MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 4711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_005042	AGTC	2	8	1414337	1414344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_005042	CTT	2	6	1414349	1414354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_005042	AGA	2	6	1414392	1414397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_005042	TGA	2	6	1414434	1414439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_005042	AAT	2	6	1414440	1414445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_005042	T	6	6	1415391	1415396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_005042	CTAG	2	8	1415442	1415449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_005042	TAA	2	6	1415498	1415503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_005042	TA	3	6	1415562	1415567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_005042	AG	3	6	1415573	1415578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_005042	GAA	2	6	1415767	1415772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_005042	A	6	6	1415791	1415796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_005042	ACA	2	6	1415822	1415827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_005042	CTA	2	6	1415844	1415849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_005042	A	7	7	1415907	1415913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_005042	GAA	2	6	1415937	1415942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_005042	CAG	3	9	1416005	1416013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_005042	AT	3	6	1416071	1416076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_005042	GA	3	6	1416085	1416090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_005042	TAA	2	6	1416093	1416098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_005042	AGAA	2	8	1416138	1416145	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_005042	TAG	2	6	1416162	1416167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_005042	TCC	2	6	1416477	1416482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_005042	TGGA	2	8	1416484	1416491	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_005042	ATCA	2	8	1416553	1416560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4026	NC_005042	ATA	2	6	1416769	1416774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_005042	TCC	2	6	1417890	1417895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_005042	TA	3	6	1418019	1418024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_005042	TTC	2	6	1418026	1418031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_005042	CAT	2	6	1418038	1418043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_005042	ATA	2	6	1418070	1418075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_005042	GAA	2	6	1418529	1418534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_005042	TAA	2	6	1418623	1418628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_005042	CCT	2	6	1418651	1418656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_005042	ATG	2	6	1418758	1418763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_005042	GCA	2	6	1418789	1418794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_005042	CTG	2	6	1418947	1418952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_005042	GTA	2	6	1418981	1418986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_005042	GTT	2	6	1419387	1419392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_005042	ATT	2	6	1419420	1419425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_005042	TAT	2	6	1419428	1419433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_005042	TCCT	2	8	1419659	1419666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_005042	ATC	2	6	1419697	1419702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_005042	ACA	2	6	1419704	1419709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_005042	TCC	2	6	1419717	1419722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_005042	ATGG	2	8	1419723	1419730	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_005042	ATA	2	6	1420008	1420013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_005042	GGTT	2	8	1420039	1420046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_005042	AAT	2	6	1420383	1420388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_005042	GGA	2	6	1420414	1420419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_005042	TACTT	2	10	1420449	1420458	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4052	NC_005042	GA	3	6	1420531	1420536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_005042	A	7	7	1420543	1420549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_005042	A	6	6	1420620	1420625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_005042	GAA	2	6	1420628	1420633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_005042	A	7	7	1420667	1420673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_005042	TCA	2	6	1420764	1420769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_005042	AGAAA	2	10	1420986	1420995	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_005042	ATT	2	6	1421118	1421123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_005042	GGC	2	6	1421126	1421131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_005042	TGT	2	6	1421138	1421143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_005042	CA	3	6	1421564	1421569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_005042	CA	3	6	1421575	1421580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_005042	TGGCA	2	10	1421602	1421611	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4065	NC_005042	ACT	2	6	1421619	1421624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_005042	GTG	2	6	1421648	1421653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_005042	AAC	2	6	1421706	1421711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_005042	CAA	2	6	1421724	1421729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_005042	TAG	2	6	1421731	1421736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_005042	GAA	2	6	1421752	1421757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_005042	TCA	2	6	1421763	1421768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_005042	ATCGC	2	10	1421796	1421805	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4073	NC_005042	GAC	3	9	1421822	1421830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_005042	ACG	2	6	1421856	1421861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_005042	CTTAA	2	10	1422707	1422716	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4076	NC_005042	AGCGA	2	10	1422752	1422761	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4077	NC_005042	AC	3	6	1422797	1422802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_005042	TGA	2	6	1422837	1422842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_005042	GATA	2	8	1422895	1422902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_005042	GTTA	2	8	1422903	1422910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_005042	CTT	2	6	1423032	1423037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_005042	CA	4	8	1423038	1423045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_005042	GCT	2	6	1423136	1423141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_005042	AGC	2	6	1423156	1423161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_005042	AGGA	2	8	1423168	1423175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_005042	GCT	2	6	1423201	1423206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_005042	AATTA	2	10	1423209	1423218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_005042	A	6	6	1423224	1423229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_005042	AGAAA	2	10	1423376	1423385	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_005042	TCT	2	6	1423487	1423492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_005042	CGA	2	6	1423571	1423576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_005042	ATTC	2	8	1424233	1424240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_005042	AGG	2	6	1424259	1424264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_005042	CAA	2	6	1424271	1424276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_005042	CTT	2	6	1424383	1424388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_005042	TG	3	6	1424487	1424492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_005042	A	6	6	1424498	1424503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_005042	CAAC	2	8	1424557	1424564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_005042	T	6	6	1424565	1424570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_005042	ACTAA	2	10	1424583	1424592	