MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Polaromonas sp. JS666 chromosome

Total Repeats: 12286

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007948	CAGCC	2	10	20	29	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_007948	AATG	2	8	1435	1442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007948	CAA	2	6	1490	1495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007948	AAC	2	6	1514	1519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007948	GTT	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007948	AAAC	2	8	1604	1611	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007948	TAC	4	12	1669	1680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007948	GC	3	6	2851	2856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007948	GAA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007948	GGC	2	6	8024	8029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007948	CT	3	6	8046	8051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007948	GGC	2	6	8635	8640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007948	TGC	2	6	8656	8661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007948	CTG	2	6	8934	8939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007948	TGCG	2	8	9160	9167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007948	GGC	2	6	9797	9802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007948	CATT	2	8	10461	10468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007948	TCT	2	6	10480	10485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007948	CGCCTG	2	12	10574	10585	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007948	A	6	6	12091	12096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007948	GGC	2	6	12149	12154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007948	GGC	2	6	12182	12187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007948	CG	3	6	12955	12960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007948	GGT	2	6	13000	13005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007948	TGG	2	6	13028	13033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007948	TA	3	6	13078	13083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007948	GCG	2	6	14381	14386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007948	CTG	2	6	14428	14433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007948	TGCG	2	8	14443	14450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007948	GGC	2	6	15496	15501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007948	ATG	2	6	15515	15520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007948	AGTG	2	8	15535	15542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007948	CTT	2	6	15644	15649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007948	TTCA	2	8	15664	15671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007948	TGC	2	6	16371	16376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007948	CAA	2	6	16380	16385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007948	T	7	7	16425	16431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007948	CGG	2	6	16471	16476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007948	GGC	2	6	18261	18266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007948	CG	3	6	18277	18282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007948	CGG	2	6	18287	18292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007948	GGT	2	6	18373	18378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007948	GTC	2	6	18409	18414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007948	AGCG	2	8	18430	18437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007948	AG	3	6	19580	19585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007948	CGTG	2	8	19590	19597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007948	CGA	2	6	20505	20510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007948	GTG	2	6	20518	20523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007948	CGG	2	6	20590	20595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007948	ACC	2	6	20719	20724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007948	ATTT	2	8	20753	20760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007948	G	6	6	21995	22000	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007948	CGG	2	6	22017	22022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007948	CGCC	2	8	22549	22556	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_007948	CAG	2	6	22572	22577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007948	CAAA	2	8	22580	22587	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007948	TCA	2	6	22601	22606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007948	CCT	2	6	22614	22619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007948	CAT	2	6	22646	22651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007948	CAC	2	6	22652	22657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_007948	GC	3	6	22689	22694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007948	TGG	2	6	23142	23147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007948	CAG	2	6	23181	23186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007948	GC	3	6	23295	23300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007948	TGC	2	6	23303	23308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007948	TGG	2	6	23395	23400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007948	GCC	2	6	25784	25789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_007948	CAG	2	6	25879	25884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007948	G	6	6	25931	25936	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007948	GGCG	2	8	26797	26804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007948	GCG	2	6	26842	26847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007948	G	6	6	26867	26872	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007948	A	6	6	26887	26892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007948	AGGC	2	8	26897	26904	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007948	CATGGT	2	12	26930	26941	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007948	TTG	2	6	26944	26949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007948	CGG	2	6	27038	27043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007948	CTT	2	6	27046	27051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007948	GCG	2	6	27068	27073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007948	GCC	2	6	27087	27092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007948	GCC	3	9	27143	27151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_007948	GCC	2	6	27170	27175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_007948	GCTT	2	8	27204	27211	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007948	GTT	2	6	27221	27226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007948	CCA	2	6	27254	27259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007948	GGC	2	6	27316	27321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007948	CAG	2	6	27340	27345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007948	GCC	2	6	27364	27369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_007948	CCG	2	6	27421	27426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_007948	GTC	2	6	27459	27464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007948	GT	3	6	27479	27484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007948	ATCAAC	2	12	27500	27511	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007948	GCC	2	6	28067	