MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pyrobaculum calidifontis JCM 11548 chromosome

Total Repeats: 4231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009073	CA	3	6	1341643	1341648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_009073	TCA	2	6	1341673	1341678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_009073	TGT	2	6	1341769	1341774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_009073	AG	3	6	1341843	1341848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_009073	TAA	2	6	1345848	1345853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_009073	AAAATT	2	12	1345885	1345896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_009073	AT	3	6	1345900	1345905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_009073	TAAA	2	8	1347421	1347428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_009073	AGG	2	6	1347470	1347475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_009073	C	6	6	1347520	1347525	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3011	NC_009073	TCC	2	6	1350052	1350057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_009073	TA	4	8	1350070	1350077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_009073	AAC	2	6	1353359	1353364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_009073	CCG	2	6	1353877	1353882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_009073	CGG	2	6	1353886	1353891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_009073	TAA	2	6	1353912	1353917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_009073	TAA	2	6	1354899	1354904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_009073	AAT	2	6	1354916	1354921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_009073	CA	3	6	1354929	1354934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_009073	T	6	6	1354936	1354941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_009073	CGC	2	6	1355417	1355422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_009073	ATT	2	6	1357313	1357318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_009073	TC	3	6	1357319	1357324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_009073	TAA	2	6	1357331	1357336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_009073	CT	5	10	1357801	1357810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_009073	TAA	2	6	1357813	1357818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_009073	AATA	2	8	1360711	1360718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_009073	TA	3	6	1360730	1360735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_009073	CGC	2	6	1364105	1364110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_009073	TA	3	6	1364776	1364781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_009073	CGC	2	6	1365342	1365347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_009073	CGG	2	6	1365486	1365491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_009073	CGG	2	6	1365536	1365541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_009073	A	6	6	1367754	1367759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_009073	CCG	2	6	1367832	1367837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_009073	GAG	2	6	1367853	1367858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_009073	AG	3	6	1367911	1367916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_009073	CGCC	2	8	1367941	1367948	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3039	NC_009073	CAC	2	6	1368005	1368010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_009073	GGCGA	2	10	1368059	1368068	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3041	NC_009073	GTG	2	6	1368095	1368100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_009073	AGT	2	6	1368106	1368111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_009073	C	6	6	1368433	1368438	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3044	NC_009073	CAGC	2	8	1370236	1370243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_009073	ATT	2	6	1374009	1374014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_009073	A	6	6	1374026	1374031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_009073	AAC	2	6	1374051	1374056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_009073	GACA	2	8	1374073	1374080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_009073	TAGA	2	8	1374105	1374112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_009073	A	6	6	1374138	1374143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_009073	AG	3	6	1377819	1377824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_009073	GCC	3	9	1381542	1381550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_009073	CA	3	6	1382161	1382166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_009073	TTGCCG	2	12	1384735	1384746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_009073	G	6	6	1384832	1384837	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_009073	AGGG	2	8	1388894	1388901	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_009073	TGAGA	2	10	1390070	1390079	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_009073	CAA	2	6	1395883	1395888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_009073	CTT	2	6	1396734	1396739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_009073	TTTA	2	8	1396745	1396752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_009073	AT	3	6	1397509	1397514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_009073	GCC	2	6	1401570	1401575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_009073	GCC	2	6	1402634	1402639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_009073	AGCC	2	8	1402648	1402655	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_009073	CGC	2	6	1402669	1402674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_009073	ATA	2	6	1402682	1402687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_009073	GCGG	2	8	1402827	1402834	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3068	NC_009073	AGA	2	6	1403811	1403816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_009073	T	6	6	1404626	1404631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_009073	TAA	2	6	1409843	1409848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_009073	TAC	2	6	1410336	1410341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_009073	GTA	2	6	1410343	1410348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_009073	CCT	2	6	1411473	1411478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_009073	GCTG	2	8	1411497	1411504	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_009073	GCC	2	6	1411505	1411510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_009073	G	6	6	1411552	1411557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_009073	ATA	2	6	1412213	1412218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_009073	GGT	2	6	1412227	1412232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_009073	CT	3	6	1415174	1415179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_009073	CAGC	2	8	1415294	1415301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_009073	ACG	2	6	1420050	1420055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_009073	TGA	2	6	1420072	1420077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_009073	TG	3	6	1420094	1420099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_009073	AAC	2	6	1420209	1420214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_009073	CGC	2	6	1420225	1420230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_009073	TGGC	2	8	1420237	1420244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_009073	G	8	8	1420275	1420282	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_009073	AGG	2	6	1427061	1427066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_009073	TA	3	6	1427091	1427096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_009073	TCT	2	6	1427110	1427115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_009073	GAA	2	6	1427116	1427121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_009073	CGG	2	6	1427146	1427151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3094	NC_009073	TCT	2	6	1427224	1427229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_009073	T	6	6	1427249	1427254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3097	NC_009073	GC	3	6	1428963	1428968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_009073	GAC	2	6	1429042	1429047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_009073	CCT	2	6	1429131	1429136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_009073	AT	3	6	1429210	1429215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_009073	T	6	6	1429228	1429233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_009073	ACC	2	6	1429284	1429289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_009073	AAC	2	6	1429315	1429320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_009073	TC	3	6	1429378	1429383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_009073	GAGG	2	8	1429423	1429430	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_009073	CA	3	6	1429451	1429456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_009073	GCC	3	9	1429457	1429465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_009073	GAC	2	6	1429469	1429474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_009073	AAT	2	6	1429522	1429527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_009073	TCCCC	2	10	1429601	1429610	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3111	NC_009073	C	6	6	1429607	1429612	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3112	NC_009073	A	6	6	1429626	1429631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_009073	GA	3	6	1432245	1432250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_009073	TA	3	6	1432258	1432263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_009073	GCG	2	6	1433886	1433891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_009073	GT	3	6	1433905	1433910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_009073	CAC	2	6	1436795	1436800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_009073	GAG	2	6	1436864	1436869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_009073	CAA	2	6	1437003	1437008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_009073	CGC	2	6	1437031	1437036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_009073	TGT	2	6	1437051	1437056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_009073	CCG	3	9	1437078	1437086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_009073	CAA	2	6	1437092	1437097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_009073	GCG	2	6	1437137	1437142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_009073	GCG	2	6	1437163	1437168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_009073	TA	3	6	1437169	1437174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_009073	AGG	2	6	1437185	1437190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_009073	GGC	2	6	1437209	1437214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_009073	ACCAC	2	10	1437256	1437265	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3130	NC_009073	CTT	2	6	1437305	1437310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_009073	CCG	2	6	1440302	1440307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_009073	CCG	2	6	1440309	1440314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_009073	AGA	2	6	1440332	1440337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_009073	CAG	2	6	1440361	1440366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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