MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A large plasmid

Total Repeats: 789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007274	CGG	2	6	34	39	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007274	AC	3	6	92	97	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007274	ATC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007274	TGC	2	6	1910	1915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007274	ACC	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007274	CTG	2	6	1954	1959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007274	TG	3	6	1967	1972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007274	AGGT	2	8	1982	1989	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007274	T	6	6	2047	2052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007274	TCT	2	6	2097	2102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007274	CCA	2	6	2129	2134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_007274	GCG	3	9	2184	2192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007274	CAG	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007274	GCC	2	6	2253	2258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_007274	GCC	2	6	2311	2316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_007274	GCC	2	6	2355	2360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_007274	CGC	2	6	2405	2410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_007274	GGC	2	6	2413	2418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007274	GCC	2	6	2435	2440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007274	AGC	2	6	2459	2464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007274	AGA	2	6	2475	2480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007274	GCC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_007274	CTC	2	6	2517	2522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007274	GAG	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007274	GT	3	6	2576	2581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007274	AGC	3	9	2599	2607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007274	ATG	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007274	CTG	2	6	2672	2677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007274	ATG	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007274	TGG	2	6	3278	3283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007274	GCT	2	6	3305	3310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007274	CCTA	2	8	5054	5061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007274	T	6	6	5062	5067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007274	AAC	2	6	5209	5214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007274	ATA	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007274	CT	3	6	5293	5298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007274	ATTG	2	8	5300	5307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007274	TTGG	2	8	5659	5666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007274	CCA	2	6	5686	5691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007274	CAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007274	G	10	10	5745	5754	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007274	C	6	6	5780	5785	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_007274	GCC	2	6	5860	5865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_007274	CTC	2	6	5896	5901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_007274	CG	3	6	5915	5920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007274	GTC	2	6	5924	5929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007274	CG	3	6	5957	5962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007274	TCC	2	6	5980	5985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_007274	CTG	2	6	6152	6157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007274	TCT	2	6	6210	6215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007274	A	9	9	6240	6248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007274	AAT	2	6	6273	6278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007274	ATT	3	9	6284	6292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007274	T	6	6	6357	6362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007274	TC	3	6	6709	6714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007274	GTG	2	6	6743	6748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007274	CAGC	2	8	6836	6843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007274	GCGA	2	8	6899	6906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007274	TCG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007274	GT	3	6	7018	7023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007274	GTG	2	6	7032	7037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007274	GTCT	2	8	7070	7077	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007274	CA	3	6	7102	7107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007274	CCT	2	6	10747	10752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_007274	CTG	2	6	10765	10770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007274	TG	3	6	10769	10774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007274	GCAA	2	8	10775	10782	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007274	TCA	2	6	10796	10801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007274	GCTC	2	8	10817	10824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007274	ATC	2	6	10870	10875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007274	GCT	2	6	10896	10901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007274	AC	3	6	10919	10924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007274	CAAT	2	8	10953	10960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007274	GAG	2	6	10978	10983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007274	GGC	2	6	10984	10989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007274	A	6	6	11143	11148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007274	GCC	2	6	11279	11284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_007274	GGTG	2	8	11331	11338	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007274	CGGC	2	8	11359	11366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007274	CA	3	6	11382	11387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007274	CATC	2	8	11450	11457	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007274	TCAG	2	8	11502	11509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007274	CAC	2	6	11518	11523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007274	TGG	2	6	11587	11592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007274	GAA	2	6	11617	11622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007274	A	6	6	11669	11674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007274	CCG	2	6	11675	11680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_007274	GTC	2	6	11691	11696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007274	ACCT	2	8	11732	11739	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007274	CA	3	6	11749	11754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007274	CAG	2	6	11762	11767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007274	TGC	2	6	11790	11795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007274	GTG	2	6	11801	11806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007274	GAT	2	6	11833	11838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007274	T	7	7	12184	12190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007274	CAGG	2	8	12218	12225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007274	TCC	2	6	12862	12867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007274	T	6	6	12921	12926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007274	GTT	2	6	13046	13051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007274	ATC	2	6	13269	13274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007274	