MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 4711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005042	A	6	6	334393	334398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_005042	ATT	2	6	334770	334775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_005042	A	7	7	334803	334809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_005042	T	6	6	334846	334851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_005042	AAT	2	6	334890	334895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_005042	TA	3	6	334982	334987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_005042	ATT	2	6	334993	334998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_005042	AACGCT	2	12	335010	335021	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_005042	AGA	2	6	335032	335037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_005042	AAT	2	6	335085	335090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_005042	TTTAT	2	10	337595	337604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_005042	ACTC	2	8	339567	339574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_005042	ATT	2	6	340073	340078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_005042	TTTAA	2	10	340083	340092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_005042	CTATTT	2	12	340148	340159	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
516	NC_005042	AAATT	2	10	340192	340201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_005042	A	6	6	340223	340228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_005042	TTAA	2	8	340237	340244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_005042	T	6	6	340252	340257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_005042	GCT	2	6	341963	341968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_005042	TAT	2	6	341969	341974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_005042	GAT	2	6	341987	341992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_005042	TTC	2	6	342001	342006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_005042	GAAA	2	8	342084	342091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_005042	T	6	6	342554	342559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_005042	ACA	2	6	342597	342602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_005042	TTC	2	6	342608	342613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_005042	AATT	2	8	342657	342664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_005042	ACT	2	6	342849	342854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_005042	TTG	2	6	342897	342902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_005042	T	8	8	342922	342929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_005042	TCAA	2	8	344277	344284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_005042	ATTGA	2	10	345052	345061	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
534	NC_005042	TGA	2	6	345100	345105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_005042	GCT	2	6	345124	345129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_005042	ATT	2	6	345155	345160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_005042	T	6	6	345196	345201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_005042	TTC	2	6	345231	345236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_005042	TC	3	6	346452	346457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_005042	TAA	2	6	346458	346463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_005042	TAAAAT	2	12	346471	346482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_005042	T	8	8	346508	346515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_005042	ATGAA	2	10	346540	346549	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
544	NC_005042	TA	3	6	347235	347240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_005042	ATTA	2	8	349922	349929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_005042	A	6	6	350616	350621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_005042	TAATT	2	10	350668	350677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_005042	AGA	2	6	352690	352695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_005042	ATT	2	6	352710	352715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_005042	T	7	7	352912	352918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_005042	CTTG	2	8	352994	353001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_005042	AATT	2	8	353040	353047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_005042	TGA	2	6	353064	353069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_005042	AAT	2	6	353193	353198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_005042	AGG	2	6	353203	353208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_005042	ACT	2	6	353214	353219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_005042	TTA	2	6	353270	353275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_005042	GGC	2	6	353348	353353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_005042	CGAA	2	8	353373	353380	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_005042	AGG	2	6	353430	353435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_005042	TTG	2	6	353524	353529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_005042	GAT	2	6	353577	353582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_005042	GCA	2	6	353626	353631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_005042	CGC	2	6	353673	353678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_005042	GAA	2	6	353722	353727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_005042	CAG	2	6	353771	353776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_005042	ATT	2	6	353812	353817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_005042	GGC	2	6	353836	353841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_005042	CTG	2	6	353851	353856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_005042	CAT	2	6	353878	353883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_005042	GAA	2	6	353963	353968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_005042	CTG	2	6	353988	353993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_005042	ACGC	2	8	354145	354152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
574	NC_005042	GAA	2	6	354226	354231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_005042	GGT	2	6	354300	354305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_005042	GTC	2	6	354314	354319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_005042	TCGTG	2	10	354323	354332	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
578	NC_005042	CCG	2	6	354410	354415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_005042	GGA	2	6	354426	354431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_005042	TCA	2	6	354451	354456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_005042	AC	3	6	354477	354482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_005042	TAC	2	6	354484	354489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_005042	GCA	2	6	354507	354512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_005042	AGCA	2	8	354523	354530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
585	NC_005042	AC	3	6	354646	354651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_005042	GGA	3	9	354707	354715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_005042	TGA	2	6	354731	354736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_005042	CCT	2	6	354788	354793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_005042	ACA	2	6	354803	354808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_005042	TAA	2	6	354881	354886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_005042	A	6	6	354890	354895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_005042	CAA	2	6	354957	354962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_005042	GTT	2	6	355050	355055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_005042	GTTT	2	8	355166	355173	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
595	NC_005042	GTT	2	6	355187	355192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_005042	TGAA	2	8	355197	355204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
597	NC_005042	CTTT	2	8	355223	355230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
598	NC_005042	TTC	2	6	355262	355267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_005042	ATT	2	6	355270	355275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_005042	CAG	2	6	355285	355290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_005042	TTA	2	6	355358	355363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_005042	TAAA	2	8	355372	355379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_005042	ATT	2	6	355453	355458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_005042	CA	3	6	355498	355503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_005042	AT	3	6	355608	355613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_005042	TAG	2	6	355651	355656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_005042	GGA	2	6	355659	355664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_005042	GCG	2	6	355693	355698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_005042	AGA	2	6	355774	355779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_005042	GC	3	6	355792	355797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_005042	ACC	2	6	355893	355898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_005042	TG	3	6	355918	355923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_005042	GGGAG	2	10	355969	355978	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
614	NC_005042	GAA	2	6	356050	356055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_005042	TGG	2	6	356097	356102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_005042	AGCT	2	8	356281	356288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
617	NC_005042	CAG	2	6	356330	356335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_005042	G	6	6	356335	356340	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
619	NC_005042	CCA	2	6	356346	356351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_005042	TG	3	6	356405	356410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_005042	AGG	2	6	356508	356513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_005042	AGG	2	6	356533	356538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_005042	AGC	2	6	356549	356554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_005042	TCC	2	6	356782	356787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_005042	GGTGG	2	10	357084	357093	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
626	NC_005042	CT	4	8	357121	357128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_005042	CGG	2	6	357338	357343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_005042	GA	3	6	357434	357439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_005042	AGT	2	6	357571	357576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_005042	CTG	2	6	357668	357673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_005042	CCT	2	6	357696	357701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_005042	CGT	2	6	358027	358032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_005042	GGA	2	6	358105	358110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_005042	GAA	2	6	358252	358257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_005042	GGA	2	6	358303	358308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_005042	CTT	3	9	358333	358341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_005042	T	7	7	358364	358370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_005042	A	7	7	358377	358383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_005042	ATCC	2	8	358463	358470	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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