MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A chromosome

Total Repeats: 16720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_005773	CA	3	6	5005956	5005961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14002	NC_005773	T	6	6	5006050	5006055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_005773	GCTC	2	8	5007706	5007713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14004	NC_005773	TCC	2	6	5007729	5007734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14005	NC_005773	AGC	2	6	5007790	5007795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_005773	TGAA	2	8	5009208	5009215	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_005773	TGC	2	6	5009260	5009265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_005773	GTT	2	6	5009286	5009291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_005773	C	7	7	5009302	5009308	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14010	NC_005773	AAG	2	6	5009311	5009316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_005773	GCA	2	6	5009334	5009339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_005773	CAGC	2	8	5009390	5009397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14013	NC_005773	TGA	2	6	5010478	5010483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_005773	CGC	2	6	5011830	5011835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14015	NC_005773	GAAT	2	8	5011850	5011857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_005773	CA	3	6	5011928	5011933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14017	NC_005773	TTC	2	6	5011950	5011955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_005773	GCC	2	6	5011970	5011975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14019	NC_005773	AGA	2	6	5016814	5016819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_005773	ATC	2	6	5017183	5017188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14021	NC_005773	GCT	2	6	5017210	5017215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_005773	CGCAC	2	10	5017371	5017380	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14023	NC_005773	GGC	2	6	5020136	5020141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_005773	AGC	2	6	5021985	5021990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_005773	GCTC	2	8	5022015	5022022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14026	NC_005773	ATT	2	6	5022097	5022102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_005773	GGA	2	6	5023720	5023725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_005773	CAAA	2	8	5023781	5023788	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14029	NC_005773	CTT	2	6	5023814	5023819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14030	NC_005773	GCG	2	6	5023826	5023831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_005773	AGT	2	6	5025846	5025851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_005773	GCTGC	2	10	5027202	5027211	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14033	NC_005773	TCC	2	6	5027228	5027233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14034	NC_005773	TTG	2	6	5027235	5027240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_005773	TG	3	6	5033261	5033266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_005773	ACA	2	6	5036226	5036231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_005773	TTA	2	6	5036278	5036283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_005773	CCTG	2	8	5036304	5036311	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14039	NC_005773	GTGA	2	8	5038410	5038417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_005773	T	6	6	5043752	5043757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_005773	ACT	2	6	5046862	5046867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_005773	ACA	2	6	5046918	5046923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_005773	ACA	2	6	5046950	5046955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_005773	AATC	2	8	5046983	5046990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14045	NC_005773	CAA	2	6	5048952	5048957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_005773	TGGC	2	8	5049407	5049414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14047	NC_005773	CTT	2	6	5049422	5049427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_005773	ACTGTG	2	12	5051396	5051407	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14049	NC_005773	GCTC	2	8	5051511	5051518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14050	NC_005773	GTA	3	9	5053085	5053093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_005773	CCCTT	2	10	5053154	5053163	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
14052	NC_005773	GCA	2	6	5053209	5053214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_005773	GAT	2	6	5055456	5055461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_005773	GCG	2	6	5055482	5055487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_005773	CTGA	2	8	5060634	5060641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14056	NC_005773	TTGG	3	12	5060642	5060653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_005773	GCG	2	6	5060680	5060685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_005773	GTG	3	9	5060825	5060833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_005773	GCG	2	6	5060880	5060885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_005773	GTG	3	9	5061025	5061033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_005773	GCG	2	6	5061080	5061085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_005773	GTG	3	9	5061225	5061233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_005773	GCG	2	6	5061280	5061285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_005773	GTG	3	9	5061425	5061433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_005773	GCG	2	6	5061479	5061484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_005773	CTGC	2	8	5065115	5065122	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14067	NC_005773	CAA	2	6	5065157	5065162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_005773	CTGCGT	2	12	5065198	5065209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_005773	TGT	2	6	5065222	5065227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_005773	ACGG	2	8	5065294	5065301	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14071	NC_005773	CGT	2	6	5065305	5065310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_005773	CCG	2	6	5065311	5065316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14073	NC_005773	