TGC	2	6	13296	13301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007274	GCA	2	6	13312	13317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007274	CTG	2	6	13340	13345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007274	AGGT	2	8	13368	13375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007274	GAC	2	6	13411	13416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007274	CGG	2	6	13427	13432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007274	T	6	6	13433	13438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007274	TCT	2	6	13483	13488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007274	ACC	2	6	13514	13519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007274	G	16	16	13574	13589	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007274	GGT	2	6	13592	13597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007274	ACTG	2	8	13606	13613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007274	GATG	2	8	13659	13666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007274	CCCA	2	8	13703	13710	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_007274	GCCG	2	8	13750	13757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007274	GGC	2	6	13832	13837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007274	TTG	2	6	14004	14009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007274	T	6	6	14197	14202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007274	GCC	2	6	14356	14361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_007274	GAG	2	6	14368	14373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007274	ATTG	2	8	14385	14392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007274	GT	3	6	14421	14426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007274	AGC	3	9	14443	14451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007274	ATG	2	6	14470	14475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007274	AAT	2	6	14479	14484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007274	CTG	2	6	14516	14521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007274	GCT	2	6	14680	14685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007274	CGAC	2	8	14686	14693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007274	AG	3	6	14806	14811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007274	AGG	2	6	14816	14821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007274	AAC	2	6	16604	16609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007274	TCA	2	6	16613	16618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007274	CTA	2	6	16734	16739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007274	AGT	2	6	16743	16748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007274	TCA	2	6	16758	16763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007274	CGAC	2	8	16798	16805	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_007274	GTTTA	2	10	16952	16961	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007274	A	6	6	16967	16972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007274	CT	3	6	17009	17014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007274	TTC	2	6	17098	17103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007274	ATC	2	6	17159	17164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007274	GATT	2	8	17180	17187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007274	GAT	2	6	17296	17301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007274	GCT	2	6	17415	17420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007274	GCC	2	6	17518	17523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_007274	AAT	2	6	17608	17613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007274	ATA	2	6	18060	18065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007274	TAAAA	2	10	18096	18105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007274	CAAA	2	8	18155	18162	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_007274	CCG	2	6	18215	18220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_007274	CGG	2	6	18309	18314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_007274	AGA	2	6	18339	18344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007274	A	6	6	18348	18353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007274	AGCA	2	8	18356	18363	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_007274	TGACCT	2	12	18364	18375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_007274	CGC	2	6	18376	18381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_007274	CTT	2	6	18743	18748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_007274	GC	3	6	19380	19385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_007274	GC	3	6	19398	19403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
160	NC_007274	GCG	2	6	19513	19518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_007274	GCC	2	6	19581	19586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_007274	GCA	2	6	19618	19623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_007274	ATC	2	6	19665	19670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_007274	GATT	2	8	19686	19693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_007274	ATT	2	6	19720	19725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_007274	ATT	2	6	19782	19787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_007274	TCGC	2	8	19797	19804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
168	NC_007274	T	6	6	19854	19859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_007274	TGA	2	6	20844	20849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_007274	ACG	2	6	20918	20923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_007274	GCA	2	6	22250	22255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_007274	GCT	2	6	22261	22266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_007274	CGG	2	6	22826	22831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_007274	TGC	2	6	24905	24910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_007274	GC	3	6	25001	25006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
179	NC_007274	ACG	2	6	25047	25052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_007274	CGT	2	6	25659	25664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_007274	TCA	2	6	25760	25765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_007274	GTA	2	6	25798	25803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_007274	CTT	2	6	25818	25823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_007274	GTA	2	6	25893	25898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_007274	T	6	6	25902	25907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_007274	AAG	2	6	25928	25933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_007274	CCA	2	6	25977	25982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_007274	TGA	2	6	26011	26016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_007274	ATC	2	6	26119	26124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_007274	ACACG	2	10	26198	26207	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
193	NC_007274	TAT	2	6	26298	26303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_007274	CCT	2	6	26334	26339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
195	NC_007274	ACA	2	6	26395	26400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_007274	CCT	2	6	28788	28793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
197	NC_007274	CAA	2	6	28942	28947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_007274	CTTTA	2	10	29992	30001	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
199	NC_007274	GC	3	6	30033	30038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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280	NC_007274	AGGT	2	8	38146	38153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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