MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 4711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005042	TGA	2	6	524038	524043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_005042	GAG	2	6	525880	525885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_005042	TTA	2	6	525888	525893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_005042	CTC	2	6	525894	525899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_005042	AGA	2	6	526367	526372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_005042	A	6	6	530874	530879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_005042	ATT	2	6	530881	530886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_005042	AATTT	2	10	530890	530899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_005042	ACTT	2	8	531446	531453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_005042	GAT	2	6	531468	531473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_005042	A	6	6	532471	532476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_005042	TTCAA	2	10	533309	533318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_005042	T	6	6	535790	535795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_005042	T	6	6	537709	537714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_005042	TGT	2	6	537728	537733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_005042	TAA	2	6	537777	537782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_005042	TGG	2	6	537835	537840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_005042	AAG	2	6	537846	537851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_005042	TAA	3	9	537857	537865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_005042	GA	3	6	540630	540635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_005042	ATT	2	6	540644	540649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_005042	ACA	2	6	542046	542051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_005042	TAAA	2	8	543216	543223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_005042	AAT	2	6	543242	543247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_005042	AAT	2	6	543264	543269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_005042	T	7	7	543280	543286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_005042	GTT	2	6	544441	544446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_005042	AAT	2	6	544447	544452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_005042	ATG	2	6	544477	544482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_005042	GTG	2	6	544520	544525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_005042	AC	3	6	544536	544541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_005042	TTC	2	6	544603	544608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_005042	TGCTT	2	10	544727	544736	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1034	NC_005042	ATA	2	6	544804	544809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_005042	TTA	2	6	545446	545451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_005042	GCA	2	6	545472	545477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_005042	ATT	2	6	546320	546325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_005042	A	6	6	546344	546349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_005042	ATT	2	6	546357	546362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_005042	TTTA	2	8	546391	546398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_005042	TAAT	2	8	546413	546420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_005042	TAG	2	6	546422	546427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_005042	TAA	2	6	546797	546802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_005042	CTA	2	6	546809	546814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_005042	ATT	2	6	546873	546878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_005042	TTG	2	6	548259	548264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_005042	TAA	2	6	549234	549239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_005042	TTG	2	6	549272	549277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_005042	ATTTT	2	10	549298	549307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_005042	T	7	7	549315	549321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_005042	TC	3	6	549332	549337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_005042	T	6	6	549353	549358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_005042	TTA	2	6	549364	549369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_005042	ATA	2	6	550649	550654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_005042	A	6	6	550656	550661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_005042	T	6	6	551218	551223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_005042	TCG	2	6	554373	554378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_005042	GTT	2	6	554398	554403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_005042	GTTT	2	8	554436	554443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_005042	ATTT	2	8	554634	554641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_005042	AAT	2	6	555021	555026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_005042	TC	3	6	555148	555153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_005042	TAA	2	6	555171	555176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_005042	CTTT	2	8	555202	555209	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_005042	A	6	6	555226	555231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_005042	GATT	2	8	555237	555244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_005042	TAA	2	6	555274	555279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_005042	AG	3	6	555290	555295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_005042	ATT	2	6	555724	555729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_005042	ATT	2	6	555737	555742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_005042	TAAA	2	8	555759	555766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_005042	TATTT	2	10	555769	555778	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_005042	A	6	6	556100	556105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_005042	GAG	2	6	556174	556179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_005042	TTAA	2	8	556376	556383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_005042	TTG	2	6	556431	556436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_005042	TTC	2	6	556511	556516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_005042	AAG	2	6	556523	556528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_005042	ACTG	2	8	556555	556562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_005042	A	9	9	556615	556623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_005042	TTA	2	6	556629	556634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_005042	T	8	8	556640	556647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_005042	TAATTT	2	12	556720	556731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_005042	T	6	6	556752	556757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_005042	T	6	6	556778	556783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_005042	ATA	2	6	557052	557057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_005042	TTC	2	6	557059	557064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_005042	ATT	2	6	557075	557080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_005042	AAC	2	6	557346	557351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_005042	AAT	2	6	557358	557363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_005042	AAAT	2	8	557371	557378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_005042	TAA	2	6	557393	557398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_005042	TTA	2	6	557753	557758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_005042	GAAG	2	8	558162	558169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_005042	AACA	2	8	558195	558202	