MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP08

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008764	ATAA	2	8	81	88	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008764	CT	5	10	1758	1767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008764	CGAT	2	8	1850	1857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008764	TGT	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008764	CCA	2	6	1936	1941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008764	ATC	2	6	2018	2023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008764	TCC	2	6	2027	2032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008764	TGTAT	2	10	4896	4905	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008764	TTG	2	6	5046	5051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008764	CT	3	6	5114	5119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008764	GAG	3	9	5148	5156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008764	TTG	2	6	5643	5648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008764	TGT	2	6	5690	5695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008764	AAT	2	6	5714	5719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008764	ATG	2	6	5862	5867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008764	TA	3	6	5923	5928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008764	GTT	2	6	5933	5938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008764	AT	3	6	5957	5962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008764	GATT	2	8	6068	6075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008764	AAT	2	6	6083	6088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008764	ATG	2	6	6138	6143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008764	ATC	2	6	6148	6153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008764	AAT	2	6	6155	6160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008764	TGT	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008764	T	6	6	6182	6187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008764	ATA	2	6	6190	6195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008764	A	6	6	6254	6259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008764	CAA	2	6	6264	6269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008764	ATGCA	2	10	6277	6286	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008764	CCCG	2	8	6287	6294	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_008764	TCC	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008764	GC	3	6	6396	6401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008764	TGC	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008764	GAT	2	6	6421	6426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.