MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 16551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_004578	CGC	2	6	3560492	3560497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9002	NC_004578	CAAG	2	8	3566035	3566042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9003	NC_004578	T	6	6	3566474	3566479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_004578	CCAGG	2	10	3566503	3566512	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9005	NC_004578	CTC	2	6	3566899	3566904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9006	NC_004578	CG	3	6	3566933	3566938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9007	NC_004578	CGCA	2	8	3566966	3566973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9008	NC_004578	ACGTTA	2	12	3567071	3567082	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9009	NC_004578	CA	3	6	3567083	3567088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9010	NC_004578	GCC	2	6	3567126	3567131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9011	NC_004578	AAT	2	6	3568659	3568664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_004578	ACC	2	6	3568682	3568687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9013	NC_004578	GTT	2	6	3568722	3568727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_004578	CCG	2	6	3568730	3568735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9015	NC_004578	A	7	7	3568739	3568745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_004578	ATC	2	6	3568862	3568867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_004578	CTG	2	6	3568982	3568987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_004578	CGC	3	9	3568999	3569007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9019	NC_004578	ATCAGC	2	12	3569042	3569053	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_004578	GTCG	2	8	3569089	3569096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9021	NC_004578	TGG	2	6	3569133	3569138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_004578	ATC	2	6	3569150	3569155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_004578	GCT	2	6	3569164	3569169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_004578	CTG	2	6	3569180	3569185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_004578	TGC	3	9	3569193	3569201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_004578	GC	4	8	3569245	3569252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9027	NC_004578	ATGC	2	8	3569287	3569294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9028	NC_004578	TGG	2	6	3569304	3569309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_004578	ATC	2	6	3569312	3569317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_004578	GCGATG	2	12	3569363	3569374	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9031	NC_004578	CTG	2	6	3569390	3569395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_004578	CAA	2	6	3569401	3569406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_004578	TGAA	2	8	3569446	3569453	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_004578	GAG	2	6	3569515	3569520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_004578	GC	3	6	3569527	3569532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9036	NC_004578	CGC	2	6	3569604	3569609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9037	NC_004578	CAT	2	6	3569685	3569690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_004578	GCG	2	6	3569693	3569698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_004578	TTC	2	6	3569707	3569712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_004578	GTG	2	6	3569761	3569766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_004578	TGC	2	6	3569795	3569800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9042	NC_004578	GCA	2	6	3569819	3569824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_004578	T	6	6	3569974	3569979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_004578	GTG	2	6	3569989	3569994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_004578	CGC	2	6	3570006	3570011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9046	NC_004578	CT	3	6	3572474	3572479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9047	NC_004578	GTT	2	6	3572552	3572557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_004578	TAA	2	6	3574071	3574076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_004578	CGATG	2	10	3575858	3575867	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9050	NC_004578	TG	3	6	3575866	3575871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_004578	TCG	2	6	3575961	3575966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_004578	TTG	2	6	3576017	3576022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_004578	GGC	2	6	3576037	3576042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_004578	GCC	2	6	3576052	3576057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9055	NC_004578	GC	3	6	3576112	3576117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9056	NC_004578	CAC	2	6	3576141	3576146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9057	NC_004578	AGGC	2	8	3576167	3576174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9058	NC_004578	TGC	2	6	3576309	3576314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_004578	ATC	2	6	3576320	3576325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_004578	GGT	2	6	3576364	3576369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_004578	GAA	2	6	3576374	3576379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_004578	GCA	2	6	3576398	3576403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_004578	GCC	2	6	3576515	3576520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9064	NC_004578	GCC	2	6	3576595	3576600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9065	NC_004578	ATTG	2	8	3576652	3576659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_004578	GGC	2	6	3576694	3576699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_004578	TGG	2	6	3576788	3576793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_004578	TAT	2	6	3576818	3576823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_004578	CGT	2	6	3576830	3576835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9073	NC_004578	GA	3	6	3584448	3584453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_004578	AGA	2	6	3586154	3586159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9078	NC_004578	CCTT	2	8	3587486	3587493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9086	NC_004578	GC	3	6	3587715	3587720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9087	NC_004578	TTTA	2	8	3587746	3587753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_004578	GCC	2	6	3587769	3587774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9089	NC_004578	CAT	2	6	3587791	3587796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9092	NC_004578	TTA	2	6	3590271	3590276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9094	NC_004578	GAA	2	6	3593018	3593023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9096	NC_004578	TGCT	2	8	3595947	3595954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9097	NC_004578	AATA	2	8	3595960	3595967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_004578	CGA	2	6	3595997	3596002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_004578	GAA	2	6	3596015	3596020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_004578	T	6	6	3597013	3597018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_004578	CAG	2	6	3597072	3597077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9102	NC_004578	TTG	2	6	3599443	3599448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_004578	GTG	2	6	3599471	3599476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_004578	CTG	2	6	3599496	3599501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9107	NC_004578	CTG	2	6	3599816	3599821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9108	NC_004578	GTT	2	6	3599844	3599849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_004578	GCA	2	6	3599921	3599926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_004578	GAT	2	6	3599952	3599957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_004578	CCG	2	6	3599984	3599989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9112	NC_004578	CGT	2	6	3600086	3600091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9113	NC_004578	CAGA	2	8	3600108	3600115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9114	NC_004578	ATC	2	6	3600121	3600126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_004578	CT	3	6	3600138	3600143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9116	NC_004578	GTC	2	6	3600156	3600161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_004578	CG	3	6	3600241	3600246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9118	NC_004578	CA	3	6	3600312	3600317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9119	NC_004578	TAA	2	6	3600348	3600353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_004578	T	6	6	3600500	3600505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_004578	GGTG	2	8	3600647	3600654	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_004578	T	6	6	3600659	3600664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_004578	TTA	2	6	3600691	3600696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_004578	TCG	2	6	3600699	3600704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9125	NC_004578	TG	3	6	3601635	3601640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_004578	GTG	2	6	3601676	3601681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_004578	TGT	2	6	3601692	3601697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_004578	TTA	2	6	3601749	3601754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9386	NC_004578	AG	3	6	3650398	3650403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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