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_005042	CCT	2	6	558225	558230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_005042	T	8	8	558317	558324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_005042	CTC	2	6	558327	558332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_005042	TTGGGG	2	12	558348	558359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_005042	A	6	6	558384	558389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_005042	AAG	3	9	558401	558409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_005042	GAA	2	6	558418	558423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_005042	A	6	6	558448	558453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_005042	CATA	2	8	558708	558715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_005042	AT	3	6	558730	558735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_005042	ATT	2	6	558741	558746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_005042	AATC	2	8	558754	558761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_005042	AGAA	2	8	558771	558778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_005042	A	6	6	558788	558793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_005042	TA	3	6	558840	558845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_005042	TTAA	2	8	558856	558863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_005042	TAA	2	6	558873	558878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_005042	AAT	2	6	559710	559715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_005042	AG	4	8	561654	561661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_005042	AT	3	6	561721	561726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_005042	A	6	6	561938	561943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_005042	CTT	2	6	561972	561977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_005042	TTAAA	2	10	561995	562004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_005042	ATTT	2	8	562062	562069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_005042	TAGA	2	8	562090	562097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_005042	AGAA	2	8	562153	562160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_005042	CTT	2	6	562168	562173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_005042	TAATC	2	10	562222	562231	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_005042	TC	3	6	562260	562265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_005042	GAT	2	6	562270	562275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_005042	AGC	2	6	562279	562284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_005042	GAAA	2	8	562329	562336	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_005042	TGC	2	6	562342	562347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_005042	TAT	2	6	562367	562372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_005042	C	6	6	562500	562505	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1131	NC_005042	TGT	2	6	562556	562561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_005042	AAG	2	6	562612	562617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_005042	T	6	6	562687	562692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_005042	TAC	3	9	563164	563172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_005042	CAA	2	6	563175	563180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_005042	CAA	2	6	563198	563203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_005042	TTA	2	6	563221	563226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_005042	A	6	6	563268	563273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_005042	TTA	2	6	563356	563361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1412	NC_005042	A	7	7	613651	613657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_005042	CAAT	2	8	613702	613709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1414	NC_005042	GTA	2	6	613780	613785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_005042	GAA	2	6	613793	613798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_005042	AAT	2	6	613822	613827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_005042	TTC	2	6	613838	613843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1418	NC_005042	TCT	2	6	613886	613891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1419	NC_005042	GAT	2	6	613906	613911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_005042	ATT	2	6	614011	614016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_005042	CTA	2	6	614512	614517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1422	NC_005042	GCT	2	6	614520	614525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1424	NC_005042	GAA	2	6	614911	614916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_005042	TCT	2	6	614959	614964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1426	NC_005042	GCT	2	6	615026	615031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1428	NC_005042	TTAA	2	8	615074	615081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_005042	GTAAA	2	10	615209	615218	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_005042	ATT	2	6	615456	615461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_005042	CTAT	2	8	615464	615471	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1432	NC_005042	ATTA	2	8	615511	615518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_005042	GAT	2	6	615555	615560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_005042	AAT	2	6	615566	615571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_005042	AGTT	2	8	615600	615607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_005042	T	6	6	615633	615638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1438	NC_005042	TAA	2	6	616104	616109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_005042	GGT	2	6	616112	616117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1441	NC_005042	TGA	2	6	616183	616188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_005042	TCT	2	6	616233	616238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_005042	ATT	2	6	616533	616538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_005042	TAAG	2	8	616785	616792	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_005042	TAC	2	6	616849	616854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1449	NC_005042	GATTT	2	10	616888	616897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_005042	TTA	2	6	616920	616925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_005042	AAGA	2	8	616974	616981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_005042	GAA	2	6	616989	616994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_005042	TTA	2	6	617000	617005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_005042	CT	3	6	617008	617013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1456	NC_005042	GGT	2	6	617043	617048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_005042	T	7	7	617054	617060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_005042	AGATC	2	10	617732	617741	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1460	NC_005042	GAA	2	6	617805	617810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1463	NC_005042	AAT	2	6	621624	621629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1464	NC_005042	TCA	2	6	621686	621691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1465	NC_005042	CTT	2	6	621708	621713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1466	NC_005042	AGG	2	6	621765	621770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1467	NC_005042	TATT	2	8	621779	621786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1468	NC_005042	ATG	2	6	621815	621820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1474	NC_005042	AAGG	2	8	621972	621979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1476	NC_005042	GCA	3	9	621997	622005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1485	NC_005042	A	6	6	622135	622140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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