MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 16551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004578	GCA	2	6	3873633	3873638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_004578	CTC	2	6	3873663	3873668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_004578	TTC	2	6	3873709	3873714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_004578	GGT	2	6	3873948	3873953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_004578	TTCC	2	8	3873971	3873978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10006	NC_004578	CCA	2	6	3874013	3874018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_004578	ACC	2	6	3874098	3874103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10008	NC_004578	CG	3	6	3874106	3874111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_004578	GCT	2	6	3874162	3874167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_004578	TCC	2	6	3874236	3874241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_004578	CTT	2	6	3874271	3874276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_004578	CA	3	6	3874277	3874282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10013	NC_004578	CTG	2	6	3874330	3874335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_004578	ATC	2	6	3874380	3874385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_004578	TCG	2	6	3874405	3874410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_004578	CCG	2	6	3874579	3874584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10017	NC_004578	CCA	2	6	3874589	3874594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_004578	TGC	2	6	3874609	3874614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_004578	GCC	2	6	3874640	3874645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_004578	GTT	2	6	3874831	3874836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_004578	GGT	2	6	3874845	3874850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_004578	TCT	2	6	3874860	3874865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_004578	GC	3	6	3874874	3874879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10024	NC_004578	TCA	2	6	3874982	3874987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_004578	T	6	6	3875031	3875036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_004578	CCT	2	6	3875066	3875071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10027	NC_004578	TA	3	6	3875229	3875234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_004578	GAA	2	6	3875235	3875240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_004578	AT	3	6	3875258	3875263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_004578	ATT	2	6	3875277	3875282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_004578	CAT	2	6	3875286	3875291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_004578	CAC	2	6	3875328	3875333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_004578	CTG	2	6	3875386	3875391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_004578	ATC	2	6	3875392	3875397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_004578	CAT	2	6	3875423	3875428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_004578	GC	3	6	3875456	3875461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10037	NC_004578	CAC	3	9	3875466	3875474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10038	NC_004578	CTG	2	6	3875503	3875508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_004578	GC	3	6	3875526	3875531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_004578	GGT	2	6	3875559	3875564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_004578	GCT	2	6	3875676	3875681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_004578	CT	3	6	3875680	3875685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_004578	CGAT	2	8	3875696	3875703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10044	NC_004578	CTGTTG	2	12	3875734	3875745	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10045	NC_004578	CGC	2	6	3875766	3875771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_004578	GT	3	6	3875810	3875815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_004578	GCT	2	6	3875821	3875826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_004578	CCG	2	6	3875873	3875878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10049	NC_004578	TGA	2	6	3875888	3875893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_004578	GCGCT	2	10	3875936	3875945	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10051	NC_004578	GCA	2	6	3875968	3875973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_004578	GCCCT	2	10	3875998	3876007	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10053	NC_004578	GC	3	6	3876043	3876048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10054	NC_004578	CGC	2	6	3876084	3876089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_004578	TTC	2	6	3876107	3876112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_004578	TGGC	2	8	3876136	3876143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10057	NC_004578	ATC	2	6	3876154	3876159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_004578	CTGA	2	8	3876291	3876298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10059	NC_004578	CGAT	2	8	3876331	3876338	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10060	NC_004578	CCAG	2	8	3876342	3876349	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10061	NC_004578	AAGGA	2	10	3876381	3876390	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_004578	GCA	2	6	3876710	3876715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_004578	CTG	2	6	3878548	3878553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_004578	TCC	2	6	3879785	3879790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10065	NC_004578	TA	4	8	3879856	3879863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_004578	ACGT	2	8	3879886	3879893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10067	NC_004578	CCT	2	6	3879899	3879904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_004578	CTGC	2	8	3879943	3879950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10069	NC_004578	T	7	7	3879992	3879998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_004578	AATC	2	8	3880011	3880018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10071	NC_004578	CAC	2	6	3880027	3880032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_004578	A	6	6	3880047	3880052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_004578	AAT	2	6	3880071	3880076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_004578	GCC	2	6	3880091	3880096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10075	NC_004578	AT	3	6	3880101	3880106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_004578	GCA	2	6	3887228	3887233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_004578	CAG	2	6	3887235	3887240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_004578	CCG	2	6	3887249	3887254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10079	NC_004578	CGG	2	6	3887277	3887282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10081	NC_004578	AAC	2	6	3892036	3892041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_004578	GCTG	2	8	3893462	3893469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10083	NC_004578	C	6	6	3893515	3893520	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10084	NC_004578	AAAG	2	8	3893521	3893528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_004578	CCCT	2	8	3894673	3894680	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10086	NC_004578	T	7	7	3894700	3894706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_004578	GC	3	6	3894776	3894781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10088	NC_004578	CA	3	6	3894855	3894860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10089	NC_004578	GCT	2	6	3894862	3894867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10091	NC_004578	AC	3	6	3896159	3896164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10092	NC_004578	CGGG	2	8	3896512	3896519	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10093	NC_004578	CGCC	2	8	3896547	3896554	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10094	NC_004578	GCA	2	6	3896561	3896566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10097	NC_004578	TCA	2	6	3897533	3897538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_004578	TCC	2	6	3897561	3897566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10099	NC_004578	GGC	2	6	3897567	3897572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_004578	CAA	2	6	3897585	3897590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_004578	AAC	2	6	3898335	3898340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_004578	AC	3	6	3899053	3899058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_004578	CGCTT	2	10	3899120	3899129	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10104	NC_004578	GCA	2	6	3899320	3899325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10106	NC_004578	AAT	2	6	3899428	3899433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10108	NC_004578	TCA	2	6	3902996	3903001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_004578	GCA	2	6	3903127	3903132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_004578	CGA	2	6	3903133	3903138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_004578	TGGC	2	8	3903152	3903159	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10112	NC_004578	CCA	2	6	3903212	3903217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10113	NC_004578	GGCT	2	8	3904363	3904370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10114	NC_004578	CAGC	2	8	3904384	3904391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_004578	CTG	2	6	3906597	3906602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_004578	GAA	2	6	3906621	3906626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_004578	ATTT	2	8	3906693	3906700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_004578	CA	3	6	3906735	3906740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10119	NC_004578	CCTG	2	8	3908203	3908210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_004578	AGA	2	6	3908229	3908234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_004578	T	6	6	3911833	3911838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_004578	CGCC	2	8	3911915	3911922	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10123	NC_004578	TGT	2	6	3911930	3911935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10126	NC_004578	GCC	2	6	3914442	3914447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10261	NC_004578	A	6	6	3980823	3980828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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