MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pyrobaculum aerophilum str. IM2 chromosome

Total Repeats: 5276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003364	A	6	6	1631011	1631016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_003364	ATT	2	6	1631021	1631026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_003364	TAA	2	6	1631038	1631043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_003364	ATA	2	6	1631231	1631236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_003364	A	6	6	1631236	1631241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_003364	TTTA	2	8	1631245	1631252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_003364	A	6	6	1631252	1631257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_003364	TA	3	6	1631885	1631890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_003364	TAA	2	6	1631943	1631948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_003364	ATC	2	6	1632455	1632460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_003364	CAC	2	6	1632473	1632478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_003364	CCA	2	6	1632493	1632498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_003364	CCA	2	6	1632505	1632510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_003364	ATT	2	6	1632560	1632565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_003364	TAA	2	6	1632608	1632613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_003364	CT	3	6	1632622	1632627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_003364	CAC	2	6	1632652	1632657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_003364	ACA	2	6	1632704	1632709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_003364	GAG	2	6	1634258	1634263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_003364	AGT	2	6	1634368	1634373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_003364	GCC	2	6	1634409	1634414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_003364	GGGCT	2	10	1634415	1634424	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4023	NC_003364	GGC	2	6	1634458	1634463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_003364	CGG	2	6	1634478	1634483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_003364	CAT	2	6	1634509	1634514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_003364	CG	3	6	1634540	1634545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_003364	CGTA	2	8	1634584	1634591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_003364	A	6	6	1634591	1634596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_003364	ATGCC	2	10	1635005	1635014	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4030	NC_003364	GGC	2	6	1635015	1635020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_003364	CTG	2	6	1635026	1635031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_003364	ATT	2	6	1635034	1635039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_003364	GGA	2	6	1635079	1635084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_003364	CTAT	2	8	1635085	1635092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_003364	GGC	2	6	1635097	1635102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_003364	TA	3	6	1635741	1635746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_003364	GAT	2	6	1636080	1636085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_003364	TGT	2	6	1636087	1636092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_003364	TTTACC	2	12	1638487	1638498	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_003364	GTG	2	6	1638874	1638879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_003364	A	6	6	1639824	1639829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_003364	TA	4	8	1639833	1639840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_003364	TAA	2	6	1639953	1639958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_003364	GCGG	2	8	1639962	1639969	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_003364	TGGC	2	8	1640000	1640007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4046	NC_003364	TG	3	6	1640177	1640182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_003364	AGG	2	6	1641507	1641512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_003364	TA	6	12	1641515	1641526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_003364	AAG	2	6	1641616	1641621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_003364	AGG	2	6	1641626	1641631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_003364	TCC	2	6	1641644	1641649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_003364	ACC	2	6	1642732	1642737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4055	NC_003364	ATT	2	6	1642818	1642823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_003364	AAC	2	6	1642824	1642829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_003364	CTT	2	6	1642871	1642876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_003364	CTT	2	6	1642937	1642942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_003364	CGT	2	6	1642991	1642996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4061	NC_003364	CGCGTA	2	12	1643089	1643100	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_003364	GAA	2	6	1643211	1643216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_003364	TCT	2	6	1643370	1643375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_003364	TGT	2	6	1643376	1643381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_003364	ACATC	2	10	1643430	1643439	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4066	NC_003364	ATG	2	6	1643715	1643720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_003364	GTG	2	6	1643771	1643776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_003364	CGTGC	2	10	1643780	1643789	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4069	NC_003364	AG	3	6	1643795	1643800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_003364	TTG	2	6	1643861	1643866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4072	NC_003364	CGG	2	6	1643959	1643964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4076	NC_003364	AGT	2	6	1644090	1644095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_003364	CT	3	6	1644697	1644702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_003364	CAATA	2	10	1644706	1644715	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4084	NC_003364	AT	4	8	1648591	1648598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_003364	A	6	6	1650057	1650062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4087	NC_003364	TGT	2	6	1650784	1650789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_003364	GCC	2	6	1650840	1650845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4091	NC_003364	TA	3	6	1656569	1656574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_003364	AT	3	6	1657628	1657633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_003364	TTG	2	6	1657646	1657651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_003364	TC	3	6	1659653	1659658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_003364	GAG	2	6	1659666	1659671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_003364	ATTT	2	8	1659971	1659978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_003364	ATG	2	6	1659997	1660002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_003364	TCT	2	6	1661605	1661610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_003364	ATT	2	6	1661631	1661636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_003364	G	6	6	1661659	1661664	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_003364	TTAT	2	8	1663060	1663067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_003364	CCT	2	6	1663072	1663077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4109	NC_003364	AAAT	2	8	1663856	1663863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_003364	AG	3	6	1663867	1663872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_003364	GAG	2	6	1663876	1663881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_003364	GCG	2	6	1664045	1664050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_003364	AT	3	6	1664475	1664480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_003364	TA	3	6	1664484	1664489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_003364	ATT	2	6	1664514	1664519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4117	NC_003364	TTTTAA	2	12	1664537	1664548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_003364	AT	3	6	1664590	1664595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_003364	GTT	2	6	1664601	1664606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4122	NC_003364	AGT	2	6	1664910	1664915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_003364	ATA	2	6	1665556	1665561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_003364	GC	3	6	1665612	1665617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_003364	AGA	2	6	1665643	1665648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_003364	GCG	2	6	1665680	1665685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_003364	T	6	6	1665688	1665693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_003364	CCG	2	6	1665781	1665786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_003364	CAA	2	6	1665846	1665851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_003364	TGT	2	6	1665864	1665869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_003364	TAT	2	6	1665980	1665985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_003364	T	6	6	1666102	1666107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_003364	AAG	2	6	1666162	1666167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4135	NC_003364	GGCT	2	8	1666264	1666271	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4136	NC_003364	TTTG	2	8	1666322	1666329	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4143	NC_003364	A	6	6	1672890	1672895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4243	NC_003364	T	6	6	1720187	1720192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4254	NC_003364	CAA	2	6	1734914	1734919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_003364	GCC	2	6	1734974	1734979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4256	NC_003364	GCC	2	6	1735037	1735042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4257	NC_003364	T	6	6	1736789	1736794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_003364	TAT	2	6	1736798	1736803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_003364	T	8	8	1736803	1736810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_003364	TATTT	2	10	1736827	1736836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_003364	T	6	6	1736840	1736845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_003364	ACAG	2	8	1739344	1739351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4263	NC_003364	TGA	2	6	1739353	1739358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_003364	GGA	2	6	1740395	1740400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_003364	GCG	2	6	1740444	1740449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4267	NC_003364	GAA	2	6	1740493	1740498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4401	NC_003364	TAA	2	6	1804075	1804080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4402	NC_003364	GAG	2	6	1804111	1804116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4403	NC_003364	C	6	6	1804180	1804185	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4404	NC_003364	GA	3	6	1804188	1804193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4421	NC_003364	C	15	15	1818426	1818440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4423	NC_003364	TA	3	6	1818711	1818716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4431	NC_003364	CA	3	6	1819127	1819132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4432	NC_003364	ATA	2	6	1819170	1819175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4433	NC_003364	GA	3	6	1819176	1819181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4436	NC_003364	AGCGC	2	10	1819383	1819392	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4452	NC_003364	T	6	6	1820635	1820640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4453	NC_003364	ATT	2	6	1820652	1820657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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