MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens Pf0-1 chromosome

Total Repeats: 11907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007492	AAGC	2	8	67	74	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007492	CCAA	2	8	89	96	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007492	A	6	6	157	162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007492	AAG	2	6	165	170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007492	ATT	2	6	174	179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007492	CTGT	2	8	220	227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007492	TGC	2	6	304	309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007492	TG	4	8	324	331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007492	GTT	2	6	338	343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007492	CA	3	6	422	427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007492	GTCG	2	8	430	437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007492	GAC	2	6	501	506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007492	TTA	2	6	2105	2110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007492	T	6	6	6817	6822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007492	GGT	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007492	GTG	2	6	7576	7581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007492	TTC	2	6	7649	7654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007492	GCC	2	6	7675	7680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007492	CCTGC	2	10	7696	7705	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007492	A	7	7	9294	9300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007492	AT	3	6	9338	9343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007492	AAAT	2	8	9344	9351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007492	TGA	2	6	9365	9370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007492	CAG	2	6	10811	10816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007492	GCC	2	6	14469	14474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_007492	GCACA	2	10	14479	14488	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007492	CGA	2	6	15419	15424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007492	AAAAAG	2	12	19458	19469	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007492	GCA	2	6	19477	19482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007492	TGC	2	6	20017	20022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007492	GAGC	2	8	20117	20124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007492	ATA	2	6	20157	20162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007492	GAT	2	6	21274	21279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007492	GCG	2	6	24079	24084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007492	TGC	2	6	30071	30076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007492	GCCCT	2	10	32576	32585	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_007492	AAC	3	9	32757	32765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007492	CCCG	2	8	32849	32856	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_007492	TGC	2	6	35052	35057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007492	TGA	2	6	35060	35065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007492	TG	3	6	35085	35090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007492	AAAC	2	8	36598	36605	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007492	GT	3	6	36645	36650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007492	CA	3	6	36654	36659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007492	T	6	6	36674	36679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007492	GTCA	2	8	38523	38530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007492	GAC	2	6	38562	38567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007492	CGG	2	6	40016	40021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007492	T	7	7	40039	40045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007492	ACC	2	6	40061	40066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007492	C	6	6	45908	45913	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_007492	GCG	2	6	45921	45926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007492	GCGG	2	8	45991	45998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007492	TCA	2	6	47385	47390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007492	A	6	6	47462	47467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007492	T	6	6	47542	47547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007492	GGCA	2	8	47589	47596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007492	GGTT	2	8	47627	47634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007492	T	6	6	47636	47641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007492	CGA	2	6	47655	47660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007492	TACG	2	8	47679	47686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007492	TGG	2	6	47705	47710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007492	CGCA	2	8	47761	47768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007492	GGA	2	6	48001	48006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007492	T	6	6	49094	49099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007492	A	7	7	49105	49111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007492	CAA	2	6	49113	49118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007492	GAC	2	6	49152	49157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007492	ATT	2	6	49201	49206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007492	ATT	2	6	49221	49226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007492	A	6	6	49297	49302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007492	GA	3	6	49336	49341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007492	CCG	2	6	50792	50797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_007492	GAA	2	6	54210	54215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007492	GCT	2	6	54232	54237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007492	CGGG	2	8	54261	54268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007492	CG	3	6	58806	58811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007492	CAGA	2	8	58821	58828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007492	A	6	6	58871	58876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007492	GGC	2	6	58878	58883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007492	GCAC	2	8	58952	58959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007492	CAGC	2	8	59905	59912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007492	CA	4	8	60020	60027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007492	TA	3	6	60041	60046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007492	GCC	2	6	60097	60102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007492	A	7	7	60772	60778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007492	GGGA	2	8	60796	60803	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007492	ACA	2	6	60867	60872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007492	A	6	6	60949	60954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007492	CGG	2	6	63873	63878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007492	GAC	2	6	63906	63911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007492	GGC	2	6	64257	64262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007492	A	6	6	65244	65249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007492	T	7	7	65272	65278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007492	ATA	2	6	66235	66240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007492	TCG	2	6	66257	66262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007492	T	6	6	68327	68332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007492	AG	3	6	68341	68346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007492	GGCAC	2	10	71306	71315	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007492	AGT	2	6	71337	71342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007492	T	6	6	71368	71373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007492	AAAT	2	8	71417	71424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007492	GC	3	6	71456	