MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudoalteromonas atlantica T6c chromosome

Total Repeats: 13334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008228	TCA	2	6	2736440	2736445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_008228	AAT	2	6	2736507	2736512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_008228	T	7	7	2737290	2737296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_008228	CATCC	2	10	2741000	2741009	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7005	NC_008228	TA	3	6	2741029	2741034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_008228	TTG	2	6	2741064	2741069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_008228	AAAT	2	8	2742564	2742571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_008228	AAT	2	6	2742589	2742594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_008228	CAAT	2	8	2742705	2742712	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7010	NC_008228	GGTT	2	8	2747101	2747108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_008228	GCC	2	6	2747182	2747187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_008228	CTC	2	6	2750173	2750178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7013	NC_008228	TA	3	6	2750199	2750204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_008228	ATT	2	6	2750238	2750243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_008228	AT	3	6	2750338	2750343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_008228	CCA	2	6	2751217	2751222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_008228	A	6	6	2752312	2752317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_008228	TTAA	2	8	2752322	2752329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_008228	AT	3	6	2752397	2752402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_008228	TAA	2	6	2752472	2752477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_008228	TAA	2	6	2754274	2754279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_008228	AGA	2	6	2754358	2754363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_008228	AAAAC	2	10	2754432	2754441	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7024	NC_008228	GGTTT	2	10	2756868	2756877	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_008228	CTC	2	6	2756997	2757002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7026	NC_008228	ACCCC	2	10	2757095	2757104	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7027	NC_008228	TTG	2	6	2757210	2757215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_008228	TGT	2	6	2758778	2758783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_008228	AAC	2	6	2758789	2758794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_008228	ATG	2	6	2758830	2758835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_008228	TAG	2	6	2758896	2758901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_008228	AACGAA	2	12	2759375	2759386	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7033	NC_008228	ATA	2	6	2759394	2759399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_008228	CAA	2	6	2759401	2759406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_008228	TGA	2	6	2759412	2759417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_008228	ATGT	2	8	2759418	2759425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_008228	T	7	7	2759484	2759490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_008228	T	8	8	2759498	2759505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_008228	TTA	2	6	2759518	2759523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_008228	TTA	2	6	2759535	2759540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_008228	TTG	2	6	2762429	2762434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_008228	AGT	2	6	2762487	2762492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_008228	TGAA	2	8	2762503	2762510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_008228	TAAA	2	8	2762540	2762547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_008228	CGC	2	6	2762574	2762579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_008228	TCA	2	6	2762584	2762589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_008228	GGC	2	6	2762608	2762613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_008228	ATT	3	9	2763276	2763284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_008228	TACT	2	8	2763301	2763308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7050	NC_008228	GCT	2	6	2763364	2763369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_008228	AATA	2	8	2763389	2763396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_008228	TTGT	2	8	2763397	2763404	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_008228	TCA	2	6	2763414	2763419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_008228	GTTT	2	8	2763420	2763427	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_008228	TTG	2	6	2763457	2763462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_008228	CGGTA	2	10	2763465	2763474	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7057	NC_008228	GTTCT	2	10	2763720	2763729	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7058	NC_008228	GCCA	2	8	2763772	2763779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7059	NC_008228	TGAACT	3	18	2763823	2763840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7060	NC_008228	A	7	7	2763969	2763975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_008228	C	6	6	2764039	2764044	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7062	NC_008228	ATA	2	6	2764104	2764109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_008228	AGA	2	6	2764120	2764125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_008228	TTCA	3	12	2764178	2764189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7065	NC_008228	GA	3	6	2764202	2764207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_008228	AAC	2	6	2764779	2764784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_008228	CT	3	6	2766152	2766157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7068	NC_008228	T	7	7	2766178	2766184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_008228	CGT	2	6	2766206	2766211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_008228	CG	3	6	2766232	2766237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7071	NC_008228	CAGC	2	8	2766249	2766256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7072	NC_008228	CAAAA	2	10	2767391	2767400	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7073	NC_008228	A	6	6	2767397	2767402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_008228	AACC	2	8	2767417	2767424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7075	NC_008228	TAA	2	6	2767453	2767458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_008228	TAA	2	6	2772391	2772396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_008228	AGC	2	6	2772518	2772523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7079	NC_008228	TAAA	2	8	2772593	2772600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_008228	TC	3	6	2772638	2772643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7081	NC_008228	A	6	6	2772644	2772649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_008228	TCAA	2	8	2772763	2772770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7084	NC_008228	GAA	2	6	2776809	2776814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7088	NC_008228	TAC	2	6	2776949	2776954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7090	NC_008228	AAG	2	6	2776981	2776986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_008228	ACT	2	6	2777004	2777009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7093	NC_008228	GCA	2	6	2777155	2777160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_008228	ACTG	2	8	2777168	2777175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7095	NC_008228	A	6	6	2777195	2777200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7097	NC_008228	GTT	2	6	2777342	2777347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7099	NC_008228	TCAG	2	8	2777436	2777443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7100	NC_008228	TGG	2	6	2777513	2777518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_008228	GAT	2	6	2777687	2777692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_008228	GTTA	2	8	2777762	2777769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_008228	CTC	2	6	2779468	2779473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7104	NC_008228	GAC	2	6	2779558	2779563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_008228	TGC	2	6	2779566	2779571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_008228	CCTA	2	8	2779630	2779637	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7109	NC_008228	AAT	2	6	2780091	2780096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_008228	AGA	2	6	2780216	2780221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_008228	GTA	2	6	2780229	2780234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7113	NC_008228	TAT	2	6	2780292	2780297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_008228	AT	3	6	2780334	2780339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_008228	ATTTT	2	10	2780365	2780374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_008228	T	6	6	2780371	2780376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_008228	GT	3	6	2783086	2783091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7119	NC_008228	AATT	2	8	2783152	2783159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_008228	CAA	2	6	2783176	2783181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7123	NC_008228	CA	3	6	2783295	2783300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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