GGC	2	6	5070067	5070072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_005773	ACT	2	6	5071899	5071904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_005773	GCT	2	6	5071908	5071913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14076	NC_005773	GGT	2	6	5072861	5072866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_005773	CCT	2	6	5072899	5072904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14078	NC_005773	GCA	2	6	5072906	5072911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14079	NC_005773	TGT	2	6	5074803	5074808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_005773	GT	3	6	5077234	5077239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_005773	TGT	2	6	5077272	5077277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_005773	GCCG	2	8	5077320	5077327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14083	NC_005773	CCG	2	6	5078248	5078253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14084	NC_005773	T	6	6	5079852	5079857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_005773	GAT	2	6	5079870	5079875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_005773	T	7	7	5081271	5081277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_005773	CTT	2	6	5081283	5081288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_005773	CTG	2	6	5082945	5082950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_005773	CGG	2	6	5082969	5082974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14090	NC_005773	AGGC	2	8	5084354	5084361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14091	NC_005773	TCAC	2	8	5084396	5084403	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14092	NC_005773	CA	3	6	5087223	5087228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14093	NC_005773	CTG	3	9	5087259	5087267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14094	NC_005773	AAAT	2	8	5090818	5090825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_005773	GC	4	8	5090896	5090903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14096	NC_005773	GAAA	2	8	5090943	5090950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_005773	A	6	6	5090970	5090975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_005773	GAA	2	6	5090995	5091000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_005773	AGC	2	6	5091015	5091020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_005773	TAT	2	6	5095568	5095573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_005773	AGGT	2	8	5095625	5095632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_005773	AAC	2	6	5098699	5098704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_005773	GCTC	2	8	5098791	5098798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14104	NC_005773	GC	3	6	5099317	5099322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14105	NC_005773	A	7	7	5100333	5100339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_005773	ACG	2	6	5100346	5100351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_005773	GC	3	6	5100352	5100357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14108	NC_005773	GC	3	6	5100369	5100374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14109	NC_005773	TGA	2	6	5101826	5101831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_005773	TCC	2	6	5101834	5101839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14111	NC_005773	TGC	2	6	5101915	5101920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_005773	ATGAA	2	10	5101971	5101980	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_005773	ATC	2	6	5102005	5102010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_005773	CAT	2	6	5102011	5102016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14115	NC_005773	CCG	2	6	5105685	5105690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14116	NC_005773	A	7	7	5105701	5105707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_005773	CAA	2	6	5107013	5107018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_005773	T	8	8	5107084	5107091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_005773	GGC	2	6	5107113	5107118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14120	NC_005773	AC	3	6	5107211	5107216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14121	NC_005773	TCAA	2	8	5107217	5107224	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14122	NC_005773	GC	3	6	5110779	5110784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14123	NC_005773	ATTACG	2	12	5110823	5110834	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14124	NC_005773	CGA	2	6	5110842	5110847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14125	NC_005773	TGC	2	6	5111580	5111585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14126	NC_005773	ACC	2	6	5112729	5112734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14127	NC_005773	TACA	2	8	5114503	5114510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14128	NC_005773	CGC	2	6	5114624	5114629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14129	NC_005773	GT	3	6	5114658	5114663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14131	NC_005773	CGC	2	6	5114722	5114727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14132	NC_005773	TTG	2	6	5116519	5116524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14134	NC_005773	CTG	2	6	5116870	5116875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14139	NC_005773	GCCG	2	8	5119254	5119261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14245	NC_005773	TAC	2	6	5164687	5164692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14246	NC_005773	AC	3	6	5164691	5164696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14247	NC_005773	GCA	2	6	5171575	5171580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14249	NC_005773	CAG	2	6	5171665	5171670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14250	NC_005773	A	6	6	5172295	5172300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_005773	A	7	7	5172326	5172332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14252	NC_005773	AAC	2	6	5172453	5172458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14253	NC_005773	AGG	2	6	5172514	5172519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14254	NC_005773	TGA	2	6	5175483	5175488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14256	NC_005773	T	6	6	5175634	5175639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14392	NC_005773	TTAC	2	8	5243004	5243011	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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