MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 11844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009512	CAC	2	6	2978227	2978232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_009512	ACT	2	6	2978247	2978252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_009512	TTC	2	6	2978264	2978269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_009512	CGA	2	6	2978290	2978295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_009512	ATT	2	6	2978297	2978302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_009512	A	6	6	2986233	2986238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_009512	GC	3	6	2988777	2988782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_009512	CG	3	6	2988787	2988792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_009512	CTGC	2	8	2988812	2988819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_009512	GAAAG	2	10	2988821	2988830	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_009512	CAT	2	6	2988834	2988839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_009512	AAAT	2	8	2988846	2988853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_009512	CAGG	2	8	2988880	2988887	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_009512	CTGTC	2	10	2988919	2988928	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6015	NC_009512	GCA	2	6	2989049	2989054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_009512	TCA	2	6	2989121	2989126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_009512	GCCA	2	8	2989243	2989250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_009512	TCG	2	6	2989375	2989380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_009512	ACC	2	6	2989410	2989415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_009512	CGC	2	6	2989447	2989452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_009512	CGT	2	6	2989464	2989469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_009512	ATC	2	6	2989480	2989485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_009512	TGT	2	6	2989554	2989559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_009512	TGAA	2	8	2990163	2990170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_009512	GGC	2	6	2990216	2990221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_009512	GCTA	2	8	2990299	2990306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6027	NC_009512	CCG	2	6	2990332	2990337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_009512	CGA	2	6	2990342	2990347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_009512	CAT	2	6	2990363	2990368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_009512	ACCCC	2	10	2990380	2990389	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6031	NC_009512	GCAC	2	8	2990393	2990400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_009512	CGGC	2	8	2990402	2990409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_009512	A	7	7	2990439	2990445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_009512	ATT	2	6	2990552	2990557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_009512	A	6	6	2990579	2990584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_009512	C	6	6	2990588	2990593	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6037	NC_009512	CTT	2	6	2990603	2990608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_009512	GCCAC	2	10	3009613	3009622	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6039	NC_009512	GCG	2	6	3009661	3009666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_009512	TGT	2	6	3009733	3009738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_009512	CGG	2	6	3010300	3010305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_009512	GC	3	6	3010319	3010324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_009512	GC	3	6	3010336	3010341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_009512	C	7	7	3014162	3014168	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6045	NC_009512	AGC	2	6	3014189	3014194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_009512	TAAAG	2	10	3014207	3014216	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_009512	CGT	2	6	3017033	3017038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_009512	GCC	2	6	3017050	3017055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_009512	TCG	2	6	3017732	3017737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_009512	G	6	6	3018622	3018627	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_009512	CCTT	2	8	3018628	3018635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_009512	CGCA	2	8	3018688	3018695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_009512	GCC	2	6	3018699	3018704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_009512	GCG	2	6	3018749	3018754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_009512	TCG	2	6	3018757	3018762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_009512	CCCG	2	8	3018909	3018916	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6057	NC_009512	GC	3	6	3019003	3019008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_009512	TCG	2	6	3020355	3020360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_009512	GCCA	2	8	3020386	3020393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_009512	GACTA	2	10	3020748	3020757	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6061	NC_009512	CAGT	2	8	3021341	3021348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6062	NC_009512	AAAT	2	8	3021353	3021360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_009512	AC	3	6	3021447	3021452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_009512	ACCC	2	8	3021567	3021574	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6065	NC_009512	GCC	2	6	3021593	3021598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_009512	TTA	2	6	3021709	3021714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_009512	GCCA	2	8	3021759	3021766	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_009512	GCC	2	6	3021767	3021772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_009512	TCT	2	6	3021782	3021787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_009512	GCA	2	6	3021800	3021805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_009512	C	6	6	3023338	3023343	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6072	NC_009512	CCAGA	2	10	3023372	3023381	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6073	NC_009512	TTG	2	6	3023387	3023392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_009512	TGG	2	6	3023435	3023440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_009512	CAGGC	2	10	3027335	3027344	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6076	NC_009512	ACCC	2	8	3028986	3028993	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6077	NC_009512	GGCCTG	2	12	3031174	