MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14 chromosome

Total Repeats: 15102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008463	ATAG	2	8	67	74	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008463	CGA	2	6	151	156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008463	GGCA	2	8	181	188	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008463	TCCT	2	8	221	228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008463	T	6	6	270	275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008463	C	6	6	300	305	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_008463	GAC	2	6	336	341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008463	CGTC	2	8	342	349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008463	GCCT	2	8	351	358	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008463	TTA	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008463	GCC	2	6	454	459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008463	GACC	2	8	6706	6713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008463	CCT	2	6	6846	6851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008463	GGC	2	6	6852	6857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008463	AAG	2	6	6943	6948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008463	CTT	2	6	6965	6970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008463	CAGC	2	8	8382	8389	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008463	GGAT	2	8	8401	8408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008463	CGA	2	6	8409	8414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008463	AAT	2	6	8447	8452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008463	AATGG	2	10	8456	8465	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008463	CCAGG	2	10	8471	8480	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008463	GCA	2	6	8495	8500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008463	CCA	2	6	8601	8606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_008463	GAC	2	6	8623	8628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008463	TTC	2	6	10414	10419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008463	CGC	2	6	13492	13497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008463	C	6	6	13507	13512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_008463	GATG	2	8	14105	14112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008463	GC	3	6	14140	14145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008463	GCC	2	6	14176	14181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008463	CTT	2	6	14188	14193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008463	TCGAG	2	10	14213	14222	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008463	GAG	2	6	14224	14229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008463	GCC	2	6	15177	15182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008463	TCC	2	6	15183	15188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008463	CTG	2	6	15533	15538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008463	GC	3	6	15557	15562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008463	GGA	2	6	16293	16298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008463	CTT	2	6	16327	16332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008463	AGT	2	6	16623	16628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008463	TG	3	6	16759	16764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008463	GTC	2	6	16785	16790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008463	GA	3	6	16867	16872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008463	AGG	2	6	17323	17328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008463	AAAAG	2	10	21047	21056	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008463	GCT	2	6	21634	21639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008463	GC	3	6	21646	21651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008463	CGG	2	6	22775	22780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008463	GGAA	2	8	22799	22806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008463	ACG	2	6	22814	22819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008463	CCTG	2	8	22869	22876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008463	GAGT	2	8	24012	24019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008463	GGT	2	6	25684	25689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008463	TCG	2	6	25707	25712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008463	CG	3	6	25726	25731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008463	CCCG	2	8	26675	26682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_008463	CGTCC	2	10	26700	26709	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_008463	ACGT	2	8	27577	27584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008463	TCAC	2	8	27644	27651	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008463	GGC	2	6	34535	34540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008463	TGC	2	6	34570	34575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008463	ATC	2	6	34580	34585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008463	CTT	2	6	36929	36934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008463	CGG	2	6	36985	36990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008463	C	6	6	39158	39163	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_008463	TGC	2	6	40123	40128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008463	CGGCT	2	10	40136	40145	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_008463	GAA	2	6	40179	40184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008463	GA	3	6	40201	40206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008463	GCG	2	6	40517	40522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008463	GCG	2	6	40534	40539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008463	CGA	2	6	40849	40854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008463	CTTT	2	8	40892	40899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008463	TTG	2	6	40933	40938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008463	TCG	2	6	40943	40948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008463	GC	3	6	41001	41006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008463	CT	3	6	41108	41113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008463	CCT	2	6	42833	42838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_008463	ATT	2	6	53273	53278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008463	TAG	2	6	53306	53311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008463	T	8	8	53314	53321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008463	T	7	7	53381	53387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008463	TAATGT	2	12	53393	53404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008463	ATT	2	6	53414	53419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008463	TTCT	2	8	53426	53433	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008463	GT	3	6	53461	53466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008463	G	8	8	53537	53544	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008463	ATGA	2	8	53568	53575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008463	AT	3	6	53615	53620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008463	CTG	2	6	53632	53637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008463	AGCC	2	8	53671	53678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008463	T	6	6	53697	53702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008463	AAC	2	6	53706	53711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008463	CTT	2	6	53724	53729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008463	A	6	6	53739	53744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008463	ATTT	2	8	53762	53769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008463	ATT	2	6	53862	53867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008463	AGT	2	6	53909	53914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008463	AAAT	2	8	53917	53924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008463	GAA	2	6	53957	53962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008463	T	6	6	54046	