T	6	6	527017	527022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009512	GCCC	2	8	527051	527058	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1055	NC_009512	TGT	2	6	527077	527082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009512	CAT	2	6	527120	527125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_009512	GGCT	2	8	528523	528530	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_009512	GTA	2	6	528586	528591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009512	GCG	2	6	530913	530918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_009512	GGAG	2	8	533599	533606	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009512	GTC	2	6	533625	533630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_009512	TAG	2	6	533634	533639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009512	GTT	2	6	533670	533675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_009512	TAT	2	6	533694	533699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009512	CCA	2	6	534778	534783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_009512	CGT	2	6	534801	534806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_009512	CGC	2	6	535292	535297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_009512	GCG	2	6	535306	535311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_009512	ATGA	2	8	537886	537893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_009512	ATG	2	6	537895	537900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009512	CGC	2	6	537959	537964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_009512	TA	3	6	539281	539286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_009512	AGT	2	6	539438	539443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_009512	TGG	2	6	539495	539500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_009512	GA	3	6	539543	539548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_009512	A	6	6	539590	539595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009512	GC	3	6	539639	539644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_009512	GGC	2	6	539874	539879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_009512	GCG	2	6	539932	539937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_009512	TGG	2	6	540083	540088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009512	CGA	2	6	540107	540112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_009512	GAT	2	6	540132	540137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_009512	GCA	2	6	540181	540186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_009512	GT	3	6	540234	540239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_009512	GAA	2	6	540240	540245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_009512	GGA	2	6	540276	540281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_009512	CAG	2	6	540349	540354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_009512	GC	3	6	540405	540410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_009512	GGT	2	6	540414	540419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009512	GTG	2	6	540498	540503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_009512	AGGA	2	8	540538	540545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009512	ACC	2	6	540564	540569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_009512	GAA	2	6	540803	540808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_009512	TGC	2	6	540879	540884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_009512	GTC	2	6	540891	540896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_009512	TCGTG	2	10	540900	540909	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1097	NC_009512	TGG	2	6	540969	540974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009512	GGA	2	6	541005	541010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009512	TCA	2	6	541030	541035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_009512	AC	3	6	541056	541061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_009512	AC	3	6	541225	541230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_009512	G	6	6	541284	541289	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009512	CCT	2	6	541366	541371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_009512	CGA	2	6	541376	541381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_009512	CTG	2	6	541389	541394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_009512	TA	3	6	541446	541451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_009512	GCCT	2	8	541559	541566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_009512	AGG	2	6	541574	541579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_009512	CCA	2	6	541604	541609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_009512	GATA	2	8	541704	541711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_009512	CTG	2	6	541732	541737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_009512	GTC	2	6	541805	541810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_009512	GAA	2	6	541852	541857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009512	CAGC	2	8	541973	541980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_009512	TAG	2	6	542083	542088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009512	GCGA	2	8	542091	542098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_009512	G	6	6	542240	542245	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009512	TCC	2	6	542250	542255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_009512	TAC	2	6	542265	542270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_009512	TGAC	2	8	542271	542278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_009512	ACTG	2	8	542552	542559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_009512	ACCGA	2	10	542564	542573	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1123	NC_009512	AC	3	6	542777	542782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_009512	CGTC	2	8	542795	542802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_009512	AAC	2	6	542814	542819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_009512	AGG	2	6	542888	542893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_009512	AGC	2	6	542904	542909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_009512	AAAG	2	8	542918	542925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_009512	AGTCG	2	10	542940	542949	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1130	NC_009512	ATC	2	6	543001	543006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_009512	ATG	3	9	543009	543017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009512	GTTG	2	8	543285	543292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_009512	GGT	2	6	543304	543309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_009512	TGA	2	6	543353	543358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_009512	CGA	2	6	543374	543379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_009512	GGT	2	6	543454	543459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_009512	GA	3	6	543484	543489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_009512	TTA	2	6	543610	543615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1140	NC_009512	GGC	2	6	543815	543820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1154	NC_009512	TGG	2	6	544768	544773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1157	NC_009512	ATCCC	2	10	544910	544919	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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1161	NC_009512	TC	3	6	545099	545104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1166	NC_009512	A	6	6	547411	547416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1252	NC_009512	GAT	2	6	603896	603901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1254	NC_009512	A	6	6	603916	603921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1256	NC_009512	ATG	2	6	604065	604070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_009512	GGC	2	6	604154	604159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1262	NC_009512	ACA	2	6	604390	604395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_009512	CCG	3	9	604416	604424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1264	NC_009512	A	6	6	604436	604441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_009512	CAG	2	6	604531	604536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_009512	TGAA	2	8	604642	604649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_009512	TCTG	2	8	604772	604779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1268	NC_009512	T	6	6	604875	604880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_009512	TCA	2	6	604882	604887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1404	NC_009512	TGA	2	6	673771	673776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_009512	AGTG	2	8	673936	673943	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_009512	ATG	2	6	675342	675347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_009512	CGTG	2	8	675372	675379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1412	NC_009512	CAA	2	6	675392	675397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_009512	CTGA	2	8	675423	675430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1430	NC_009512	TGC	2	6	682203	682208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_009512	GCT	2	6	687242	687247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1435	NC_009512	GTC	2	6	687622	687627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1443	NC_009512	TGCA	2	8	693500	693507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1452	NC_009512	TGGT	2	8	702488	702495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1456	NC_009512	AGG	2	6	705925	705930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1475	NC_009512	CAGG	2	8	710851	710858	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1492	NC_009512	GC	4	8	716454	716461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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