MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 16551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_004578	GGATG	2	10	3187717	3187726	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_004578	TAA	2	6	3187734	3187739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_004578	TATGAC	2	12	3187770	3187781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8004	NC_004578	ATC	2	6	3187788	3187793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_004578	ATG	2	6	3187880	3187885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_004578	CAA	2	6	3187911	3187916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_004578	TAG	2	6	3187929	3187934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_004578	TGA	2	6	3187938	3187943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_004578	TTA	2	6	3187965	3187970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_004578	GAT	2	6	3188074	3188079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_004578	TGA	2	6	3188088	3188093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_004578	AAT	2	6	3188100	3188105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_004578	GTT	2	6	3188210	3188215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_004578	ATGG	2	8	3188227	3188234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_004578	ATG	2	6	3188304	3188309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_004578	GTT	2	6	3188357	3188362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_004578	GGTA	2	8	3188417	3188424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_004578	ATCT	2	8	3188430	3188437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8019	NC_004578	CT	4	8	3188436	3188443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8020	NC_004578	GAA	2	6	3188472	3188477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_004578	GA	3	6	3188479	3188484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_004578	GTG	2	6	3188499	3188504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_004578	CT	3	6	3188513	3188518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8024	NC_004578	TCTGC	2	10	3188649	3188658	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8025	NC_004578	T	6	6	3188685	3188690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_004578	CGC	2	6	3188770	3188775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8027	NC_004578	TTTC	2	8	3189257	3189264	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8028	NC_004578	TGGT	2	8	3191235	3191242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_004578	GCA	2	6	3191290	3191295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_004578	CGGC	2	8	3191319	3191326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8031	NC_004578	TTC	2	6	3191468	3191473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_004578	GC	3	6	3191503	3191508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_004578	GTGC	2	8	3191603	3191610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8034	NC_004578	CTTG	2	8	3191662	3191669	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8035	NC_004578	CAGG	2	8	3191874	3191881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8036	NC_004578	ACT	2	6	3191901	3191906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_004578	T	6	6	3191916	3191921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_004578	GTC	2	6	3191934	3191939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_004578	GAT	2	6	3194286	3194291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_004578	TGG	2	6	3194314	3194319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_004578	CCT	2	6	3194381	3194386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_004578	ATC	2	6	3194896	3194901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_004578	AGG	2	6	3194987	3194992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_004578	T	7	7	3195060	3195066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_004578	GGT	2	6	3195099	3195104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_004578	CT	3	6	3195110	3195115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8047	NC_004578	A	6	6	3195150	3195155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_004578	CTG	2	6	3195180	3195185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_004578	T	6	6	3196144	3196149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_004578	CGTA	2	8	3196188	3196195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8051	NC_004578	GC	3	6	3196214	3196219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_004578	GC	3	6	3199315	3199320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8053	NC_004578	ATG	2	6	3199423	3199428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_004578	ATG	2	6	3199439	3199444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_004578	CTG	2	6	3199477	3199482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_004578	TGA	2	6	3199561	3199566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_004578	GC	3	6	3199615	3199620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8058	NC_004578	CAA	2	6	3199629	3199634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_004578	CAAGC	2	10	3199691	3199700	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8060	NC_004578	GCG	2	6	3199738	3199743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_004578	GCT	2	6	3199805	3199810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_004578	TGC	2	6	3199817	3199822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_004578	CT	3	6	3199824	3199829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8064	NC_004578	TGA	2	6	3199940	3199945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_004578	GCT	2	6	3199989	3199994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_004578	AAT	2	6	3199998	3200003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_004578	A	6	6	3200089	3200094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_004578	CTG	2	6	3200095	3200100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_004578	GTTT	2	8	3200115	3200122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_004578	AT	3	6	3200224	3200229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_004578	GTAAG	2	10	3200232	3200241	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_004578	ATT	2	6	3200277	3200282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_004578	TGG	2	6	3200309	3200314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_004578	GGA	2	6	3200377	3200382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_004578	TTCT	2	8	3200688	3200695	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8076	NC_004578	AAGCC	2	10	3200710	3200719	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8077	NC_004578	TCA	2	6	3200725	3200730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_004578	TTA	2	6	3200735	3200740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_004578	GTA	2	6	3200755	3200760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_004578	TTTA	2	8	3200864	3200871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_004578	ACC	2	6	3201967	3201972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_004578	GCG	2	6	3201975	3201980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_004578	AAT	2	6	3202001	3202006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_004578	A	6	6	3202056	3202061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_004578	ATC	2	6	3202132	3202137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8087	NC_004578	AG	3	6	3202499	3202504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_004578	TG	3	6	3202580	3202585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_004578	ACC	2	6	3202588	3202593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8090	NC_004578	GTG	2	6	3202640	3202645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8092	NC_004578	TCC	2	6	3202712	3202717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8093	NC_004578	CTA	2	6	3202718	3202723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_004578	CGCT	2	8	3202727	3202734	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8095	NC_004578	TGTC	2	8	3202921	3202928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8096	NC_004578	ATC	2	6	3203110	3203115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8098	NC_004578	CGT	2	6	3203180	3203185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_004578	AAG	2	6	3203201	3203206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_004578	GAAG	2	8	3203256	3203263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_004578	GTC	2	6	3203919	3203924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_004578	CGT	2	6	3204186	3204191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_004578	CTGAAA	2	12	3204206	3204217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8104	NC_004578	GA	3	6	3204243	3204248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_004578	TCA	2	6	3204262	3204267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_004578	ACCTT	2	10	3204356	3204365	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8107	NC_004578	CGCA	2	8	3204390	3204397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8108	NC_004578	CGCT	2	8	3204403	3204410	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8109	NC_004578	ATCC	2	8	3204432	3204439	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8110	NC_004578	G	7	7	3204505	3204511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_004578	CGA	2	6	3204549	3204554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_004578	CGC	2	6	3204630	3204635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8113	NC_004578	TTC	2	6	3204637	3204642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_004578	ACG	2	6	3207016	3207021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_004578	CTG	2	6	3207050	3207055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_004578	GCT	2	6	3207095	3207100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_004578	TTG	2	6	3207150	3207155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_004578	GC	5	10	3207189	3207198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8119	NC_004578	GTG	2	6	3207432	3207437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_004578	GA	3	6	3207556	3207561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_004578	CGC	2	6	3207608	3207613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8122	NC_004578	GTG	2	6	3207715	3207720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_004578	AGGG	2	8	3207731	3207738	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_004578	CGT	2	6	3207753	3207758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_004578	TATG	2	8	3207822	3207829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_004578	CG	4	8	3207836	3207843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_004578	GGA	2	6	3207872	3207877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_004578	GC	3	6	3207881	3207886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8129	NC_004578	CAG	2	6	3207910	3207915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8131	NC_004578	CA	3	6	3208200	3208205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8395	NC_004578	GTT	2	6	3312735	3312740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8396	NC_004578	GTC	2	6	3312826	3312831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8398	NC_004578	TGC	2	6	3312930	3312935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8480	NC_004578	GGC	2	6	3347496	3347501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8500	NC_004578	GCCG	2	8	3351800	3351807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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