MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudoalteromonas atlantica T6c chromosome

Total Repeats: 13334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_008228	TTAA	2	8	5035692	5035699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_008228	CAA	2	6	5035701	5035706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_008228	A	6	6	5035705	5035710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_008228	CATG	2	8	5035728	5035735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13006	NC_008228	GTT	2	6	5035769	5035774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_008228	CCG	2	6	5035777	5035782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13008	NC_008228	TGC	2	6	5037304	5037309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_008228	ACT	2	6	5037314	5037319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_008228	GCA	2	6	5037341	5037346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_008228	CTT	2	6	5037385	5037390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_008228	TCG	2	6	5037395	5037400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_008228	ACTC	2	8	5037497	5037504	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13014	NC_008228	ACTAA	2	10	5038090	5038099	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13015	NC_008228	TGT	2	6	5039630	5039635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_008228	CTT	2	6	5039691	5039696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_008228	A	8	8	5039710	5039717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_008228	TACT	2	8	5039754	5039761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13019	NC_008228	A	6	6	5042366	5042371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_008228	A	6	6	5043039	5043044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_008228	TTA	3	9	5044466	5044474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13031	NC_008228	TAAG	2	8	5045183	5045190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_008228	AAATT	2	10	5045230	5045239	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13040	NC_008228	GCG	2	6	5048290	5048295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_008228	TTA	2	6	5048342	5048347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_008228	TCC	2	6	5048364	5048369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13043	NC_008228	A	6	6	5048983	5048988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13047	NC_008228	T	7	7	5051720	5051726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13062	NC_008228	TGT	2	6	5052238	5052243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13064	NC_008228	AATT	2	8	5053823	5053830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_008228	TAA	2	6	5053927	5053932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13070	NC_008228	GTTA	2	8	5055870	5055877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13079	NC_008228	GAG	2	6	5058512	5058517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13101	NC_008228	GAT	2	6	5066374	5066379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13112	NC_008228	ATT	2	6	5068185	5068190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13114	NC_008228	T	7	7	5071075	5071081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_008228	TTA	2	6	5071122	5071127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_008228	T	6	6	5074257	5074262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_008228	CT	3	6	5074264	5074269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13118	NC_008228	TC	3	6	5080009	5080014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13119	NC_008228	TTA	2	6	5080019	5080024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_008228	TTTG	2	8	5081104	5081111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_008228	A	7	7	5081201	5081207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_008228	CG	3	6	5081231	5081236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13123	NC_008228	A	6	6	5084050	5084055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_008228	TA	3	6	5084063	5084068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_008228	ATCACG	2	12	5084072	5084083	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13127	NC_008228	TCAA	2	8	5084663	5084670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13128	NC_008228	ATA	2	6	5085993	5085998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_008228	T	6	6	5086001	5086006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.