MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 16551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004578	GCT	2	6	2382585	2382590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_004578	CCG	2	6	2382676	2382681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_004578	GCT	2	6	2382729	2382734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_004578	TCC	2	6	2382800	2382805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_004578	GTCG	2	8	2382811	2382818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_004578	GCTTC	2	10	2382834	2382843	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6007	NC_004578	AG	3	6	2382863	2382868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_004578	A	6	6	2384673	2384678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_004578	A	6	6	2384692	2384697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_004578	GCATG	2	10	2384780	2384789	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6011	NC_004578	AGG	2	6	2384791	2384796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_004578	CCA	2	6	2384821	2384826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_004578	AAAC	2	8	2384872	2384879	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_004578	CGG	2	6	2384954	2384959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_004578	CCG	2	6	2385023	2385028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_004578	GCATG	2	10	2385073	2385082	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6017	NC_004578	AGG	2	6	2385084	2385089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_004578	CCA	2	6	2385114	2385119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_004578	CTGA	2	8	2385148	2385155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6020	NC_004578	CGG	2	6	2385202	2385207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_004578	ATT	2	6	2385274	2385279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_004578	CTTT	2	8	2385315	2385322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_004578	ATTCTT	2	12	2385326	2385337	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6024	NC_004578	CATA	2	8	2385338	2385345	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_004578	CGC	2	6	2385422	2385427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_004578	ACG	2	6	2385431	2385436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_004578	GAC	2	6	2385497	2385502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_004578	GCG	2	6	2385601	2385606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_004578	CGA	2	6	2385638	2385643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_004578	TC	3	6	2385724	2385729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_004578	GAG	2	6	2385737	2385742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_004578	TGA	3	9	2386807	2386815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_004578	GGC	2	6	2386895	2386900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_004578	TCA	2	6	2386907	2386912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_004578	AGG	2	6	2386995	2387000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_004578	AAGT	2	8	2387038	2387045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_004578	GCG	2	6	2387232	2387237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_004578	T	6	6	2387850	2387855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_004578	CGA	2	6	2388825	2388830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_004578	A	8	8	2388837	2388844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_004578	CT	3	6	2388855	2388860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_004578	GCA	2	6	2389403	2389408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_004578	GCA	2	6	2389410	2389415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_004578	CAA	2	6	2389418	2389423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_004578	CTG	2	6	2391689	2391694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_004578	GCA	2	6	2391699	2391704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_004578	TGA	2	6	2392711	2392716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_004578	T	6	6	2394875	2394880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_004578	CA	3	6	2394925	2394930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_004578	TC	3	6	2396025	2396030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_004578	CGC	2	6	2396036	2396041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_004578	CTG	2	6	2396042	2396047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_004578	AC	3	6	2396049	2396054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_004578	GCG	2	6	2396060	2396065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_004578	T	6	6	2397251	2397256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_004578	ACA	2	6	2397318	2397323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_004578	GTC	2	6	2397332	2397337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_004578	CACT	2	8	2397341	2397348	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_004578	ACA	2	6	2397358	2397363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_004578	AG	3	6	2399048	2399053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_004578	CAA	2	6	2399055	2399060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_004578	ATC	2	6	2400243	2400248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_004578	GCG	2	6	2400312	2400317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_004578	GGC	2	6	2401776	2401781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_004578	TGC	2	6	2401787	2401792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_004578	GCAA	2	8	2403743	2403750	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6067	NC_004578	TCC	2	6	2403786	2403791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_004578	TCC	2	6	2403807	2403812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_004578	GC	3	6	2403839	2403844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_004578	GCT	2	6	2404828	2404833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_004578	GGTC	2	8	2404854	2404861	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_004578	TCG	2	6	2405026	2405031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_004578	GTT	2	6	2405090	2405095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_004578	TGGT	2	8	2405104	2405111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_004578	CCG	2	6	2405189	2405194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_004578	AGGC	2	8	2405203	2405210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6077	NC_004578	GCC	2	6	2405286	2405291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_004578	CGCCA	2	10	2405316	2405325	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6079	NC_004578	CAGC	2	8	2405355	2405362	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_004578	CGC	2	6	2405399	2405404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_004578	CAGC	2	8	2405444	2405451	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_004578	GC	3	6	2405525	2405530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6083	NC_004578	GCC	2	6	2405565	2405570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_004578	GCC	2	6	2405607	2405612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_004578	TGA	2	6	2405627	2405632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_004578	TCG	2	6	2405659	2405664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_004578	CGA	2	6	2405699	2405704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_004578	ACC	3	9	2405713	2405721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6089	NC_004578	GCC	2	6	2405751	2405756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_004578	CAT	2	6	2405765	2405770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6092	NC_004578	TGC	2	6	2405860	2405865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6094	NC_004578	CTT	2	6	2405984	2405989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_004578	CAC	2	6	2406039	2406044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_004578	TCG	2	6	2406052	2406057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_004578	CTG	2	6	2406114	2406119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_004578	GCA	2	6	2406227	2406232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_004578	GC	3	6	2406269	2406274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_004578	AAC	2	6	2406295	2406300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_004578	GC	3	6	2406310	2406315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_004578	GC	3	6	2406344	2406349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_004578	CCA	2	6	2406368	2406373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_004578	GGC	2	6	2406419	2406424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_004578	CGA	2	6	2406455	2406460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_004578	GAC	2	6	2406462	2406467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6108	NC_004578	TG	3	6	2406546	2406551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_004578	GCCT	2	8	2406595	2406602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_004578	GTTT	2	8	2406653	2406660	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_004578	AC	3	6	2406861	2406866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_004578	GCT	2	6	2406873	2406878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_004578	CA	3	6	2406933	2406938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_004578	TTG	2	6	2406949	2406954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_004578	ATCG	2	8	2406964	2406971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6117	NC_004578	AG	3	6	2408718	2408723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_004578	CGTTC	2	10	2408726	2408735	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6119	NC_004578	CAG	2	6	2408749	2408754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6121	NC_004578	A	6	6	2410833	2410838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_004578	T	7	7	2410864	2410870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_004578	TTA	2	6	2410981	2410986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_004578	T	6	6	2412489	2412494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_004578	GTT	2	6	2412499	2412504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_004578	CAAA	2	8	2413277	2413284	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6127	NC_004578	TCT	2	6	2413307	2413312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_004578	TCAG	2	8	2413324	2413331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_004578	GAGCGC	2	12	2413612	2413623	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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6131	NC_004578	T	6	6	2414314	2414319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_004578	CGT	2	6	2414321	2414326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_004578	CCT	2	6	2415626	2415631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6148	NC_004578	CAG	2	6	2425221	2425226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6166	NC_004578	TTCAG	2	10	2431394	2431403	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6172	NC_004578	TGA	2	6	2431984	2431989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6256	NC_004578	CCT	2	6	2463941	2463946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6257	NC_004578	CCGGC	2	10	2464073	2464082	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6258	NC_004578	GATT	2	8	2464100	2464107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6260	NC_004578	GTC	2	6	2464149	2464154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6263	NC_004578	TGCGT	2	10	2464321	2464330	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6264	NC_004578	T	6	6	2464359	2464364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6265	NC_004578	GTTCG	2	10	2464379	2464388	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6393	NC_004578	GC	3	6	2527433	2527438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6394	NC_004578	GTC	2	6	2527485	2527490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6397	NC_004578	GTCG	2	8	2527631	2527638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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