MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Prochlorococcus marinus str. MIT 9301

Total Repeats: 4470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009091	ATA	2	6	1382137	1382142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_009091	A	7	7	1383325	1383331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_009091	AAT	2	6	1383337	1383342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_009091	A	6	6	1383402	1383407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_009091	AAT	2	6	1383494	1383499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_009091	AAT	2	6	1383548	1383553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_009091	TAAT	2	8	1383582	1383589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_009091	A	7	7	1386329	1386335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_009091	AG	3	6	1389077	1389082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_009091	CTT	2	6	1389093	1389098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_009091	AT	3	6	1389100	1389105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_009091	TA	3	6	1389110	1389115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_009091	TAA	2	6	1389121	1389126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_009091	A	6	6	1389129	1389134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_009091	TAAATC	2	12	1389155	1389166	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4016	NC_009091	TTAA	2	8	1389170	1389177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_009091	T	6	6	1394041	1394046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_009091	AAT	2	6	1394494	1394499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_009091	TTA	2	6	1394503	1394508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_009091	TAA	2	6	1394521	1394526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_009091	TA	3	6	1397495	1397500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_009091	TTAA	2	8	1397536	1397543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_009091	AAAT	2	8	1397567	1397574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_009091	TA	3	6	1397583	1397588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_009091	T	8	8	1397592	1397599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_009091	A	7	7	1397603	1397609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_009091	TAA	2	6	1398394	1398399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_009091	A	6	6	1398575	1398580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_009091	T	6	6	1398581	1398586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_009091	ATA	2	6	1398604	1398609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_009091	AGT	2	6	1399661	1399666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_009091	ATA	3	9	1399876	1399884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_009091	ATA	2	6	1399886	1399891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_009091	TTAAA	2	10	1405943	1405952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_009091	T	6	6	1409327	1409332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_009091	CAA	2	6	1409373	1409378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_009091	A	6	6	1409377	1409382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_009091	GCT	2	6	1409492	1409497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_009091	AGA	2	6	1410622	1410627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_009091	AAAT	2	8	1410641	1410648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_009091	AATC	2	8	1410657	1410664	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_009091	AT	3	6	1410665	1410670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_009091	ATT	2	6	1410681	1410686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_009091	A	6	6	1410714	1410719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_009091	ATT	2	6	1412750	1412755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_009091	TAAT	2	8	1413905	1413912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_009091	AAT	2	6	1413932	1413937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_009091	GAA	2	6	1413944	1413949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_009091	ATT	2	6	1413954	1413959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_009091	GTT	2	6	1413960	1413965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_009091	T	7	7	1413964	1413970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_009091	TTC	2	6	1414001	1414006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_009091	A	6	6	1414012	1414017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_009091	TG	3	6	1414026	1414031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_009091	TAAA	2	8	1414042	1414049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_009091	TAAA	2	8	1414054	1414061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_009091	ATT	2	6	1414544	1414549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_009091	CAT	2	6	1414559	1414564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_009091	AATTA	2	10	1416248	1416257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_009091	AAT	2	6	1419904	1419909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_009091	TAA	2	6	1420043	1420048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_009091	TAA	2	6	1420076	1420081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_009091	TTCAC	2	10	1420105	1420114	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4064	NC_009091	AT	3	6	1420448	1420453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_009091	AT	3	6	1420465	1420470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_009091	TAAA	2	8	1421593	1421600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_009091	TAA	2	6	1421646	1421651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_009091	AGT	2	6	1421652	1421657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_009091	AAAT	2	8	1421672	1421679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_009091	ACA	2	6	1423322	1423327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_009091	ATTT	2	8	1423568	1423575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_009091	T	6	6	1423573	1423578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_009091	CTG	2	6	1423604	1423609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4075	NC_009091	ATA	3	9	1423664	1423672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4077	NC_009091	CAA	2	6	1424920	1424925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_009091	AAT	2	6	1424932	1424937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_009091	GTG	2	6	1424954	1424959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4081	NC_009091	TTCAAT	2	12	1425018	1425029	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4083	NC_009091	TTA	2	6	1425085	1425090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4085	NC_009091	TTA	2	6	1425129	1425134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4091	NC_009091	TAA	2	6	1430985	1430990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4094	NC_009091	TTTAG	2	10	1432283	1432292	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_009091	AAATA	2	10	1434384	1434393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4100	NC_009091	TCT	2	6	1441307	1441312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_009091	ATTTT	2	10	1441322	1441331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_009091	A	6	6	1441393	1441398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_009091	TAA	2	6	1441436	1441441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_009091	ATA	3	9	1441557	1441565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_009091	T	7	7	1441592	1441598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_009091	ATT	2	6	1441600	1441605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_009091	T	6	6	1441604	1441609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_009091	A	6	6	1441618	1441623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_009091	TAA	2	6	1441630	1441635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4111	NC_009091	TTAAAT	2	12	1444173	1444184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_009091	TTTA	2	8	1444197	1444204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_009091	TTA	2	6	1445005	1445010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_009091	GAT	2	6	1445014	1445019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_009091	ATT	2	6	1445026	1445031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_009091	TAA	3	9	1446397	1446405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_009091	ATTAAA	2	12	1446433	1446444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_009091	A	8	8	1446446	1446453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_009091	CAC	2	6	1446455	1446460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_009091	GTG	2	6	1446465	1446470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_009091	ATT	2	6	1446477	1446482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_009091	AAT	2	6	1451066	1451071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_009091	ATA	2	6	1451167	1451172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_009091	TAAA	2	8	1451290	1451297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_009091	T	9	9	1451307	1451315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_009091	T	7	7	1453222	1453228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_009091	ATA	2	6	1453263	1453268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_009091	ATG	2	6	1453269	1453274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_009091	A	8	8	1453279	1453286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_009091	ATTA	2	8	1454083	1454090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_009091	TAAA	2	8	1454100	1454107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_009091	GAGG	2	8	1454115	1454122	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_009091	CCT	2	6	1454147	1454152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4466	NC_009091	A	7	7	1641824	1641830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4470	NC_009091	TTCTT	2	10	1641862	1641871	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.