28072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007948	GCCT	2	8	28091	28098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007948	TTG	2	6	28104	28109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007948	GC	3	6	29254	29259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007948	GAC	2	6	29260	29265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007948	GCG	2	6	29356	29361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007948	GCG	2	6	29472	29477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007948	GCG	2	6	29496	29501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007948	GAA	2	6	29593	29598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007948	CGC	2	6	29614	29619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_007948	GCC	2	6	29645	29650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007948	AAG	2	6	30298	30303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007948	GGT	2	6	30440	30445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007948	CGG	2	6	30453	30458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007948	GTTG	2	8	30487	30494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007948	GGC	2	6	30583	30588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007948	GCC	2	6	30607	30612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007948	TCT	2	6	30643	30648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007948	TCAAA	2	10	30670	30679	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007948	GC	3	6	34339	34344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007948	TGT	2	6	34887	34892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007948	AAT	2	6	36839	36844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007948	GGT	2	6	36867	36872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007948	GCT	2	6	36873	36878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007948	AG	3	6	36913	36918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007948	AAT	2	6	37031	37036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007948	GGC	2	6	37056	37061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007948	CTT	2	6	37105	37110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007948	GGGGC	2	10	37116	37125	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007948	CCG	2	6	37134	37139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_007948	AG	3	6	37181	37186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007948	GTTTT	2	10	38229	38238	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007948	CAT	2	6	38253	38258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007948	GTG	2	6	38290	38295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007948	ATG	2	6	38314	38319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007948	GTA	2	6	39431	39436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007948	GAT	2	6	39502	39507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007948	CCG	2	6	39539	39544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_007948	CAGG	2	8	39621	39628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007948	TCTCC	2	10	41599	41608	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_007948	GTT	2	6	41659	41664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007948	C	6	6	43060	43065	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_007948	CTG	2	6	43113	43118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007948	GGC	2	6	43996	44001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007948	TGCAC	2	10	44067	44076	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_007948	ACC	2	6	44109	44114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_007948	GTG	2	6	44788	44793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007948	GGCA	2	8	45892	45899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007948	AGG	2	6	45995	46000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007948	G	6	6	46028	46033	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007948	GGC	2	6	46048	46053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007948	GCCG	2	8	46066	46073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007948	GCG	2	6	46144	46149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_007948	GGCA	2	8	48570	48577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_007948	GGC	2	6	48597	48602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_007948	A	9	9	51958	51966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_007948	GCG	2	6	54030	54035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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190	NC_007948	CGG	2	6	68994	68999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_007948	ATC	2	6	100710	100715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_007948	GGC	2	6	101611	101616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_007948	CCCCA	2	10	101664	101673	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
280	NC_007948	GGGA	2	8	101689	101696	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
281	NC_007948	TGAA	2	8	101711	101718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_007948	GAG	2	6	102708	102713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_007948	GCT	2	6	102741	102746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_007948	CAC	2	6	103304	103309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_007948	GACG	2	8	103359	103366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
290	NC_007948	GC	3	6	103413	103418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
291	NC_007948	CGG	2	6	103464	103469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_007948	GTCG	2	8	103655	103662	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
293	NC_007948	CTT	2	6	104206	104211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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297	NC_007948	GGA	2	6	104425	104430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_007948	GATG	2	8	104648	104655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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305	NC_007948	CGC	2	6	104715	104720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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310	NC_007948	G	6	6	109639	109644	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_007948	GTTG	2	8	110662	110669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_007948	GC	4	8	144969	144976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
393	NC_007948	AAG	2	6	144989	144994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_007948	GAG	2	6	153037	153042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_007948	CG	3	6	157929	157934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
418	NC_007948	CAT	2	6	157983	157988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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420	NC_007948	AGTC	2	8	162731	162738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
421	NC_007948	A	6	6	162745	162750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_007948	TGC	2	6	162755	162760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_007948	ATCC	2	8	162772	162779	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
424	NC_007948	CAA	2	6	162820	162825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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426	NC_007948	CCGTCA	2	12	162933	162944	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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