MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudoalteromonas atlantica T6c chromosome

Total Repeats: 13334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008228	AC	3	6	429702	429707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_008228	TAA	2	6	432141	432146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008228	AGA	2	6	435621	435626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008228	T	6	6	435864	435869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008228	TTTA	2	8	438094	438101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008228	ATT	2	6	438166	438171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008228	CTAT	2	8	438198	438205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_008228	ATT	2	6	438215	438220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008228	TGC	2	6	438248	438253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_008228	GCT	2	6	438260	438265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_008228	TAA	2	6	440049	440054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008228	ATG	2	6	440240	440245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008228	TCT	2	6	440291	440296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_008228	TG	3	6	440297	440302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008228	TCT	2	6	440316	440321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_008228	TGG	2	6	440341	440346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008228	AGT	2	6	440500	440505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008228	GTT	2	6	440524	440529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008228	TATT	2	8	440538	440545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008228	CTT	2	6	440549	440554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_008228	TTA	2	6	440560	440565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008228	AGAA	2	8	442091	442098	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008228	TAA	2	6	442682	442687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008228	TGAG	2	8	442696	442703	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008228	CAA	2	6	442704	442709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_008228	AGT	2	6	442711	442716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008228	ACT	2	6	442747	442752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_008228	GAT	2	6	442771	442776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008228	AGC	2	6	442781	442786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_008228	T	6	6	442812	442817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008228	T	7	7	442823	442829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008228	GAA	2	6	442843	442848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008228	ATC	2	6	442930	442935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_008228	GAA	2	6	442947	442952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008228	T	7	7	443245	443251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008228	ATC	2	6	443252	443257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_008228	GTT	2	6	444015	444020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008228	AT	3	6	444051	444056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_008228	AAC	2	6	444058	444063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_008228	TAA	2	6	444101	444106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008228	A	6	6	449128	449133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008228	ATTT	2	8	450038	450045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008228	TAA	2	6	450064	450069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008228	GCA	2	6	450072	450077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_008228	TTA	2	6	454733	454738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008228	AATG	2	8	454751	454758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008228	GTTT	2	8	454809	454816	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008228	ATA	2	6	454875	454880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008228	GTAG	2	8	454908	454915	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008228	ATTG	2	8	454943	454950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008228	TAA	2	6	454953	454958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008228	TCA	2	6	454984	454989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_008228	T	6	6	457341	457346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008228	ATT	2	6	457356	457361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008228	G	6	6	457371	457376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008228	T	6	6	457408	457413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008228	GC	3	6	457454	457459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_008228	AG	3	6	457487	457492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008228	A	6	6	457720	457725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008228	TGAC	2	8	457733	457740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_008228	GCG	2	6	457819	457824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_008228	GCT	2	6	457825	457830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_008228	TGC	2	6	457855	457860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_008228	TGA	2	6	457953	457958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008228	GTT	2	6	457960	457965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008228	ATC	2	6	457977	457982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_008228	TCAA	2	8	458227	458234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_008228	TGG	2	6	458244	458249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008228	TA	3	6	458262	458267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008228	GATA	2	8	458309	458316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008228	CAAA	2	8	458363	458370	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_008228	TGTT	2	8	458372	458379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008228	AGC	2	6	458400	458405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_008228	CAG	2	6	458530	458535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_008228	T	7	7	458543	458549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008228	A	6	6	458569	458574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008228	TAAA	2	8	458744	458751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008228	TAT	2	6	458783	458788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008228	TAA	2	6	458877	458882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008228	TG	3	6	458893	458898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008228	CACT	2	8	458901	458908	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_008228	TGA	2	6	458909	458914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008228	A	8	8	458924	458931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_008228	GGC	2	6	458988	458993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_008228	AGA	2	6	459038	459043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008228	TG	3	6	459087	459092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008228	TTG	2	6	459191	459196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008228	CGA	2	6	459219	459224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_008228	GCA	2	6	459293	459298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_008228	GT	3	6	459346	459351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_008228	GAA	2	6	459352	459357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008228	AGA	2	6	459435	459440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008228	CAG	2	6	459461	459466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_008228	GGA	2	6	459652	459657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008228	CTA	2	6	459765	459770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_008228	GAA	2	6	459915	459920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008228	TGC	2	6	459991	459996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_008228	GTC	2	6	460003	460008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_008228	TCGTG	2	10	460012	460021	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_008228	GGA	2	6	460115	460120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008228	GAC	2	6	460128	460133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_008228	TCA	2	6	460140	460145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_008228	AC	3	6	460166	460171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_008228	TCG	2	6	460233	460238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_008228	AC	3	6	460335	460340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_008228	AAG	2	6	460371	460376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008228	GGA	2	6	460395	460400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008228	CCT	2	6	460476	460481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_008228	TTAGG	2	10	460487	460496	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008228	TCA	2	6	460499	460504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_008228	CA	3	6	460516	460521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_008228	TTGTT	2	10	460524	460533	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008228	AGA	2	6	460542	460547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008228	GA	3	6	460551	460556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008228	GCCT	2	8	460612	460619	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_008228	AGG	2	6	460627	460632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008228	CAG	2	6	460634	460639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_008228	CCA	2	6	460657	460662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_008228	TTGC	2	8	460665	460672	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_008228	AAT	2	6	460675	460680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008228	TCG	2	6	460785	460790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_008228	TAG	2	6	460862	460867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008228	TATT	2	8	460903	460910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008228	T	6	6	460919	460924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008228	GCAAAC	2	12	460944	460955	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_008228	CGG	2	6	461273	461278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008228	TAG	2	6	461371	461376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008228	GCGA	2	8	461379	461386	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_008228	G	6	6	461528	461533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008228	TCC	2	6	461538	461543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_008228	GGA	2	6	461847	461852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008228	AC	3	6	462064	462069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_008228	CGTC	2	8	462082	462089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_008228	AAC	2	6	462101	462106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1136	NC_008228	AGG	2	6	462175	462180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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