MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 16551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004578	GTC	2	6	273	278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004578	GGC	2	6	295	300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004578	CAAGG	2	10	1894	1903	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_004578	CTGA	2	8	6662	6669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_004578	GA	3	6	6668	6673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004578	GGC	2	6	6688	6693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_004578	GAT	2	6	6729	6734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004578	A	6	6	6760	6765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004578	GGC	2	6	6853	6858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_004578	AGCC	7	28	6904	6931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004578	GGAT	2	8	7059	7066	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004578	GA	3	6	8823	8828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004578	TCC	2	6	14367	14372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_004578	T	6	6	14426	14431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004578	AAT	2	6	15749	15754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004578	CT	3	6	15860	15865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004578	T	6	6	15879	15884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004578	TCAT	2	8	15905	15912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_004578	GAA	2	6	16473	16478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004578	GAG	2	6	16505	16510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004578	AGC	3	9	16581	16589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004578	ATG	2	6	16608	16613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004578	CAT	2	6	16626	16631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_004578	CTG	2	6	16654	16659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004578	TGGA	2	8	17473	17480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004578	GAAT	2	8	17505	17512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004578	G	6	6	18917	18922	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004578	GAG	2	6	18960	18965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004578	TCC	2	6	18989	18994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_004578	TGCC	2	8	19001	19008	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004578	CAC	2	6	19091	19096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_004578	GTC	2	6	19270	19275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_004578	CCAA	2	8	19298	19305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_004578	AAC	2	6	19933	19938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_004578	CTT	2	6	20457	20462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_004578	TGGC	2	8	20492	20499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_004578	CATG	2	8	20602	20609	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_004578	AGGC	2	8	20636	20643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_004578	CGA	2	6	20646	20651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004578	TAA	2	6	20693	20698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004578	GCTG	2	8	23177	23184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_004578	GCC	2	6	25133	25138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_004578	G	6	6	25150	25155	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004578	GAC	2	6	27808	27813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_004578	GA	3	6	27850	27855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004578	GTC	2	6	27883	27888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004578	GACC	2	8	27903	27910	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_004578	TTC	2	6	27947	27952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_004578	ATG	2	6	28123	28128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004578	TGC	2	6	28139	28144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_004578	GCAA	2	8	28145	28152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_004578	GGC	2	6	28234	28239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_004578	GCT	2	6	28348	28353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_004578	TGG	2	6	28392	28397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004578	TGG	2	6	28419	28424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004578	AAG	2	6	28433	28438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004578	ACC	2	6	28451	28456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_004578	ATGG	2	8	29920	29927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004578	ACG	2	6	30117	30122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_004578	AGA	2	6	30251	30256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004578	CCT	2	6	30558	30563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_004578	GAG	2	6	30577	30582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004578	CTT	2	6	30671	30676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004578	GCCAA	2	10	30731	30740	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_004578	GTCG	2	8	30748	30755	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_004578	CGG	2	6	30768	30773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_004578	CG	3	6	30779	30784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_004578	GGGT	2	8	31024	31031	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004578	TC	3	6	31062	31067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_004578	AGCA	2	8	31073	31080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_004578	TGG	2	6	31193	31198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004578	TGT	2	6	31200	31205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004578	CGT	2	6	31215	31220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_004578	AGC	2	6	31279	31284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_004578	GGAG	2	8	31322	31329	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004578	GCA	2	6	31992	31997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004578	TTTG	2	8	33080	33087	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004578	GGCC	2	8	33110	33117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_004578	GCCAG	2	10	38857	38866	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_004578	GAA	2	6	38887	38892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004578	TTGGGT	2	12	38956	38967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004578	AAG	2	6	39006	39011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004578	GTG	2	6	39078	39083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004578	TGC	2	6	39156	39161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_004578	GAT	2	6	39264	39269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004578	GAG	2	6	40085	40090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004578	GCC	2	6	40126	40131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_004578	GCT	2	6	40147	40152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_004578	TCA	2	6	40189	40194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_004578	CTG	2	6	40202	40207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004578	ACA	2	6	40490	40495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004578	GAA	2	6	40517	40522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004578	TGG	2	6	40572	40577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004578	GGCT	2	8	40648	40655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_004578	ATT	2	6	40726	40731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004578	AAT	2	6	40739	40744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004578	TAC	2	6	40786	40791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_004578	GAT	2	6	40814	40819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004578	CGAATA	2	12	40845	40856	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_004578	