MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 11844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009512	GC	3	6	229993	229998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_009512	TGC	2	6	230016	230021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_009512	CAA	2	6	230029	230034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_009512	GC	3	6	230564	230569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_009512	CCG	2	6	234380	234385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_009512	GTTC	2	8	235078	235085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
507	NC_009512	TCA	2	6	235124	235129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_009512	CGT	2	6	235151	235156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_009512	TC	3	6	235972	235977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_009512	TGC	2	6	235981	235986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_009512	TG	3	6	236024	236029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009512	GC	3	6	236046	236051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_009512	AAC	2	6	236071	236076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_009512	GAC	2	6	236108	236113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_009512	A	6	6	241290	241295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_009512	GGAT	2	8	244978	244985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009512	GGC	2	6	245007	245012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_009512	CGG	2	6	248405	248410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_009512	GGAT	2	8	250176	250183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009512	TTC	2	6	252603	252608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_009512	CCT	2	6	252614	252619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_009512	ACT	2	6	252714	252719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009512	TG	3	6	253322	253327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009512	GCA	2	6	253344	253349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_009512	CG	3	6	253350	253355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_009512	AAT	2	6	253358	253363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009512	AAC	2	6	253386	253391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_009512	CTG	2	6	253406	253411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_009512	TGC	2	6	253424	253429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_009512	GTG	2	6	253436	253441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_009512	AAC	2	6	254664	254669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_009512	GCG	2	6	254719	254724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_009512	AGC	2	6	254727	254732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_009512	AGG	2	6	254766	254771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009512	CA	3	6	258918	258923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_009512	T	6	6	258947	258952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009512	CAA	2	6	258979	258984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_009512	CGAG	2	8	258990	258997	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
539	NC_009512	GT	3	6	258998	259003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009512	GTC	2	6	261790	261795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_009512	ACC	2	6	261831	261836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_009512	G	6	6	261862	261867	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009512	CAGG	2	8	262362	262369	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
544	NC_009512	CGT	2	6	262370	262375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_009512	AGG	2	6	262396	262401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_009512	A	6	6	263818	263823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009512	CGG	2	6	265873	265878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_009512	CGCA	2	8	265945	265952	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
549	NC_009512	CAT	2	6	266132	266137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_009512	GT	3	6	266158	266163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009512	GCA	2	6	266221	266226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_009512	T	7	7	266289	266295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009512	CAG	2	6	266320	266325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009512	CAA	2	6	266382	266387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_009512	CAA	2	6	266389	266394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_009512	T	6	6	267910	267915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009512	TGG	2	6	267929	267934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009512	GCC	2	6	267986	267991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_009512	A	6	6	269327	269332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_009512	CGG	2	6	269340	269345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_009512	T	7	7	269347	269353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009512	GGA	2	6	269388	269393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009512	TG	3	6	269418	269423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009512	AGT	2	6	269438	269443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009512	GCC	2	6	270802	270807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_009512	CGG	2	6	271933	271938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_009512	AGG	2	6	273204	273209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009512	AGC	2	6	275179	275184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_009512	GCA	2	6	280416	280421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_009512	GCA	2	6	280431	280436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_009512	TG	3	6	281796	281801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009512	GGT	2	6	281809	281814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009512	TA	3	6	281821	281826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009512	AACT	2	8	281853	281860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
575	NC_009512	TTG	2	6	284234	284239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009512	A	6	6	284293	284298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009512	T	6	6	284314	284319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009512	GCTG	2	8	284334	284341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
579	NC_009512	CGA	2	6	284355	284360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_009512	GTT	2	6	284415	284420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009512	T	6	6	284419	284424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_009512	GCA	2	6	284455	284460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_009512	CAA	2	6	284489	284494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_009512	CAG	2	6	285461	285466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_009512	GAC	2	6	285564	285569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_009512	AGG	2	6	285664	285669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_009512	CGA	2	6	285711	285716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_009512	TCCTG	2	10	287741	287750	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
589	NC_009512	GGCAC	2	10	287780	287789	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
590	NC_009512	TG	3	6	287803	287808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009512	ATAA	2	8	291415	291422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009512	T	6	6	291424	291429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_009512	TTA	2	6	291596	291601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009512	AT	3	6	291642	291647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009512	AAAG	2	8	293218	293225	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009512	T	6	6	293244	293249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009512	TAAA	2	8	293280	293287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_009512	TTAT	2	8	293291	293298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_009512	TTTTTA	2	12	293301	293312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_009512	CCCAG	2	10	293350	293359	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
601	NC_009512	T	6	6	294071	294076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009512	A	6	6	294085	294090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009512	GC	3	6	294103	294108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_009512	GAG	2	6	294113	294118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_009512	AAT	2	6	294137	294142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009512	A	6	6	294157	294162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_009512	AT	3	6	294175	294180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009512	AGC	2	6	294183	294188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_009512	TCC	2	6	294199	294204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_009512	GCA	2	6	294223	294228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_009512	CAC	2	6	294839	294844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_009512	GAG	2	6	295918	295923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_009512	GCG	2	6	298943	298948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_009512	GCT	2	6	298962	298967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_009512	GC	3	6	299023	299028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
616	NC_009512	GCC	2	6	299061	299066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_009512	GAA	2	6	301358	301363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_009512	CAG	2	6	301398	301403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_009512	CTG	2	6	301414	301419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_009512	ACC	2	6	304159	304164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_009512	CGG	2	6	304206	304211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_009512	GCA	2	6	304324	304329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_009512	GCG	2	6	304348	304353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_009512	GTA	2	6	307991	307996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_009512	GCT	2	6	308438	308443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_009512	TCA	2	6	309348	309353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_009512	T	6	6	309354	309359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_009512	AGG	2	6	310330	310335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_009512	T	7	7	310343	310349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_009512	T	6	6	310376	310381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_009512	GTA	2	6	310386	310391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_009512	T	6	6	310393	310398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_009512	GCC	2	6	312020	312025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_009512	T	6	6	312038	312043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_009512	CTG	2	6	312077	312082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_009512	GCC	2	6	312113	312118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_009512	TGG	2	6	312156	312161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_009512	AGCC	2	8	312267	312274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
639	NC_009512	GGGGC	2	10	312734	312743	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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662	NC_009512	TTGC	2	8	329592	329599	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
663	NC_009512	TGCAG	2	10	329710	329719	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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689	NC_009512	G	6	6	339352	339357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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704	NC_009512	GC	3	6	343161	343166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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