MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas mendocina ymp chromosome

Total Repeats: 10524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009439	CGC	2	6	52	57	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009439	TCGC	2	8	6242	6249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009439	A	6	6	6453	6458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009439	CGG	2	6	6466	6471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009439	T	6	6	6473	6478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009439	CGG	2	6	6493	6498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009439	GCG	2	6	12259	12264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009439	ACC	2	6	12299	12304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009439	CGT	2	6	12346	12351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009439	TGC	2	6	12407	12412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009439	A	6	6	16811	16816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009439	CCGA	2	8	17039	17046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009439	GCT	2	6	17626	17631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009439	T	6	6	18642	18647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009439	GCA	2	6	18690	18695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009439	GCCA	2	8	18999	19006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009439	CCT	2	6	19034	19039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009439	CGC	2	6	19056	19061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_009439	TCGC	2	8	19093	19100	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009439	CGG	2	6	19136	19141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009439	GCCTC	2	10	19172	19181	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009439	GCC	2	6	19186	19191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009439	ACCC	2	8	19217	19224	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_009439	TCGG	2	8	19247	19254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009439	TCG	2	6	19283	19288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009439	T	6	6	19319	19324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009439	CAG	2	6	19942	19947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009439	TTC	2	6	19957	19962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009439	CCA	2	6	19970	19975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009439	GGC	2	6	20068	20073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009439	GATG	2	8	20080	20087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009439	TGGA	2	8	20092	20099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009439	AGG	2	6	22792	22797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009439	CGCT	2	8	22812	22819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009439	GCG	2	6	22881	22886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009439	GCT	2	6	22909	22914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009439	CAGT	2	8	26267	26274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009439	TGGCG	2	10	26300	26309	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009439	CCTG	2	8	26315	26322	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009439	AGC	2	6	26368	26373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009439	GTG	2	6	26376	26381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009439	TGGC	2	8	26394	26401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009439	CAGG	2	8	26404	26411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009439	CCT	2	6	29673	29678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009439	GCG	2	6	29709	29714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009439	TTG	2	6	30026	30031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009439	GGCA	2	8	30060	30067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009439	GGC	2	6	30088	30093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009439	GCA	2	6	30112	30117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009439	T	6	6	30218	30223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009439	GGCC	2	8	30236	30243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009439	TCG	2	6	30262	30267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009439	CGG	2	6	30275	30280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009439	GC	3	6	31226	31231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009439	TGC	2	6	31271	31276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009439	TG	3	6	31422	31427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009439	CGATTG	2	12	31450	31461	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009439	TTGT	2	8	31481	31488	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009439	GAC	2	6	31524	31529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009439	CGC	2	6	31553	31558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_009439	GCCG	2	8	31566	31573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009439	CAG	2	6	31576	31581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009439	CTC	2	6	32529	32534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_009439	CGA	2	6	32608	32613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009439	TGC	2	6	32690	32695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009439	CT	3	6	32705	32710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009439	TGT	2	6	32742	32747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009439	TTGAA	2	10	32759	32768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009439	GATC	2	8	33310	33317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009439	CT	3	6	33332	33337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009439	GAG	2	6	33384	33389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009439	CGT	2	6	33409	33414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009439	CTG	2	6	33438	33443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009439	TACC	2	8	35490	35497	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009439	GAC	2	6	35561	35566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009439	GTC	2	6	35606	35611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009439	TCC	2	6	35640	35645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009439	GGCT	2	8	35661	35668	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009439	CGA	2	6	35773	35778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009439	GTC	2	6	35795	35800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009439	TCA	2	6	35815	35820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009439	TGAA	2	8	35829	35836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009439	TG	3	6	35967	35972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009439	TTA	2	6	36030	36035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009439	T	7	7	36077	36083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009439	ATC	2	6	36123	36128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009439	TCCA	2	8	36153	36160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009439	CGT	2	6	46599	46604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009439	CAA	2	6	46673	