MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pyrobaculum aerophilum str. IM2 chromosome

Total Repeats: 5276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003364	CGC	2	6	286041	286046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_003364	CGC	2	6	286090	286095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_003364	GCG	2	6	286102	286107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_003364	CT	3	6	286114	286119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_003364	GTGAA	2	10	286315	286324	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_003364	TTA	2	6	286346	286351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_003364	GTACT	2	10	286495	286504	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_003364	TA	3	6	287966	287971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_003364	TCT	2	6	287983	287988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_003364	TA	3	6	296603	296608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_003364	GGCG	2	8	296640	296647	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_003364	CTG	2	6	296654	296659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_003364	GCC	2	6	296754	296759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_003364	TTGT	2	8	296808	296815	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_003364	GTA	2	6	296838	296843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_003364	GTG	2	6	296850	296855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_003364	CAT	2	6	296861	296866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_003364	CAA	2	6	296992	296997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_003364	TAGT	2	8	297093	297100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_003364	CAAA	2	8	297905	297912	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_003364	CT	3	6	297953	297958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_003364	TC	3	6	297972	297977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_003364	AGCC	2	8	298014	298021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_003364	CAA	2	6	298108	298113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_003364	CA	3	6	298128	298133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_003364	TC	3	6	298390	298395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_003364	TG	3	6	298471	298476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_003364	GTT	2	6	300203	300208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_003364	ATG	2	6	300245	300250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_003364	GTCT	2	8	300262	300269	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_003364	TGA	2	6	300326	300331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_003364	GTT	2	6	300342	300347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_003364	G	6	6	300413	300418	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_003364	AGTA	2	8	300517	300524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_003364	T	6	6	300531	300536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_003364	GCC	2	6	300620	300625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_003364	ACT	2	6	300791	300796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_003364	CGG	2	6	300843	300848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_003364	C	6	6	300867	300872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1040	NC_003364	GC	3	6	302006	302011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_003364	CG	3	6	302082	302087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_003364	ACTG	2	8	302130	302137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_003364	GAA	2	6	302239	302244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_003364	TCG	2	6	302272	302277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_003364	G	6	6	302305	302310	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_003364	A	6	6	302349	302354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_003364	AGG	2	6	302376	302381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_003364	CGC	2	6	302828	302833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_003364	CTT	2	6	303474	303479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_003364	CAA	2	6	303486	303491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_003364	CGG	2	6	303539	303544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_003364	TGA	2	6	303559	303564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_003364	TGG	2	6	303602	303607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003364	CCGG	2	8	303609	303616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_003364	CG	4	8	303637	303644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_003364	T	6	6	303696	303701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_003364	GTT	2	6	303728	303733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_003364	CGT	2	6	303766	303771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_003364	ACA	2	6	304841	304846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_003364	CTT	2	6	305853	305858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_003364	GCC	2	6	305863	305868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_003364	GCG	2	6	307818	307823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_003364	TA	3	6	309295	309300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_003364	TAA	2	6	309854	309859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_003364	GGC	2	6	309918	309923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_003364	TCA	2	6	309924	309929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_003364	CTT	2	6	309946	309951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_003364	AAT	2	6	309997	310002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_003364	TAT	3	9	313046	313054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_003364	GCG	2	6	313107	313112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_003364	GTA	2	6	313140	313145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_003364	TA	3	6	313170	313175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_003364	TCT	2	6	313179	313184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_003364	AG	3	6	313217	313222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_003364	G	6	6	313222	313227	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_003364	GCAG	2	8	313268	313275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_003364	TC	3	6	313347	313352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_003364	ACG	2	6	313362	313367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_003364	TA	3	6	313373	313378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_003364	GAG	2	6	313433	313438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_003364	A	6	6	313480	313485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_003364	A	6	6	315162	315167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_003364	AG	3	6	315389	315394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_003364	AAAT	2	8	316767	316774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_003364	TAGT	2	8	316787	316794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_003364	CGG	2	6	316861	316866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_003364	A	6	6	316868	316873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_003364	T	6	6	316907	316912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_003364	ACCACT	2	12	316917	316928	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_003364	CGG	2	6	319344	319349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_003364	AAC	2	6	319398	