AGGC	2	8	44325	44332	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_004578	CTC	2	6	44333	44338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_004578	CTC	2	6	44457	44462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_004578	GCTG	2	8	44544	44551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_004578	CT	3	6	44608	44613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_004578	GCG	2	6	44622	44627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_004578	GC	3	6	44650	44655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_004578	TTC	2	6	44658	44663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_004578	CCG	2	6	44803	44808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_004578	T	6	6	44899	44904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004578	GTT	2	6	44976	44981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004578	A	6	6	45007	45012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004578	ACC	2	6	45087	45092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_004578	GGC	2	6	45100	45105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_004578	CCA	2	6	45147	45152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_004578	GAAA	2	8	47127	47134	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004578	AGCC	13	52	47218	47269	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_004578	GCT	2	6	47365	47370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_004578	TTC	2	6	54502	54507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_004578	AGC	2	6	54542	54547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_004578	GTC	2	6	54633	54638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_004578	AGCG	2	8	54650	54657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_004578	GCC	2	6	54723	54728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_004578	GCA	2	6	54744	54749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_004578	CGC	2	6	54763	54768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_004578	CCA	2	6	54777	54782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_004578	CCA	2	6	54839	54844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_004578	CCA	2	6	54935	54940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_004578	GAAA	2	8	56915	56922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004578	CGG	2	6	57400	57405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_004578	TGG	2	6	57451	57456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004578	CGGCG	2	10	57532	57541	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
132	NC_004578	GGC	2	6	57620	57625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_004578	GTTGC	2	10	57645	57654	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_004578	TGCC	2	8	57718	57725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_004578	GGC	2	6	57731	57736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_004578	GCG	2	6	57741	57746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_004578	ATC	2	6	57759	57764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_004578	CGG	2	6	57766	57771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_004578	GAG	2	6	57780	57785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004578	TGC	2	6	57892	57897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_004578	TGT	2	6	57991	57996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004578	GCC	2	6	58004	58009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_004578	GCT	2	6	58025	58030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_004578	GTT	2	6	58049	58054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004578	GCC	2	6	58055	58060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_004578	GGC	2	6	58088	58093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_004578	GTCG	2	8	58100	58107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_004578	TGG	2	6	58183	58188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004578	GCG	2	6	58189	58194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_004578	AAAT	2	8	58209	58216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004578	CTG	2	6	58241	58246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_004578	CTA	2	6	58278	58283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_004578	GAT	2	6	58303	58308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_004578	CAG	2	6	58330	58335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_004578	AGC	2	6	59925	59930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_004578	TGA	2	6	59956	59961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_004578	CCTG	2	8	60034	60041	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
158	NC_004578	AATGT	2	10	60084	60093	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_004578	CCG	2	6	60103	60108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_004578	CAG	2	6	60111	60116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_004578	GA	3	6	60155	60160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_004578	AGT	2	6	66653	66658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_004578	CAT	2	6	66659	66664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_004578	TCA	3	9	66711	66719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_004578	GTT	2	6	66733	66738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_004578	GAT	2	6	66764	66769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_004578	TGT	2	6	66781	66786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_004578	GT	3	6	97340	97345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
274	NC_004578	TCAGA	2	10	98921	98930	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
275	NC_004578	CGGCT	2	10	98931	98940	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
276	NC_004578	GAT	2	6	98943	98948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_004578	GCACT	2	10	99072	99081	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
278	NC_004578	GAC	2	6	99144	99149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_004578	CG	3	6	100339	100344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
280	NC_004578	CGTG	2	8	101201	101208	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
281	NC_004578	T	6	6	101258	101263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_004578	CTC	2	6	102659	102664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_004578	GCA	2	6	102715	102720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_004578	CGTCAG	2	12	102760	102771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_004578	TGC	2	6	105284	105289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_004578	AGC	2	6	105425	105430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_004578	AGC	2	6	105497	105502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_004578	CTG	2	6	105682	105687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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296	NC_004578	TTG	2	6	105881	105886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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314	NC_004578	A	6	6	111278	111283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_004578	TG	3	6	177050	177055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
416	NC_004578	TGA	2	6	177096	177101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_004578	GCG	2	6	181553	181558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_004578	CA	3	6	181585	181590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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431	NC_004578	GAT	2	6	183118	183123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_004578	ATT	2	6	191592	191597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_004578	ATA	2	6	191649	191654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_004578	GAAC	2	8	193900	193907	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
465	NC_004578	CTC	2	6	193933	193938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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