MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Polaromonas sp. JS666 plasmid 2

Total Repeats: 1045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007950	GTTTC	2	10	60	69	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007950	CATG	2	8	100	107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007950	TGC	2	6	126	131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007950	CAAA	2	8	170	177	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007950	CCCA	2	8	1963	1970	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_007950	CTG	2	6	1993	1998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007950	C	6	6	2026	2031	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_007950	ATG	2	6	2040	2045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007950	GTC	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007950	CAA	2	6	2144	2149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007950	TCA	2	6	2179	2184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007950	TCG	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007950	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007950	GCT	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007950	GCA	2	6	2375	2380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007950	CGA	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007950	GCA	2	6	2399	2404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007950	TTC	2	6	4071	4076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007950	CTT	2	6	6366	6371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007950	TG	3	6	15575	15580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007950	GCGTT	2	10	15591	15600	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007950	GGCG	2	8	20985	20992	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007950	TAG	2	6	24595	24600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007950	CCG	4	12	24624	24635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007950	GTT	2	6	24716	24721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007950	C	6	6	26810	26815	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_007950	CCT	2	6	28043	28048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007950	CACC	2	8	28063	28070	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_007950	T	7	7	31967	31973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007950	AGC	2	6	32021	32026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007950	CGA	2	6	32056	32061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007950	A	7	7	32072	32078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007950	CAA	2	6	32133	32138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007950	TG	3	6	32162	32167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007950	GCG	2	6	32219	32224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007950	A	6	6	32238	32243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007950	ATCA	2	8	32264	32271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007950	GCA	2	6	32319	32324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007950	CGCC	2	8	32337	32344	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_007950	AGA	2	6	32394	32399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007950	CGA	2	6	32404	32409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007950	CTC	2	6	33649	33654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_007950	T	7	7	33670	33676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007950	TCGAA	2	10	33757	33766	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007950	CTC	2	6	33777	33782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007950	GAA	2	6	33784	33789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007950	CAA	2	6	33807	33812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007950	GCG	2	6	34749	34754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007950	TTTCAT	4	24	35632	35655	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007950	T	6	6	35662	35667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007950	C	6	6	36494	36499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_007950	GCC	2	6	37669	37674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007950	CCTG	2	8	38895	38902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007950	CTC	2	6	38918	38923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007950	C	6	6	44652	44657	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_007950	T	7	7	44733	44739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007950	GTC	2	6	46096	46101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007950	GCG	2	6	46140	46145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007950	ATC	2	6	46240	46245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007950	ATCA	2	8	46248	46255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007950	CTG	2	6	47091	47096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007950	CTAA	2	8	47134	47141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007950	CCT	2	6	47815	47820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007950	T	6	6	48412	48417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007950	CT	3	6	48419	48424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007950	CGG	2	6	50154	50159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007950	GCATCC	2	12	50206	50217	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007950	GC	3	6	52878	52883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007950	TTAA	2	8	55447	55454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007950	ACC	2	6	55478	55483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007950	GATG	2	8	55547	55554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007950	GGC	2	6	55581	55586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007950	CG	3	6	55688	55693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007950	AGC	3	9	55730	55738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007950	ACC	2	6	55740	55745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007950	CAG	3	9	55772	55780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007950	CAGC	2	8	55802	55809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007950	CAT	2	6	55863	55868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007950	TCG	2	6	55954	55959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007950	GCC	3	9	55975	55983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007950	CGT	2	6	56015	56020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007950	ACG	2	6	56053	56058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007950	GC	3	6	56062	56067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007950	AGGT	2	8	58275	58282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007950	AGCCA	2	10	58327	58336	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_007950	TTAG	2	8	58574	58581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007950	GCA	2	6	58613	58618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007950	AAG	2	6	58640	58645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007950	T	6	6	60165	60170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007950	CCA	2	6	61840	61845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_007950	GC	3	6	63608	63613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007950	A	6	6	63647	63652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007950	CCAGC	2	10	63659	63668	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_007950	GCCAG	2	10	63785	63794	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_007950	GAT	2	6	63824	63829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007950	TGC	2	6	63835	63840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007950	CCA	2	6	63892	63897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007950	TGC	2	6	63988	63993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007950	CTG	2	6	64017	64022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007950	GGCGAG	2	12	64050	64061	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007950	CTA	2	6	64082	64087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007950	TGA	2	6	64158	64163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007950	GCC	2	6	64216	64221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007950	CGG	3	9	64243	64251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007950	CG	3	6	64277	64282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007950	GCG	2	6	64296	64301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007950	TCC	2	6	64315	64320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_007950	GCCA	2	8	64346	64353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007950	TGG	2	6	64449	64454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007950	GC	3	6	64502	64507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007950	GATGTG	2	12	64508	64519	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007950	CAT	2	6	64548	64553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007950	ATG	2	6	64561	64566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007950	TCCG	2	8	64585	64592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007950	CAA	2	6	64646	64651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007950	TCGA	2	8	64683	64690	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007950	CCG	2	6	64714	64719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_007950	GCC	2	6	64773	64778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_007950	GGT	2	6	64795	64800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007950	CG	3	6	64806	64811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007950	C	7	7	64829	64835	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_007950	CAG	2	6	64844	64849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007950	CT	3	6	64920	64925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007950	A	6	6	64929	64934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007950	TAAA	2	8	64936	64943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007950	ATT	2	6	66222	66227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007950	CCG	2	6	66990	66995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007950	CG	3	6	67036	67041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007950	TCT	2	6	69580	69585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007950	AAGC	2	8	69715	69722	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_007950	AGC	2	6	69747	69752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007950	CAGGC	2	10	69770	69779	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_007950	CCCA	2	8	69800	69807	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_007950	AAG	2	6	69813	69818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007950	CCG	2	6	69825	69830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007950	CTT	2	6	70760	70765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007950	ATT	2	6	70803	70808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007950	TAA	2	6	72510	72515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007950	ACTA	2	8	72518	72525	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007950	GGT	2	6	72573	72578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007950	T	6	6	72588	72593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007950	GAT	2	6	72630	72635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007950	T	8	8	72653	72660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007950	ATGA	2	8	72679	72686	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007950	ACCAAA	2	12	72701	72712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007950	CAATTT	2	12	75285	75296	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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181	NC_007950	T	6	6	91515	91520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_007950	CAT	2	6	121793	121798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_007950	TTG	2	6	122704	122709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_007950	TGA	2	6	126196	126201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_007950	GC	3	6	126271	126276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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289	NC_007950	GCCGGC	2	12	126501	126512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
290	NC_007950	A	6	6	127003	127008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_007950	CG	3	6	127164	127169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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419	NC_007950	GCC	2	6	151379	151384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
420	NC_007950	T	9	9	151402	151410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_007950	CTC	2	6	151742	151747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
422	NC_007950	AG	3	6	151755	151760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
423	NC_007950	CAC	2	6	151859	151864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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425	NC_007950	TCT	2	6	153293	153298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_007950	ACT	2	6	153367	153372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_007950	GGA	2	6	153658	153663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
428	NC_007950	GGC	2	6	153712	153717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_007950	CAC	2	6	153738	153743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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431	NC_007950	GGA	2	6	155490	155495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
432	NC_007950	CA	3	6	155529	155534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
433	NC_007950	TCC	2	6	155535	155540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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454	NC_007950	CAC	2	6	162811	162816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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458	NC_007950	GCCGT	2	10	166598	166607	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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