MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514 chromosome

Total Repeats: 6160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009376	TAG	2	6	15	20	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009376	CATA	2	8	4838	4845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009376	TTA	2	6	4856	4861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009376	A	6	6	6646	6651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009376	T	6	6	8227	8232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009376	ACAA	2	8	8282	8289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009376	TA	3	6	8303	8308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009376	AT	3	6	8311	8316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009376	AC	3	6	8339	8344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009376	AT	3	6	8365	8370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009376	CTA	2	6	9513	9518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009376	TAA	2	6	9535	9540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009376	AGA	2	6	9580	9585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009376	ATG	2	6	11989	11994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009376	ATA	2	6	12012	12017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009376	TCA	2	6	12061	12066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009376	T	6	6	14523	14528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009376	TCT	2	6	15833	15838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009376	TGA	2	6	16512	16517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009376	TA	3	6	19297	19302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009376	TGT	2	6	21174	21179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009376	TCT	2	6	21216	21221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009376	TCC	2	6	21232	21237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_009376	GCAAA	2	10	22771	22780	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009376	GAT	3	9	24355	24363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009376	CATG	2	8	24375	24382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009376	GCC	2	6	25981	25986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009376	CCCT	2	8	25990	25997	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_009376	AAATA	2	10	26073	26082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009376	ATC	2	6	26095	26100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009376	CGGC	2	8	26140	26147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009376	GAG	2	6	26150	26155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009376	GTT	2	6	26185	26190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009376	CTAA	2	8	26198	26205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009376	AAAT	2	8	26241	26248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009376	GCC	2	6	26284	26289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009376	TA	3	6	29602	29607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009376	T	6	6	32298	32303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009376	CGG	2	6	32319	32324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009376	TA	3	6	32335	32340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009376	GAA	2	6	32809	32814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009376	TTA	2	6	37833	37838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009376	ACA	2	6	41787	41792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009376	ATAA	2	8	41800	41807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009376	GCG	2	6	41816	41821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009376	CGG	2	6	41828	41833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009376	TTA	2	6	41854	41859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009376	CTGAA	2	10	43787	43796	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009376	GTA	2	6	45175	45180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009376	ACC	2	6	45195	45200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_009376	TAG	2	6	45229	45234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009376	GGT	2	6	45245	45250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009376	TG	3	6	45296	45301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009376	CAT	2	6	45305	45310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009376	ACG	2	6	45360	45365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009376	TAC	2	6	45379	45384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009376	TA	3	6	45474	45479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009376	TA	3	6	45493	45498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009376	TAA	2	6	45541	45546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009376	TTTA	2	8	45547	45554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009376	TA	3	6	45553	45558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009376	TTA	2	6	47218	47223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009376	GTA	2	6	52033	52038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009376	CTAG	2	8	53519	53526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009376	TCTTTT	2	12	53589	53600	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009376	CTT	2	6	53605	53610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009376	TCC	2	6	53611	53616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009376	CCT	2	6	53712	53717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009376	CTC	2	6	53728	53733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009376	CCT	2	6	53763	53768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_009376	GCG	2	6	53786	53791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009376	C	6	6	53809	53814	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_009376	CAC	2	6	53828	53833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009376	CCG	2	6	53852	53857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009376	GCAA	2	8	53899	53906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009376	C	6	6	53997	54002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_009376	CTC	2	6	54098	54103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009376	CCT	2	6	54110	54115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_009376	CT	3	6	54129	54134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009376	CTC	2	6	54214	54219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_009376	CCTCT	2	10	54232	54241	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_009376	GCC	2	6	54256	54261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_009376	CGCCC	2	10	54274	54283	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
84	NC_009376	ATTA	2	8	54357	54364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009376	GA	3	6	54494	54499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009376	GCG	2	6	54984	54989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009376	AAC	2	6	55034	55039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009376	G	6	6	55109	55114	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009376	T	6	6	69067	69072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009376	CCT	2	6	69080	69085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_009376	CTT	2	6	69086	69091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009376	TCT	2	6	71022	71027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009376	AAC	2	6	73273	73278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009376	ACT	2	6	73291	73296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009376	A	6	6	73315	73320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009376	AGA	2	6	74250	74255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009376	AT	4	8	75281	75288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009376	TACG	2	8	76940	76947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009376	TGGA	2	8	78086	78093	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009376	GCG	2	6	78094	78099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009376	AG	3	6	78240	78245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009376	GAC	2	6	78255	78260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009376	CAA	2	6	78277	78282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009376	G	6	6	78377	78382	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009376	AGG	2	6	78390	78395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009376	ACGT	2	8	78488	78495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009376	GC	3	6	78528	78533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009376	CCGG	2	8	78551	78558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009376	CGGC	2	8	78625	78632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009376	ACG	2	6	78747	78752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009376	ATT	2	6	78787	78792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009376	CCCAAT	2	12	79208	79219	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009376	TCGTG	2	10	79223	79232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009376	AAG	2	6	79244	79249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009376	AAG	2	6	79387	79392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009376	TAA	2	6	80810	80815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009376	TA	3	6	80843	80848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009376	CT	3	6	80858	80863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009376	ATT	2	6	80869	80874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009376	ATA	2	6	80912	80917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009376	GAA	2	6	80966	80971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009376	GAA	2	6	80975	80980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009376	GGA	2	6	80981	80986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009376	GAA	2	6	80987	80992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009376	AGA	2	6	80993	80998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009376	CCTC	2	8	81039	81046	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_009376	GTA	2	6	82374	82379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009376	TGA	2	6	83175	83180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009376	AG	3	6	83181	83186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009376	T	6	6	84607	84612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009376	GTA	2	6	85180	85185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009376	TTTA	2	8	87404	87411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009376	TA	3	6	89192	89197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009376	TC	3	6	89198	89203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009376	AGTC	2	8	89760	89767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009376	ATCTC	2	10	89893	89902	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_009376	CAC	2	6	89943	89948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_009376	CCT	2	6	89963	89968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_009376	AAC	2	6	90002	90007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009376	TGG	2	6	90016	90021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009376	AC	3	6	90064	90069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009376	TA	3	6	90872	90877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009376	TAG	2	6	92981	92986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009376	ACT	2	6	93012	93017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009376	TAAA	2	8	93019	93026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009376	AT	3	6	95170	95175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009376	TTA	2	6	95186	95191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009376	TGA	2	6	95206	95211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009376	TGG	2	6	95221	95226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_009376	AG	3	6	96394	96399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_009376	CCAT	2	8	97407	97414	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_009376	GTA	2	6	99707	99712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009376	CAT	2	6	103005	103010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_009376	AGG	3	9	111872	111880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
186	NC_009376	AT	3	6	112382	112387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_009376	G	6	6	121633	121638	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_009376	TAA	2	6	170854	170859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_009376	TA	3	6	170942	170947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_009376	GGAT	2	8	170984	170991	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_009376	TAT	2	6	175877	175882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_009376	A	6	6	175927	175932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_009376	CCA	3	9	178197	178205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_009376	TCG	2	6	178233	178238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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