71461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007492	CTCC	2	8	75314	75321	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_007492	T	6	6	75399	75404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007492	CCGA	2	8	75479	75486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007492	TGC	2	6	75539	75544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007492	TTC	2	6	75563	75568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007492	CTCC	2	8	75591	75598	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_007492	AGTG	2	8	79562	79569	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007492	TTC	2	6	79609	79614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007492	GCT	2	6	79890	79895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007492	CCG	2	6	84221	84226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_007492	TGC	2	6	84286	84291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007492	TCA	2	6	84307	84312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007492	GTG	2	6	84432	84437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007492	AAT	2	6	84472	84477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007492	TTC	2	6	86789	86794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007492	CGGC	2	8	86825	86832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007492	AGG	2	6	86853	86858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007492	GTCA	2	8	87685	87692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007492	GT	3	6	87751	87756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007492	A	6	6	87767	87772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007492	TCA	2	6	92822	92827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007492	ATG	2	6	92924	92929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007492	A	7	7	92975	92981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007492	CTTC	2	8	95786	95793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007492	GGT	2	6	95840	95845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007492	ACC	2	6	95854	95859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007492	CGA	2	6	95866	95871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007492	GGT	2	6	95881	95886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007492	AG	4	8	98305	98312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007492	TTTC	2	8	98869	98876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007492	AGC	2	6	101838	101843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007492	GC	3	6	101842	101847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007492	GCT	2	6	101864	101869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007492	CCT	2	6	102370	102375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007492	CGC	2	6	102393	102398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_007492	CGT	2	6	102401	102406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007492	T	6	6	102474	102479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007492	AC	3	6	102574	102579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007492	A	6	6	103628	103633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007492	ATTA	2	8	103917	103924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007492	GC	3	6	103996	104001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007492	AGC	2	6	104272	104277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007492	CAAC	2	8	104355	104362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007492	AC	3	6	104361	104366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007492	TCA	2	6	104372	104377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_007492	A	6	6	108349	108354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_007492	TTA	2	6	111613	111618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_007492	CT	3	6	112071	112076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_007492	GAT	2	6	112192	112197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_007492	AC	3	6	122855	122860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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278	NC_007492	TTC	2	6	140630	140635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_007492	TCG	2	6	140758	140763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_007492	TGACCG	2	12	140848	140859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_007492	G	6	6	140862	140867	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
285	NC_007492	GGGA	2	8	140910	140917	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
286	NC_007492	AGA	2	6	141708	141713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_007492	GAT	2	6	141746	141751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_007492	GCC	2	6	234136	234141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
425	NC_007492	AGC	2	6	234169	234174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_007492	CCA	3	9	234463	234471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
427	NC_007492	CGC	2	6	238305	238310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
428	NC_007492	GAGC	2	8	238375	238382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
429	NC_007492	TCC	2	6	238929	238934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
430	NC_007492	GCTC	2	8	238968	238975	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
431	NC_007492	CAGG	2	8	238979	238986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
432	NC_007492	TGT	2	6	239745	239750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
433	NC_007492	CCG	2	6	240697	240702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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436	NC_007492	TA	3	6	242951	242956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_007492	AAT	2	6	250968	250973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_007492	GAA	2	6	251034	251039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_007492	CTC	2	6	251163	251168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
444	NC_007492	CCG	2	6	251174	251179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
445	NC_007492	CGA	2	6	253212	253217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_007492	ATAG	2	8	253294	253301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
448	NC_007492	GTT	2	6	253305	253310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
449	NC_007492	CATG	2	8	256105	256112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_007492	ATAA	3	12	257165	257176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_007492	T	6	6	257213	257218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_007492	GGT	2	6	259597	259602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_007492	ACA	2	6	259686	259691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
457	NC_007492	CAT	3	9	259694	259702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
458	NC_007492	TAAG	2	8	259768	259775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
459	NC_007492	GTA	2	6	260378	260383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
460	NC_007492	TGA	2	6	260401	260406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
461	NC_007492	AAT	2	6	260458	260463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_007492	AAT	2	6	260471	260476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_007492	TTTTCT	2	12	260497	260508	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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465	NC_007492	TA	3	6	260635	260640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_007492	A	6	6	260650	260655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_007492	ACG	2	6	262903	262908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_007492	A	6	6	264557	264562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_007492	CAG	2	6	264586	264591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_007492	GCG	2	6	284201	284206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_007492	GGT	2	6	284222	284227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_007492	GGTT	2	8	284306	284313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_007492	AT	4	8	285484	285491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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