3031185	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_009512	AGG	2	6	3031214	3031219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_009512	GCC	2	6	3033804	3033809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_009512	CTC	2	6	3034162	3034167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_009512	CAC	2	6	3034191	3034196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_009512	GTG	2	6	3034199	3034204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_009512	ACA	2	6	3037333	3037338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_009512	CAGC	2	8	3037380	3037387	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_009512	GAG	2	6	3037437	3037442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_009512	GCA	2	6	3038305	3038310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_009512	GCC	2	6	3038331	3038336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_009512	TCC	2	6	3039637	3039642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6089	NC_009512	CG	3	6	3039666	3039671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_009512	G	6	6	3039733	3039738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_009512	TGC	2	6	3039744	3039749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_009512	GTA	2	6	3039800	3039805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_009512	ACT	2	6	3042235	3042240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_009512	GCT	2	6	3042331	3042336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_009512	CG	3	6	3042340	3042345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_009512	CAA	2	6	3042363	3042368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_009512	GGC	2	6	3044052	3044057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_009512	TCT	2	6	3048302	3048307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_009512	TATTGT	2	12	3052697	3052708	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_009512	T	6	6	3052708	3052713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_009512	CGC	2	6	3052715	3052720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_009512	C	6	6	3053385	3053390	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6103	NC_009512	TGA	2	6	3053426	3053431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_009512	GCTTT	2	10	3053448	3053457	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6105	NC_009512	TGA	2	6	3053463	3053468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_009512	TGC	3	9	3053529	3053537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_009512	CCT	2	6	3056848	3056853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_009512	GTT	2	6	3056872	3056877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_009512	TGT	2	6	3056880	3056885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_009512	TATTGT	2	12	3058038	3058049	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_009512	CGG	2	6	3058067	3058072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_009512	TC	3	6	3059926	3059931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_009512	ATC	2	6	3059934	3059939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_009512	GAC	2	6	3060011	3060016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_009512	TGA	2	6	3060031	3060036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_009512	CAG	2	6	3060037	3060042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_009512	GCT	2	6	3060086	3060091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_009512	GGC	2	6	3060370	3060375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_009512	CGC	2	6	3060772	3060777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_009512	TGC	2	6	3060799	3060804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_009512	GAC	2	6	3060807	3060812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_009512	CGC	2	6	3060866	3060871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6123	NC_009512	ACATC	2	10	3060892	3060901	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6124	NC_009512	ACA	2	6	3061189	3061194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_009512	GCT	2	6	3061200	3061205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_009512	AC	3	6	3061219	3061224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_009512	ATG	2	6	3061242	3061247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_009512	AG	3	6	3061259	3061264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_009512	TCCA	2	8	3061694	3061701	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_009512	ATT	2	6	3061711	3061716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_009512	CGGG	2	8	3061718	3061725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6132	NC_009512	GCT	2	6	3061746	3061751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_009512	T	6	6	3061774	3061779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_009512	CGG	2	6	3061826	3061831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_009512	ACA	2	6	3062319	3062324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6140	NC_009512	CG	3	6	3062983	3062988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6141	NC_009512	T	8	8	3063033	3063040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6155	NC_009512	TCAG	2	8	3075675	3075682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6247	NC_009512	CTG	2	6	3125083	3125088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6249	NC_009512	T	7	7	3125104	3125110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6251	NC_009512	CAC	2	6	3125144	3125149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6253	NC_009512	CGC	2	6	3125166	3125171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6256	NC_009512	GTT	2	6	3125452	3125457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_009512	GA	3	6	3126648	3126653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_009512	CGT	2	6	3126726	3126731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6395	NC_009512	AGC	2	6	3184218	3184223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6397	NC_009512	CGT	2	6	3186518	3186523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6398	NC_009512	AGC	2	6	3188137	3188142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6399	NC_009512	TAA	2	6	3188171	3188176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6400	NC_009512	TTTG	2	8	3188184	3188191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6401	NC_009512	GC	3	6	3189427	3189432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6412	NC_009512	C	8	8	3193087	3193094	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6434	NC_009512	TTG	2	6	3199193	3199198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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