46678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009439	GC	3	6	46690	46695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009439	CG	4	8	47415	47422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009439	CCG	2	6	47776	47781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009439	GCT	2	6	52093	52098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009439	GAT	2	6	52101	52106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009439	CGC	2	6	52131	52136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009439	ATA	2	6	52187	52192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009439	CGA	2	6	53249	53254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009439	CCA	2	6	53291	53296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_009439	GCC	2	6	54473	54478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009439	GTG	2	6	54486	54491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009439	CTGCG	2	10	55064	55073	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_009439	GAT	2	6	55077	55082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009439	CG	3	6	55103	55108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009439	GCC	2	6	56171	56176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_009439	GCG	2	6	56182	56187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009439	CCG	2	6	56216	56221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_009439	TGC	2	6	56252	56257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009439	CCG	2	6	56258	56263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009439	GCC	2	6	56289	56294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009439	TGCGC	2	10	57236	57245	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009439	AG	3	6	57251	57256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009439	CTTC	2	8	57298	57305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009439	GCC	2	6	58156	58161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_009439	TGCGC	2	10	58170	58179	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009439	GCC	2	6	58265	58270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_009439	TAG	2	6	60971	60976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009439	TTGCC	2	10	62539	62548	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009439	ATG	2	6	62551	62556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009439	CATGC	2	10	63583	63592	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_009439	GCGCC	2	10	63610	63619	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_009439	CTG	2	6	63635	63640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009439	TCC	2	6	63658	63663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009439	GTGAA	2	10	63673	63682	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009439	T	6	6	64628	64633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009439	CAG	2	6	65688	65693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009439	T	6	6	65718	65723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009439	CGGT	2	8	65766	65773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009439	TCA	2	6	65784	65789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009439	CTC	2	6	67428	67433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_009439	CGAGC	2	10	67497	67506	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_009439	A	6	6	67521	67526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009439	GTTG	2	8	69620	69627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009439	GGGT	2	8	69661	69668	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009439	TG	3	6	69692	69697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009439	T	6	6	69699	69704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009439	GCCG	2	8	71610	71617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009439	GGT	2	6	71660	71665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009439	GAG	2	6	71696	71701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009439	GGC	2	6	72891	72896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009439	GCCTG	2	10	72898	72907	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_009439	GC	3	6	72941	72946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009439	GTT	3	9	72962	72970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009439	AGTG	2	8	73008	73015	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009439	ATG	3	9	73035	73043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009439	GTG	2	6	73060	73065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_009439	GGA	2	6	73142	73147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_009439	CG	3	6	155332	155337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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424	NC_009439	GGC	2	6	225731	225736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NC_009439	A	6	6	226812	226817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_009439	GCG	2	6	226818	226823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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434	NC_009439	AAT	2	6	230176	230181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_009439	ACGG	2	8	230332	230339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
442	NC_009439	CCG	3	9	230350	230358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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447	NC_009439	CGG	2	6	232236	232241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_009439	GGA	2	6	236276	236281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_009439	GCC	2	6	237109	237114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_009439	CGG	2	6	237332	237337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_009439	CAT	2	6	237503	237508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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464	NC_009439	GCG	2	6	239229	239234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_009439	GGC	2	6	240828	240833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_009439	CG	3	6	244348	244353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
472	NC_009439	GTG	2	6	244765	244770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_009439	CGG	2	6	244935	244940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
477	NC_009439	ATT	2	6	244950	244955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_009439	CGA	2	6	246646	246651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
483	NC_009439	CG	3	6	246682	246687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
484	NC_009439	GCAG	2	8	246721	246728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_009439	CA	3	6	246736	246741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
486	NC_009439	GC	3	6	247955	247960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
487	NC_009439	GC	3	6	247964	247969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_009439	CGA	2	6	248008	248013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_009439	GC	3	6	248021	248026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_009439	CGT	2	6	250477	250482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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