MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. pastoris str. CCMP1986 chromosome

Total Repeats: 5985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005072	ACA	2	6	4	9	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_005072	ACT	4	12	44	55	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005072	ATT	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005072	AAT	2	6	126	131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005072	TAAA	2	8	153	160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005072	TAAA	2	8	8380	8387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005072	TAT	2	6	10225	10230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005072	TAA	2	6	10263	10268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005072	TAA	2	6	10271	10276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005072	AATTTA	2	12	10279	10290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005072	AT	3	6	10301	10306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005072	AAT	2	6	11751	11756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005072	T	6	6	11756	11761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005072	TAA	2	6	11768	11773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005072	A	6	6	11782	11787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005072	TAAT	2	8	13121	13128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005072	T	8	8	13128	13135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005072	T	6	6	14528	14533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005072	AT	3	6	14539	14544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005072	AAT	2	6	14547	14552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005072	TTA	2	6	14556	14561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005072	AATT	2	8	15970	15977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005072	ACA	2	6	15982	15987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_005072	GTAT	2	8	15990	15997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005072	AAT	2	6	16006	16011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005072	AT	3	6	17698	17703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005072	TTCA	2	8	18248	18255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_005072	TAA	2	6	18265	18270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005072	TAT	2	6	19025	19030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005072	A	6	6	21618	21623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005072	A	6	6	24017	24022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005072	T	7	7	24029	24035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005072	ATT	2	6	24057	24062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005072	TAA	2	6	24067	24072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005072	A	6	6	24076	24081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005072	A	6	6	24135	24140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005072	ATT	2	6	30935	30940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005072	T	6	6	30985	30990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005072	ATT	2	6	30991	30996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005072	AT	3	6	31022	31027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005072	TAA	2	6	31048	31053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005072	ATA	2	6	31054	31059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005072	T	6	6	31524	31529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005072	TA	3	6	31537	31542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005072	TAA	2	6	32112	32117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005072	AT	3	6	32199	32204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005072	ATA	2	6	32308	32313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005072	TAAT	2	8	33702	33709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005072	TAG	2	6	33725	33730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005072	TAAA	2	8	34899	34906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005072	T	6	6	36524	36529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005072	T	6	6	36539	36544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005072	ATT	2	6	36550	36555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005072	A	6	6	37282	37287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005072	ATT	2	6	37292	37297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005072	TAAA	2	8	37319	37326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005072	TAAA	2	8	37979	37986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005072	ATT	2	6	37994	37999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005072	TGA	2	6	38001	38006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005072	TAT	2	6	38016	38021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005072	AGTTT	2	10	38040	38049	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005072	AGAA	2	8	38087	38094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005072	AT	3	6	38099	38104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005072	A	6	6	38166	38171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005072	ATT	2	6	38182	38187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005072	T	6	6	40038	40043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005072	AAT	2	6	40584	40589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005072	ATTT	2	8	42406	42413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005072	TAT	2	6	44206	44211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005072	T	7	7	44271	44277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005072	ATT	2	6	44286	44291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005072	TA	3	6	48913	48918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005072	TTTTA	2	10	48947	48956	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005072	ACC	2	6	48975	48980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_005072	AGA	2	6	48985	48990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005072	ATT	2	6	50595	50600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005072	AG	3	6	50654	50659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005072	TAA	2	6	52768	52773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005072	AGAA	2	8	52798	52805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005072	TTA	2	6	52809	52814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005072	AATTT	2	10	52817	52826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005072	A	6	6	52829	52834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005072	GATT	2	8	52835	52842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005072	AGC	2	6	54081	54086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_005072	AATAA	2	10	54161	54170	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005072	ACT	2	6	54237	54242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_005072	T	6	6	54916	54921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005072	AAT	2	6	54946	54951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005072	ATT	2	6	54971	54976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005072	AT	3	6	55021	55026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005072	T	6	6	56059	56064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005072	T	6	6	56069	56074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005072	ATT	2	6	56080	56085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005072	TAA	2	6	56149	56154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005072	T	6	6	56168	56173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005072	T	6	6	56194	56199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005072	T	7	7	56214	56220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005072	TCT	2	6	56226	56231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_005072	A	6	6	56255	56260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005072	ATT	2	6	56274	56279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005072	TGG	2	6	56337	56342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005072	AGC	2	6	56410	56415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_005072	GGCA	2	8	56614	56621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_005072	T	6	6	56651	56656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005072	T	9	9	58701	58709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005072	A	6	6	58713	58718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005072	CATTT	2	10	58744	58753	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_005072	TAA	2	6	58769	58774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005072	ATTAA	2	10	58801	58810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005072	T	6	6	58812	58817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005072	TCA	2	6	58821	58826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_005072	GCA	2	6	58841	58846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_005072	ATT	2	6	58847	58852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005072	AGC	3	9	58891	58899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_005072	TATT	2	8	58923	58930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005072	T	6	6	58972	58977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005072	TGAT	2	8	59008	59015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005072	AAATA	2	10	59021	59030	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005072	TGA	2	6	59037	59042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005072	TAA	2	6	59434	59439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005072	T	6	6	59451	59456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005072	CTTA	2	8	59471	59478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_005072	T	6	6	63087	63092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005072	ATA	2	6	65605	65610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005072	TA	3	6	65653	65658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005072	T	6	6	65688	65693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005072	ATAA	3	12	65701	65712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005072	AATT	2	8	65808	65815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005072	AATTT	2	10	65827	65836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005072	TAA	2	6	67540	67545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005072	TAT	2	6	67573	67578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005072	AATTT	2	10	67587	67596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005072	A	6	6	67598	67603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005072	TA	4	8	67817	67824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005072	A	6	6	67845	67850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005072	A	7	7	67863	67869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005072	T	6	6	71030	71035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005072	AGTA	2	8	71048	71055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005072	TTAT	2	8	71366	71373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005072	TTA	2	6	71747	71752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005072	AAT	2	6	71753	71758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005072	A	8	8	72372	72379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005072	AATT	2	8	77669	77676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005072	AT	3	6	79171	79176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005072	AATTA	2	10	79201	79210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005072	A	6	6	79210	79215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005072	GAA	2	6	79596	79601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005072	A	6	6	79600	79605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005072	TTG	2	6	79613	79618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005072	TAA	2	6	79638	79643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_005072	A	6	6	79649	79654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_005072	T	6	6	227856	227861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_005072	AT	3	6	227883	227888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_005072	ATG	2	6	227953	227958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NC_005072	T	6	6	227966	227971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_005072	ACC	2	6	228287	228292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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439	NC_005072	TTA	2	6	228355	228360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_005072	TAA	2	6	228485	228490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_005072	T	6	6	228630	228635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_005072	AAT	2	6	229331	229336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_005072	TAAA	2	8	230184	230191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_005072	TTA	2	6	233941	233946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_005072	TTA	2	6	233949	233954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_005072	AAT	2	6	234009	234014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_005072	ATT	2	6	236009	236014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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