MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudoalteromonas atlantica T6c chromosome

Total Repeats: 13334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008228	A	8	8	1952757	1952764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_008228	T	7	7	1952769	1952775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_008228	T	7	7	1952784	1952790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_008228	GTTG	2	8	1952796	1952803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_008228	T	6	6	1952804	1952809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_008228	AT	3	6	1953645	1953650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_008228	CAA	2	6	1953691	1953696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_008228	TCG	2	6	1953757	1953762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_008228	T	6	6	1953784	1953789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_008228	ATT	2	6	1955296	1955301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_008228	GC	3	6	1955355	1955360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_008228	T	6	6	1955362	1955367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_008228	TGT	2	6	1955378	1955383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_008228	CTGC	2	8	1955418	1955425	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_008228	AAAAT	2	10	1956727	1956736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_008228	TAG	2	6	1958526	1958531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_008228	CTAA	2	8	1961989	1961996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_008228	ATT	2	6	1963035	1963040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_008228	AGACAC	2	12	1963057	1963068	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_008228	AAAAGA	2	12	1963072	1963083	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_008228	GTG	2	6	1963089	1963094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_008228	T	6	6	1963106	1963111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_008228	ATT	2	6	1963126	1963131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_008228	GCT	2	6	1963159	1963164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_008228	AT	3	6	1968716	1968721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_008228	T	6	6	1968721	1968726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_008228	AT	3	6	1968731	1968736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_008228	T	6	6	1971612	1971617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_008228	A	7	7	1972141	1972147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_008228	GC	3	6	1972192	1972197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_008228	TCT	2	6	1972198	1972203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_008228	TG	3	6	1973498	1973503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_008228	TTA	2	6	1973507	1973512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_008228	GTT	2	6	1973646	1973651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_008228	TCA	2	6	1973658	1973663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_008228	TTA	2	6	1980830	1980835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_008228	TA	3	6	1980900	1980905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_008228	CTAA	2	8	1981004	1981011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_008228	CGT	2	6	1981045	1981050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_008228	T	7	7	1984745	1984751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_008228	A	7	7	1984830	1984836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_008228	CT	4	8	1984845	1984852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_008228	T	7	7	1984852	1984858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_008228	AAT	2	6	1984865	1984870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_008228	AGC	2	6	1985003	1985008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_008228	GTA	2	6	1985010	1985015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_008228	TAT	2	6	1985070	1985075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_008228	TAT	2	6	1985091	1985096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_008228	TG	3	6	1985124	1985129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_008228	TA	3	6	1985244	1985249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_008228	GTA	2	6	1985316	1985321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_008228	GTT	2	6	1985326	1985331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_008228	T	6	6	1985348	1985353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_008228	TGA	2	6	1985356	1985361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_008228	A	6	6	1985385	1985390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_008228	CAG	2	6	1989934	1989939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_008228	ATT	2	6	1989955	1989960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_008228	GTA	2	6	1989980	1989985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_008228	CAG	2	6	1992990	1992995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_008228	CAT	2	6	1993590	1993595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_008228	GTT	2	6	1995072	1995077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_008228	CAAG	2	8	1995112	1995119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_008228	ACGA	2	8	1995986	1995993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_008228	GAC	2	6	1996032	1996037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_008228	AAT	2	6	1996078	1996083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_008228	TGT	2	6	1996100	1996105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_008228	GGA	2	6	1996126	1996131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_008228	CTGATA	2	12	1997579	1997590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5069	NC_008228	TTG	2	6	1997598	1997603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_008228	T	7	7	1997609	1997615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_008228	GACA	2	8	1997654	1997661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_008228	T	6	6	1998028	1998033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_008228	TAT	2	6	1998050	1998055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_008228	ATA	3	9	1998058	1998066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_008228	TCA	2	6	1998088	1998093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_008228	TAT	2	6	2000275	2000280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_008228	ATA	2	6	2000343	2000348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_008228	GAG	2	6	2000391	2000396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_008228	ATGA	2	8	2001418	2001425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_008228	CATT	2	8	2001453	2001460	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_008228	GCTG	2	8	2001470	2001477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_008228	A	6	6	2001576	2001581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_008228	CAC	2	6	2002525	2002530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_008228	GTG	2	6	2002547	2002552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_008228	ACCT	2	8	2003309	2003316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_008228	AT	3	6	2003787	2003792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_008228	AATT	2	8	2003801	2003808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_008228	ACT	2	6	2003827	2003832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_008228	CAAT	2	8	2003843	2003850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5090	NC_008228	GAAA	2	8	2003906	2003913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_008228	TGA	2	6	2003926	2003931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_008228	A	6	6	2003940	2003945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_008228	ATG	2	6	2004021	2004026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_008228	GCGA	2	8	2004033	2004040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_008228	GCA	2	6	2004065	2004070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_008228	TTAA	2	8	2004119	2004126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_008228	CTT	2	6	2004226	2004231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_008228	GAC	2	6	2004232	2004237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_008228	GCA	2	6	2004303	2004308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_008228	A	7	7	2004316	2004322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_008228	ACG	2	6	2004376	2004381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_008228	CA	3	6	2004402	2004407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_008228	TAT	2	6	2004413	2004418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_008228	AAG	2	6	2004532	2004537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_008228	TTA	3	9	2005936	2005944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_008228	GTC	2	6	2005957	2005962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_008228	TCG	2	6	2005986	2005991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_008228	GC	3	6	2006012	2006017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_008228	TAA	2	6	2006021	2006026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_008228	T	7	7	2006062	2006068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_008228	CAA	2	6	2006073	2006078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_008228	TAT	2	6	2006091	2006096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_008228	T	7	7	2010743	2010749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008228	TAC	2	6	2010789	2010794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_008228	TC	3	6	2011478	2011483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_008228	TTG	2	6	2011547	2011552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_008228	TTTTAA	2	12	2011567	2011578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_008228	ATA	2	6	2013399	2013404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_008228	TTC	2	6	2014275	2014280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_008228	AGC	2	6	2014666	2014671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_008228	TTGT	2	8	2014727	2014734	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_008228	GTT	2	6	2014750	2014755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_008228	CAG	2	6	2014762	2014767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_008228	ATA	2	6	2014800	2014805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_008228	GC	3	6	2014807	2014812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_008228	ACA	2	6	2014853	2014858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_008228	AAT	2	6	2015695	2015700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_008228	ATA	2	6	2016908	2016913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_008228	CCA	2	6	2016928	2016933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_008228	TTG	2	6	2017000	2017005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_008228	T	6	6	2017014	2017019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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