MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 16551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_004578	CAAGA	2	10	6082921	6082930	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15502	NC_004578	GCT	3	9	6083185	6083193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_004578	TAT	2	6	6083208	6083213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_004578	CGG	2	6	6083244	6083249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_004578	CTG	2	6	6083353	6083358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15506	NC_004578	CAT	2	6	6083440	6083445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15507	NC_004578	CAC	2	6	6083538	6083543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15508	NC_004578	C	7	7	6083635	6083641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15509	NC_004578	CGCC	2	8	6083664	6083671	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15510	NC_004578	GCT	2	6	6084039	6084044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15511	NC_004578	GGCA	2	8	6084104	6084111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15512	NC_004578	T	8	8	6084153	6084160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_004578	A	6	6	6084164	6084169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_004578	T	6	6	6084176	6084181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_004578	TTG	2	6	6084215	6084220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_004578	AC	3	6	6084281	6084286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15517	NC_004578	T	7	7	6085688	6085694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_004578	T	6	6	6085741	6085746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_004578	ATGC	2	8	6085747	6085754	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15520	NC_004578	TGA	2	6	6085801	6085806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_004578	AGC	2	6	6087387	6087392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15522	NC_004578	TGAG	2	8	6087416	6087423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_004578	ACCC	2	8	6087424	6087431	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15524	NC_004578	GCCA	2	8	6087490	6087497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15525	NC_004578	ACC	2	6	6089437	6089442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15526	NC_004578	CGAG	2	8	6089452	6089459	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15527	NC_004578	AAAG	2	8	6089481	6089488	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_004578	TAT	2	6	6089505	6089510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_004578	ACG	2	6	6089543	6089548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15530	NC_004578	CG	3	6	6089657	6089662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15531	NC_004578	A	6	6	6089667	6089672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_004578	GCT	2	6	6089733	6089738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15533	NC_004578	CAT	2	6	6089801	6089806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15535	NC_004578	CGC	2	6	6091526	6091531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15536	NC_004578	GCG	2	6	6091548	6091553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_004578	TGA	2	6	6094267	6094272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_004578	GC	3	6	6094300	6094305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15539	NC_004578	T	6	6	6094325	6094330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_004578	CTGC	2	8	6094866	6094873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15541	NC_004578	CTA	2	6	6094877	6094882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_004578	GGC	2	6	6094890	6094895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15543	NC_004578	TAG	2	6	6094910	6094915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_004578	TGA	2	6	6094986	6094991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_004578	CTA	2	6	6095026	6095031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_004578	TC	3	6	6095104	6095109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15547	NC_004578	AAAG	2	8	6095124	6095131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_004578	GAT	2	6	6095172	6095177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_004578	GAT	2	6	6095220	6095225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_004578	CA	3	6	6095231	6095236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15551	NC_004578	CCA	2	6	6096543	6096548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15552	NC_004578	TTC	2	6	6096634	6096639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15553	NC_004578	AAC	2	6	6096640	6096645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15554	NC_004578	CA	3	6	6096671	6096676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15555	NC_004578	TCAC	2	8	6096707	6096714	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15556	NC_004578	TGC	2	6	6096757	6096762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_004578	TA	3	6	6097121	6097126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_004578	T	6	6	6097253	6097258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_004578	AAC	2	6	6097270	6097275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_004578	TAA	2	6	6097281	6097286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_004578	TG	3	6	6097380	6097385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_004578	CA	3	6	6097399	6097404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15563	NC_004578	AC	3	6	6097409	6097414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15564	NC_004578	CT	3	6	6097475	6097480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15565	NC_004578	TC	3	6	6097622	6097627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15566	NC_004578	T	6	6	6097635	6097640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_004578	GAC	2	6	6097641	6097646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15568	NC_004578	AG	3	6	6097685	6097690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_004578	ACT	2	6	6097710	6097715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15574	NC_004578	AGG	2	6	6097901	6097906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_004578	AG	3	6	6097992	6097997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15579	NC_004578	CGT	2	6	6098184	6098189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15580	NC_004578	CCGGA	2	10	6098230	6098239	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15581	NC_004578	GC	3	6	6098248	6098253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15582	NC_004578	CG	4	8	6098359	6098366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15586	NC_004578	TTA	2	6	6098714	6098719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15588	NC_004578	TAT	2	6	6099922	6099927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_004578	ATTA	2	8	6099936	6099943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_004578	A	7	7	6099972	6099978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_004578	CTTGGA	2	12	6099979	6099990	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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15593	NC_004578	TTGC	2	8	6100035	6100042	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15594	NC_004578	AAG	2	6	6100074	6100079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_004578	GGAT	2	8	6100083	6100090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15596	NC_004578	A	6	6	6100131	6100136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_004578	TCT	2	6	6100199	6100204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15598	NC_004578	A	7	7	6100207	6100213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_004578	AGAT	2	8	6100243	6100250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15600	NC_004578	ATT	2	6	6100380	6100385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15602	NC_004578	TA	3	6	6100414	6100419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_004578	ATA	2	6	6100440	6100445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_004578	CAG	2	6	6100491	6100496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15605	NC_004578	TAC	2	6	6100534	6100539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15606	NC_004578	AGA	2	6	6100559	6100564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_004578	CT	3	6	6100595	6100600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15608	NC_004578	GAT	2	6	6100610	6100615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_004578	AGT	2	6	6100693	6100698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_004578	TGC	2	6	6100726	6100731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15611	NC_004578	GCT	2	6	6100807	6100812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15612	NC_004578	GCA	2	6	6100821	6100826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15613	NC_004578	GAC	2	6	6100843	6100848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15614	NC_004578	C	6	6	6100928	6100933	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15615	NC_004578	GGC	2	6	6100945	6100950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15616	NC_004578	GGC	2	6	6101171	6101176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15617	NC_004578	GC	3	6	6101175	6101180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15618	NC_004578	CTG	2	6	6101205	6101210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15619	NC_004578	GCG	3	9	6101236	6101244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15620	NC_004578	GTC	2	6	6101248	6101253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15621	NC_004578	AGA	2	6	6101288	6101293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15624	NC_004578	CGA	2	6	6101355	6101360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15626	NC_004578	TGGT	2	8	6103470	6103477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15627	NC_004578	CGAG	2	8	6103496	6103503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15628	NC_004578	GGC	2	6	6103554	6103559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15888	NC_004578	AAC	2	6	6192643	6192648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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