MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Psychrobacter cryohalolentis K5 plasmid 1

Total Repeats: 257

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007968	TA	3	6	14	19	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007968	TGGAT	2	10	36	45	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007968	TTTA	2	8	53	60	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007968	ACC	2	6	101	106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007968	ATT	2	6	122	127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007968	TTA	2	6	131	136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007968	TGA	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007968	T	6	6	1284	1289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007968	GATTA	2	10	1345	1354	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007968	ATT	2	6	1469	1474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007968	AATC	2	8	1483	1490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007968	TAAT	2	8	1499	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007968	TAAA	2	8	2225	2232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007968	TTG	2	6	2236	2241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007968	TTG	2	6	2270	2275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007968	T	6	6	2280	2285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007968	ATG	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007968	CTA	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007968	AT	4	8	2433	2440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007968	AAT	2	6	2446	2451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007968	ATT	2	6	2488	2493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007968	ACT	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007968	AAG	2	6	3228	3233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007968	TA	3	6	4210	4215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007968	AATT	2	8	4216	4223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007968	T	6	6	4230	4235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007968	TTG	2	6	4782	4787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007968	ATG	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007968	TAT	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007968	TAA	2	6	4828	4833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007968	TAA	2	6	4848	4853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007968	ATT	2	6	4866	4871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007968	TTA	2	6	4884	4889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007968	ATA	2	6	4903	4908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007968	T	6	6	4910	4915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007968	CTA	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007968	A	7	7	6056	6062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007968	T	7	7	6114	6120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007968	T	6	6	6150	6155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007968	TAA	3	9	6187	6195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007968	TGC	2	6	6229	6234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007968	AAAC	2	8	6331	6338	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007968	ATTA	2	8	6388	6395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007968	CTA	2	6	6417	6422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007968	TAA	2	6	6437	6442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007968	ATT	2	6	8306	8311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007968	TTA	2	6	8367	8372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007968	GTA	2	6	8779	8784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007968	AC	3	6	8801	8806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007968	T	6	6	8819	8824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007968	GCT	2	6	8827	8832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007968	ATG	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007968	T	6	6	8860	8865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007968	AGT	2	6	8878	8883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007968	AATTA	2	10	8953	8962	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007968	TAT	2	6	9069	9074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007968	TAA	2	6	9086	9091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007968	A	8	8	9090	9097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007968	TTA	2	6	9118	9123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007968	AT	3	6	9811	9816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007968	TAT	2	6	9830	9835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007968	AGC	2	6	9868	9873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007968	TAT	2	6	10004	10009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007968	ATTA	2	8	10018	10025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007968	AAT	2	6	10731	10736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007968	TCAAGC	2	12	12437	12448	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007968	AGTATC	2	12	12450	12461	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007968	AAT	2	6	12470	12475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007968	ATTTA	2	10	12544	12553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007968	AGG	2	6	12567	12572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007968	TTTGA	2	10	12577	12586	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007968	AT	4	8	12596	12603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007968	T	6	6	14315	14320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007968	TTC	2	6	14338	14343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007968	T	6	6	14348	14353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007968	ACAA	2	8	14358	14365	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007968	TTA	2	6	14424	14429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007968	GAACC	2	10	14584	14593	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_007968	ATG	2	6	14727	14732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007968	TAA	2	6	14782	14787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007968	GAT	2	6	14789	14794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007968	AGTT	3	12	14857	14868	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007968	T	6	6	14867	14872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007968	G	6	6	14899	14904	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007968	T	7	7	14908	14914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007968	T	8	8	14944	14951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007968	GCT	2	6	14956	14961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007968	ATT	2	6	14974	14979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007968	AGC	2	6	14997	15002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007968	AAT	2	6	16255	16260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007968	ATA	2	6	16266	16271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007968	TTA	2	6	16283	16288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007968	TAAGT	2	10	16310	16319	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007968	GT	3	6	16367	16372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007968	GTAA	2	8	16390	16397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007968	A	6	6	16396	16401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007968	TAA	2	6	16429	16434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007968	ATA	2	6	16482	16487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007968	TAG	2	6	16530	16535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007968	GGT	2	6	16562	16567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007968	AG	3	6	16601	16606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007968	AGA	2	6	16624	16629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007968	A	6	6	16743	16748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007968	A	6	6	16780	16785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007968	C	6	6	16788	16793	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_007968	TAC	2	6	16794	16799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007968	TAA	2	6	16806	16811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007968	G	7	7	16812	16818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007968	GT	3	6	16839	16844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007968	TAA	2	6	16895	16900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007968	GAA	2	6	16911	16916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007968	CTG	2	6	17869	17874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007968	CTG	2	6	17911	17916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007968	GCCAC	2	10	18032	18041	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_007968	TAA	2	6	18095	18100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007968	TA	3	6	18123	18128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007968	A	6	6	18138	18143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007968	T	6	6	18164	18169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007968	TAC	2	6	18176	18181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007968	CTT	2	6	19122	19127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007968	T	6	6	19126	19131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007968	GTAA	2	8	19168	19175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007968	ATG	2	6	19178	19183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007968	A	6	6	19228	19233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007968	AATC	2	8	19292	19299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007968	A	6	6	19319	19324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007968	TAA	2	6	19435	19440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007968	CTT	2	6	20301	20306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007968	TCT	2	6	20338	20343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007968	AAT	3	9	20348	20356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007968	TA	3	6	20421	20426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007968	TA	3	6	20453	20458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007968	GAA	2	6	21230	21235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007968	A	6	6	21312	21317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007968	TGTA	2	8	21365	21372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007968	AG	3	6	21417	21422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007968	AT	3	6	21469	21474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007968	ATT	2	6	21500	21505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007968	TTA	2	6	21529	21534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007968	ATGT	2	8	21540	21547	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007968	T	6	6	23636	23641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007968	AGTG	2	8	23685	23692	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007968	CAA	2	6	24132	24137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007968	A	6	6	24146	24151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007968	A	7	7	24220	24226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007968	TAA	2	6	24245	24250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007968	TTAT	2	8	24631	24638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007968	TCAAT	2	10	24667	24676	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_007968	T	6	6	24693	24698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007968	AAT	3	9	24705	24713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007968	TAT	2	6	25032	25037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.