54051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008463	AT	3	6	54053	54058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008463	AGA	2	6	54077	54082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008463	G	6	6	54130	54135	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008463	GAT	2	6	54198	54203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008463	AG	3	6	54215	54220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008463	AGA	2	6	54275	54280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008463	AGC	2	6	54292	54297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008463	CTA	2	6	54400	54405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008463	T	6	6	54410	54415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008463	TAAA	2	8	54437	54444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008463	ATTT	2	8	54463	54470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008463	AGG	2	6	54520	54525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008463	ACC	2	6	54703	54708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008463	GGC	2	6	54726	54731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008463	CCT	2	6	54740	54745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_008463	CCG	2	6	54794	54799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_008463	CGGG	2	8	54812	54819	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008463	GCA	2	6	54839	54844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008463	AGGC	2	8	54879	54886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008463	CGC	2	6	55321	55326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008463	CAGC	2	8	55342	55349	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008463	TCCCC	2	10	55401	55410	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
125	NC_008463	CCG	2	6	55416	55421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008463	GCC	2	6	55432	55437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_008463	GGTCC	2	10	55456	55465	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_008463	GTC	2	6	55531	55536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008463	GCG	2	6	55548	55553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008463	TTTC	2	8	57031	57038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008463	GCC	2	6	57053	57058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008463	A	7	7	57065	57071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008463	ATC	2	6	57142	57147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008463	AGG	2	6	58603	58608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008463	CCTG	2	8	58609	58616	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008463	TGG	2	6	58629	58634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008463	AACGA	2	10	58713	58722	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008463	GCC	2	6	58745	58750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_008463	GGCC	2	8	58823	58830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008463	GAAA	2	8	58867	58874	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008463	GC	3	6	58906	58911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008463	GCC	2	6	58918	58923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008463	T	7	7	58998	59004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008463	CCA	2	6	59706	59711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_008463	TGG	2	6	60110	60115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008463	CTG	2	6	60127	60132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008463	CGG	2	6	60141	60146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_008463	GC	3	6	60149	60154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008463	ACT	2	6	60170	60175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_008463	GCC	2	6	61309	61314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_008463	CGG	2	6	61369	61374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_008463	GCC	2	6	63445	63450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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282	NC_008463	CGG	2	6	125259	125264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_008463	TTCCC	2	10	133810	133819	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
286	NC_008463	C	6	6	133821	133826	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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288	NC_008463	CGGT	2	8	134373	134380	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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412	NC_008463	CAC	2	6	172547	172552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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416	NC_008463	GGC	2	6	172649	172654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_008463	CCCCG	2	10	173536	173545	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
418	NC_008463	CCT	2	6	173546	173551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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420	NC_008463	CG	3	6	174970	174975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
421	NC_008463	CG	3	6	174979	174984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
422	NC_008463	GGAA	2	8	174985	174992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
423	NC_008463	CCG	2	6	175031	175036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
424	NC_008463	TAC	2	6	175084	175089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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427	NC_008463	GCC	2	6	181453	181458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
428	NC_008463	G	6	6	181475	181480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
429	NC_008463	GGTG	2	8	181494	181501	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_008463	TTG	2	6	182571	182576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NC_008463	CT	3	6	182591	182596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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436	NC_008463	GCTG	2	8	183089	183096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
437	NC_008463	CGA	2	6	183098	183103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_008463	T	8	8	183311	183318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_008463	CG	3	6	183359	183364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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441	NC_008463	CAC	2	6	183426	183431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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443	NC_008463	CG	3	6	184793	184798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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446	NC_008463	CGG	2	6	187343	187348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_008463	AAG	2	6	187388	187393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_008463	GGCA	2	8	187398	187405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
449	NC_008463	GC	3	6	187432	187437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
450	NC_008463	CGA	2	6	187529	187534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_008463	CAT	2	6	187575	187580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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454	NC_008463	TTC	2	6	187697	187702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_008463	CGT	2	6	187787	187792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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457	NC_008463	CGC	2	6	187812	187817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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459	NC_008463	A	7	7	187949	187955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_008463	CG	3	6	188823	188828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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462	NC_008463	GC	3	6	188852	188857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
463	NC_008463	GC	3	6	188867	188872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_008463	A	7	7	211094	211100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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