319403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_003364	AGC	2	6	319411	319416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_003364	CAC	2	6	319427	319432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_003364	GCG	2	6	319503	319508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_003364	GCTG	2	8	319574	319581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_003364	GCG	2	6	319605	319610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_003364	CGG	2	6	320641	320646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_003364	AT	3	6	322792	322797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_003364	GCG	2	6	323027	323032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_003364	GCTA	2	8	323108	323115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_003364	GAC	2	6	323127	323132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_003364	AAC	2	6	323150	323155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_003364	G	6	6	323179	323184	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_003364	AGT	2	6	323238	323243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_003364	A	6	6	323267	323272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_003364	TTC	2	6	323289	323294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_003364	TTA	2	6	324566	324571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_003364	AATGAC	2	12	326520	326531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1109	NC_003364	ATT	2	6	326608	326613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_003364	GTC	2	6	326669	326674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_003364	TC	3	6	326727	326732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_003364	A	6	6	326773	326778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_003364	GGC	2	6	326815	326820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_003364	TAA	2	6	326831	326836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_003364	GTA	2	6	328367	328372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_003364	TA	3	6	331111	331116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_003364	GGAC	2	8	332725	332732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_003364	GA	3	6	333140	333145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_003364	CAG	2	6	333146	333151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_003364	T	7	7	333155	333161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_003364	TGT	2	6	333167	333172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_003364	TAA	2	6	333303	333308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_003364	ATA	2	6	333312	333317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_003364	T	7	7	335200	335206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_003364	GCG	2	6	335222	335227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_003364	TAA	2	6	337539	337544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_003364	TGGGGT	2	12	338770	338781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_003364	TAAT	2	8	340286	340293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_003364	GGC	2	6	341388	341393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_003364	CGG	2	6	341394	341399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_003364	CGT	2	6	341420	341425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_003364	AT	3	6	341781	341786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_003364	G	6	6	341810	341815	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_003364	TTG	2	6	343710	343715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_003364	TAAA	2	8	345398	345405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_003364	GGA	2	6	345467	345472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_003364	ATCA	2	8	345506	345513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1138	NC_003364	AG	3	6	345531	345536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1143	NC_003364	TA	3	6	349301	349306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_003364	T	6	6	351817	351822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1162	NC_003364	TA	3	6	380088	380093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1274	NC_003364	GTT	2	6	439461	439466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_003364	AT	3	6	525302	525307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_003364	TTC	2	6	525317	525322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_003364	AG	3	6	525353	525358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_003364	TA	3	6	525405	525410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_003364	AAG	2	6	525559	525564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_003364	TAT	2	6	525584	525589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_003364	TAT	2	6	525779	525784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_003364	A	7	7	525839	525845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_003364	T	6	6	526873	526878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_003364	T	6	6	526888	526893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_003364	TA	3	6	526912	526917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_003364	TA	3	6	532327	532332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_003364	TAA	2	6	533756	533761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_003364	CAT	2	6	533778	533783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1430	NC_003364	GGC	2	6	533843	533848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1431	NC_003364	TAT	2	6	533883	533888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_003364	TAAC	2	8	533892	533899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1433	NC_003364	ATATTT	2	12	539696	539707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1435	NC_003364	TAA	2	6	539748	539753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1441	NC_003364	GATA	2	8	543145	543152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_003364	GGC	2	6	543200	543205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1444	NC_003364	CTC	2	6	543653	543658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1445	NC_003364	GGT	2	6	543674	543679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_003364	TGT	2	6	543777	543782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_003364	T	6	6	547243	547248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_003364	A	6	6	547264	547269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_003364	TA	5	10	547313	547322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_003364	TCG	2	6	548242	548247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_003364	TAT	2	6	548332	548337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_003364	TCC	2	6	548338	548343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1454	NC_003364	GTT	2	6	548346	548351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1456	NC_003364	TA	3	6	550152	550157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1459	NC_003364	GGT	2	6	558778	558783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1460	NC_003364	TA	3	6	561631	561636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1461	NC_003364	TAGA	2	8	562900	562907	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1472	NC_003364	GA	3	6	564165	564170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1473	NC_003364	CGC	2	6	564217	564222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1474	NC_003364	GCG	2	6	564268	564273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1488	NC_003364	TTA	2	6	571861	571866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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