MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 16551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_004578	AAT	2	6	2569304	2569309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_004578	GCTCA	2	10	2569450	2569459	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6503	NC_004578	GAT	2	6	2569468	2569473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_004578	TTG	2	6	2569524	2569529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_004578	AG	3	6	2569568	2569573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_004578	GCT	2	6	2569621	2569626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_004578	ACT	2	6	2569703	2569708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_004578	AC	3	6	2569729	2569734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6509	NC_004578	TAA	2	6	2570357	2570362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_004578	AT	3	6	2570463	2570468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_004578	GATT	2	8	2570509	2570516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_004578	AT	3	6	2570553	2570558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_004578	A	6	6	2570584	2570589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_004578	CAG	2	6	2570601	2570606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_004578	TTG	2	6	2570611	2570616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_004578	AG	5	10	2570649	2570658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_004578	CA	3	6	2570734	2570739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6518	NC_004578	CAC	2	6	2571037	2571042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_004578	TA	3	6	2571111	2571116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_004578	GGTTA	2	10	2571179	2571188	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_004578	TGG	2	6	2571209	2571214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_004578	CTG	2	6	2571229	2571234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_004578	TAC	2	6	2571287	2571292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_004578	CGT	2	6	2571349	2571354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_004578	TTGTAA	2	12	2571409	2571420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_004578	TTG	2	6	2571442	2571447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_004578	CAAA	2	8	2571469	2571476	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6528	NC_004578	AGT	2	6	2571518	2571523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_004578	GAC	2	6	2571584	2571589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_004578	GTG	2	6	2571649	2571654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_004578	TTG	2	6	2571659	2571664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_004578	GTG	2	6	2571748	2571753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_004578	CT	3	6	2571854	2571859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6534	NC_004578	TGC	2	6	2573255	2573260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_004578	TGA	2	6	2573316	2573321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_004578	AG	3	6	2573437	2573442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_004578	AAC	2	6	2573536	2573541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_004578	C	6	6	2573617	2573622	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6539	NC_004578	GGC	2	6	2573634	2573639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_004578	CTG	2	6	2575681	2575686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_004578	GAT	2	6	2575696	2575701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_004578	CAA	2	6	2575878	2575883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_004578	TTA	2	6	2575890	2575895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_004578	A	7	7	2577739	2577745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_004578	CTGG	2	8	2578886	2578893	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6546	NC_004578	GCA	2	6	2578932	2578937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_004578	GCA	2	6	2578962	2578967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_004578	TTG	2	6	2579003	2579008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_004578	GCA	2	6	2579019	2579024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_004578	GCA	2	6	2579064	2579069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_004578	CTTGAG	2	12	2579080	2579091	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6552	NC_004578	ATT	2	6	2579126	2579131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_004578	GTTG	2	8	2579146	2579153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_004578	GCA	2	6	2579265	2579270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_004578	CTG	2	6	2579294	2579299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_004578	GCG	2	6	2579336	2579341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_004578	TAC	2	6	2579449	2579454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_004578	GCA	2	6	2579560	2579565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_004578	AACTCA	2	12	2579590	2579601	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_004578	CTT	2	6	2579654	2579659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_004578	ATGT	2	8	2579698	2579705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_004578	CTT	2	6	2579714	2579719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_004578	GCAT	2	8	2579833	2579840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6564	NC_004578	A	6	6	2579853	2579858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_004578	CTTC	2	8	2579881	2579888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6566	NC_004578	TGGC	2	8	2579890	2579897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6567	NC_004578	GCG	2	6	2579961	2579966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_004578	GTCTG	2	10	2579968	2579977	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6569	NC_004578	GAT	2	6	2580003	2580008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_004578	TAA	2	6	2580031	2580036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_004578	AGA	2	6	2580091	2580096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_004578	ATGA	2	8	2580371	2580378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_004578	TTG	2	6	2580388	2580393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_004578	CGG	3	9	2580450	2580458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_004578	CTT	2	6	2580460	2580465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_004578	T	6	6	2580464	2580469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_004578	TA	3	6	2580481	2580486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_004578	ACT	2	6	2580530	2580535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6580	NC_004578	TTGTG	2	10	2580597	2580606	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_004578	ATC	2	6	2580739	2580744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_004578	AG	3	6	2580780	2580785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_004578	T	6	6	2580853	2580858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_004578	GAGG	2	8	2580869	2580876	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_004578	GA	3	6	2580923	2580928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_004578	TGT	2	6	2580942	2580947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_004578	GGT	2	6	2580967	2580972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_004578	TTG	2	6	2581109	2581114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_004578	TC	3	6	2583380	2583385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6590	NC_004578	GCGTT	2	10	2583394	2583403	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6591	NC_004578	A	7	7	2583557	2583563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_004578	CAGCTC	2	12	2584771	2584782	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6593	NC_004578	CTGG	2	8	2584822	2584829	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6594	NC_004578	ATA	2	6	2584848	2584853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_004578	AGC	2	6	2584871	2584876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_004578	TCC	2	6	2584886	2584891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6597	NC_004578	CATA	2	8	2584898	2584905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6598	NC_004578	TGCA	2	8	2584922	2584929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6599	NC_004578	GAT	2	6	2585050	2585055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_004578	GCAT	2	8	2585064	2585071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6601	NC_004578	GTTTTC	2	12	2585128	2585139	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6602	NC_004578	CAG	2	6	2585140	2585145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_004578	GAT	2	6	2585182	2585187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_004578	ATTCC	2	10	2585203	2585212	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6605	NC_004578	AGC	2	6	2585219	2585224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_004578	GAA	2	6	2585225	2585230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_004578	GC	3	6	2585232	2585237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6608	NC_004578	GGCA	2	8	2585257	2585264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6609	NC_004578	GGCA	2	8	2585282	2585289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6610	NC_004578	TA	3	6	2585290	2585295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_004578	GT	3	6	2585354	2585359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_004578	TGA	2	6	2585385	2585390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_004578	GTT	2	6	2585409	2585414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_004578	ATC	2	6	2585429	2585434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_004578	CGC	2	6	2585518	2585523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6616	NC_004578	GCA	2	6	2585558	2585563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_004578	AGGC	2	8	2585565	2585572	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6618	NC_004578	A	6	6	2586010	2586015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_004578	TGCG	2	8	2586045	2586052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6620	NC_004578	GGAT	2	8	2586073	2586080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_004578	GCG	2	6	2586092	2586097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_004578	ATT	2	6	2586113	2586118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_004578	GCAA	2	8	2586188	2586195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6624	NC_004578	GCTG	2	8	2586231	2586238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6625	NC_004578	AG	3	6	2587654	2587659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_004578	GT	3	6	2588918	2588923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_004578	AGT	2	6	2589034	2589039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_004578	CG	3	6	2589141	2589146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6629	NC_004578	GA	3	6	2589201	2589206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6631	NC_004578	TGCG	2	8	2593037	2593044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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