MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP06

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008762	GCGG	2	8	94	101	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008762	A	6	6	117	122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008762	GCGT	2	8	128	135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008762	GTG	2	6	136	141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008762	TCT	2	6	334	339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008762	CA	3	6	463	468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008762	TGC	2	6	551	556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008762	GCG	2	6	697	702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008762	CAG	2	6	721	726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008762	CGTG	2	8	729	736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008762	GGC	2	6	748	753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008762	TGG	2	6	779	784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008762	CGGC	2	8	818	825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008762	CACC	2	8	857	864	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_008762	GGC	2	6	942	947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008762	GT	3	6	998	1003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008762	GCA	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008762	AAAT	2	8	3723	3730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008762	ATG	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008762	CGA	2	6	3820	3825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008762	GCT	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008762	CAT	2	6	3937	3942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008762	AT	3	6	4980	4985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008762	GTGAG	2	10	5026	5035	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008762	GCG	2	6	5054	5059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008762	CGG	2	6	5061	5066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008762	TAAA	2	8	6021	6028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008762	GGCA	2	8	6079	6086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008762	ACC	2	6	6109	6114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_008762	TAT	2	6	7091	7096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008762	TAA	3	9	7100	7108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008762	CAA	2	6	9710	9715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008762	T	6	6	9762	9767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008762	GTT	2	6	10132	10137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008762	GCC	2	6	10202	10207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008762	ATG	2	6	10310	10315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008762	ACA	2	6	10344	10349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008762	CAA	2	6	10363	10368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008762	TG	3	6	10373	10378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008762	CGG	2	6	12356	12361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008762	CCG	2	6	12450	12455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008762	CCG	2	6	12462	12467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_008762	AAC	2	6	12580	12585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008762	GC	3	6	12619	12624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008762	CGG	2	6	12638	12643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008762	G	6	6	12693	12698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008762	GACC	2	8	12843	12850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008762	GC	3	6	12961	12966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008762	TTG	2	6	13021	13026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008762	CCG	2	6	13038	13043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008762	ATT	2	6	13131	13136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008762	GCT	2	6	16834	16839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008762	CTT	2	6	16844	16849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008762	CCTGG	2	10	16957	16966	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_008762	TGT	2	6	16995	17000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008762	T	7	7	17027	17033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008762	T	6	6	17077	17082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008762	GT	3	6	17118	17123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008762	TG	4	8	17150	17157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008762	TG	4	8	17183	17190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008762	TG	4	8	17216	17223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008762	T	7	7	17234	17240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008762	AAC	2	6	19064	19069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008762	TCT	2	6	19121	19126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008762	TGG	2	6	19159	19164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008762	AGTT	2	8	19765	19772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008762	A	6	6	19787	19792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008762	GTA	2	6	19898	19903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008762	GCG	2	6	19964	19969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008762	TCA	2	6	19976	19981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008762	GCA	2	6	19985	19990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008762	GTG	2	6	20084	20089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008762	CCT	2	6	20856	20861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008762	G	6	6	20932	20937	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008762	ATT	2	6	20963	20968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008762	CGT	2	6	21025	21030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008762	ACG	2	6	21068	21073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008762	A	7	7	21086	21092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008762	CAGT	2	8	21151	21158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008762	TCCGT	2	10	21488	21497	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_008762	TA	3	6	21555	21560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.