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4101	NC_005042	A	7	7	1424591	1424597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_005042	TGG	2	6	1424612	1424617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_005042	TCA	2	6	1424698	1424703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_005042	AAATA	2	10	1424741	1424750	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_005042	T	6	6	1424784	1424789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_005042	TA	3	6	1424800	1424805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_005042	AT	3	6	1425510	1425515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_005042	A	7	7	1425525	1425531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_005042	T	7	7	1425562	1425568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_005042	AGA	2	6	1425578	1425583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_005042	CTTC	2	8	1425599	1425606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_005042	ATT	2	6	1425614	1425619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_005042	A	7	7	1425639	1425645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_005042	CAG	2	6	1425646	1425651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_005042	TAT	2	6	1425715	1425720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_005042	CAAAA	2	10	1425772	1425781	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4117	NC_005042	ACT	2	6	1425798	1425803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_005042	AAG	2	6	1425838	1425843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_005042	TAA	2	6	1425882	1425887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_005042	GAA	2	6	1426338	1426343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_005042	A	7	7	1426446	1426452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_005042	ATA	2	6	1426467	1426472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_005042	A	6	6	1426482	1426487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_005042	GTAT	2	8	1426490	1426497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_005042	TAAA	2	8	1426599	1426606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_005042	A	7	7	1426632	1426638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_005042	TTA	2	6	1426700	1426705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_005042	ACA	2	6	1426728	1426733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_005042	TAA	2	6	1426739	1426744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_005042	ATT	2	6	1426753	1426758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_005042	CATC	2	8	1426777	1426784	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4132	NC_005042	AAG	2	6	1426801	1426806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_005042	CCTT	2	8	1426816	1426823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4134	NC_005042	TCAA	2	8	1426829	1426836	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4135	NC_005042	GAT	2	6	1426867	1426872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_005042	A	6	6	1426986	1426991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_005042	ATC	2	6	1429455	1429460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4138	NC_005042	CTC	2	6	1429479	1429484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4139	NC_005042	TGG	2	6	1429496	1429501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_005042	TCCAAT	2	12	1429544	1429555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_005042	TA	3	6	1429645	1429650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_005042	TTGA	2	8	1430879	1430886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_005042	CA	3	6	1430926	1430931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4144	NC_005042	ACT	2	6	1430972	1430977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4146	NC_005042	TCA	2	6	1431512	1431517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4147	NC_005042	AG	4	8	1431571	1431578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_005042	CAA	2	6	1431580	1431585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4149	NC_005042	TTCA	2	8	1431597	1431604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4150	NC_005042	TCT	2	6	1431626	1431631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4151	NC_005042	ATG	2	6	1431643	1431648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_005042	CT	3	6	1431651	1431656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4153	NC_005042	ATC	2	6	1431658	1431663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4154	NC_005042	CAA	2	6	1431681	1431686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4155	NC_005042	CAT	2	6	1431690	1431695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4156	NC_005042	ATT	2	6	1431700	1431705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4158	NC_005042	AAGA	2	8	1432011	1432018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_005042	TCT	2	6	1432021	1432026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4162	NC_005042	TAA	2	6	1432228	1432233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_005042	ATG	2	6	1432281	1432286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4164	NC_005042	TTC	2	6	1432318	1432323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4167	NC_005042	AG	3	6	1432394	1432399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_005042	GAA	2	6	1432412	1432417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4170	NC_005042	CA	3	6	1432467	1432472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4171	NC_005042	ACTA	2	8	1432509	1432516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4211	NC_005042	TTGAT	2	10	1442861	1442870	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4212	NC_005042	GAT	2	6	1442894	1442899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4220	NC_005042	CAAT	2	8	1444927	1444934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4221	NC_005042	TAA	2	6	1444942	1444947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4222	NC_005042	TCCAA	2	10	1444976	1444985	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4230	NC_005042	AAG	2	6	1445326	1445331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_005042	A	6	6	1445336	1445341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_005042	A	6	6	1447057	1447062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_005042	TTAA	2	8	1447070	1447077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_005042	AAC	3	9	1447487	1447495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4245	NC_005042	TTC	2	6	1452391	1452396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4248	NC_005042	GAAG	2	8	1462065	1462072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_005042	GAAG	2	8	1462076	1462083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_005042	GAAA	2	8	1462089	1462096	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_005042	GTT	2	6	1462103	1462108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_005042	AATGA	2	10	1463674	1463683	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_005042	TCAAA	2	10	1463688	1463697	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4254	NC_005042	GA	3	6	1464055	1464060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_005042	TTAA	2	8	1464099	1464106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_005042	GAA	2	6	1464116	1464121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_005042	AAT	2	6	1464155	1464160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_005042	ACA	2	6	1464170	1464175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_005042	A	6	6	1464916	1464921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_005042	ACC	2	6	1464966	1464971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4261	NC_005042	GCA	2	6	1465512	1465517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_005042	A	7	7	1465521	1465527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_005042	CGA	2	6	1465600	1465605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4264	NC_005042	ATT	2	6	1465632	1465637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4266	NC_005042	A	6	6	1465710	1465715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_005042	A	6	6	1465781	1465786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_005042	A	6	6	1465805	1465810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4396	NC_005042	T	7	7	1546177	1546183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4442	NC_005042	ATCA	2	8	1566852	1566859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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