MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 15146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002947	CTC	2	6	6	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_002947	CAA	2	6	22	27	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002947	GC	3	6	65	70	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002947	ACA	2	6	132	137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002947	C	7	7	4438	4444	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_002947	ACA	2	6	4496	4501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002947	AG	3	6	4508	4513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002947	AAT	2	6	4588	4593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002947	AG	3	6	4604	4609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002947	A	7	7	4709	4715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002947	GGC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_002947	TCA	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_002947	TCT	2	6	4939	4944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002947	A	8	8	4961	4968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002947	GCG	2	6	4984	4989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002947	T	6	6	6440	6445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002947	CGA	2	6	8966	8971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002947	AAGC	2	8	9017	9024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_002947	AC	3	6	9112	9117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002947	ACA	2	6	9127	9132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_002947	A	8	8	9135	9142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002947	T	6	6	9162	9167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002947	GAA	2	6	9168	9173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002947	TGC	2	6	9269	9274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_002947	GGGGT	2	10	9348	9357	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002947	GTTT	2	8	9499	9506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002947	GT	3	6	15755	15760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002947	CCGG	2	8	15800	15807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_002947	T	8	8	15857	15864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002947	ATG	2	6	15908	15913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002947	G	6	6	15919	15924	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002947	CGG	2	6	15970	15975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002947	AGC	2	6	15985	15990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_002947	AG	3	6	15991	15996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002947	TTAA	2	8	16038	16045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002947	ATGGAA	2	12	16081	16092	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002947	TGG	2	6	16095	16100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002947	T	6	6	16117	16122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002947	AG	3	6	16272	16277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002947	GA	3	6	16326	16331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002947	T	6	6	16460	16465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002947	CGCC	2	8	16521	16528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_002947	T	6	6	16540	16545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002947	GGT	2	6	16603	16608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002947	CGG	2	6	16613	16618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_002947	CTT	2	6	16706	16711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_002947	GTG	2	6	16831	16836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002947	TGAAG	2	10	16840	16849	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002947	CGAC	2	8	16855	16862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_002947	GGA	2	6	17035	17040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002947	GCC	2	6	17065	17070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_002947	TGGT	2	8	17097	17104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002947	CTTT	2	8	22123	22130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002947	ATC	2	6	22144	22149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002947	GGC	2	6	22541	22546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_002947	GTG	2	6	22566	22571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002947	GTG	3	9	22621	22629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002947	AC	3	6	22630	22635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_002947	A	6	6	22667	22672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002947	CCT	2	6	22730	22735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_002947	ACC	2	6	22875	22880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_002947	TCT	2	6	22936	22941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_002947	ATG	2	6	23130	23135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002947	GGA	2	6	23164	23169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002947	GCT	2	6	25571	25576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_002947	GCT	2	6	25620	25625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_002947	GTT	2	6	25730	25735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002947	GCCC	2	8	25742	25749	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_002947	GGGC	2	8	25770	25777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_002947	ACC	2	6	25794	25799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_002947	CTG	2	6	25820	25825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_002947	CTCG	2	8	25832	25839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_002947	TGT	2	6	26812	26817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002947	T	7	7	26825	26831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002947	A	7	7	26858	26864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002947	GC	3	6	26914	26919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_002947	TGC	2	6	26957	26962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_002947	CGC	2	6	26977	26982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_002947	TCG	2	6	27440	27445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_002947	CAAGC	2	10	27492	27501	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_002947	ACG	2	6	27511	27516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_002947	CA	3	6	27554	27559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002947	A	9	9	27565	27573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002947	GCT	2	6	27587	27592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_002947	T	6	6	27592	27597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002947	GTT	2	6	27751	27756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002947	TC	3	6	27784	27789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002947	GAT	2	6	27826	27831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002947	GCT	2	6	29563	29568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_002947	TG	3	6	29694	29699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002947	ATT	2	6	29740	29745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002947	CTG	2	6	29806	29811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_002947	TAC	2	6	29854	29859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_002947	CCA	2	6	29860	29865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_002947	CAAA	2	8	29904	29911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002947	TTCAA	2	10	29946	29955	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_002947	GCA	2	6	30148	30153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_002947	CGG	2	6	30163	30168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002947	CGG	2	6	30184	30189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_002947	GCAG	2	8	30231	30238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002947	GCT	2	6	30322	30327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_002947	CAGT	2	8	30349	30356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002947	CCT	2	6	31368	31373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_002947	A	8	8	31392	31399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002947	ATC	2	6	31861	31866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_002947	TGA	2	6	31868	31873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002947	AAG	2	6	32204	32209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002947	TAA	2	6	32215	32220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002947	A	6	6	32219	32224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002947	G	6	6	32234	32239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002947	AAC	2	6	32296	32301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_002947	GCT	2	6	32321	32326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_002947	AGC	2	6	32348	32353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_002947	AGG	2	6	32385	32390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002947	GAT	2	6	32401	32406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002947	ATT	2	6	32447	32452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002947	GA	3	6	32454	32459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002947	GCC	2	6	32467	32472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_002947	CTGC	2	8	32524	32531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_002947	TGC	2	6	32585	32590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_002947	CCG	2	6	32633	32638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_002947	CGC	2	6	32724	32729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_002947	CTT	2	6	32736	32741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_002947	TCCT	2	8	32867	32874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002947	TTTG	2	8	35022	35029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002947	CAA	2	6	35647	35652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_002947	CGC	2	6	35653	35658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_002947	ATT	2	6	35799	35804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002947	CAA	2	6	35846	35851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_002947	CGG	2	6	36117	36122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_002947	GAAA	2	8	36144	36151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002947	A	6	6	36157	36162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002947	T	6	6	36181	36186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002947	A	6	6	39041	39046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002947	TAAATG	2	12	39055	39066	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002947	TA	3	6	39083	39088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002947	GTAA	2	8	39091	39098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002947	GCAT	2	8	39184	39191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002947	CTC	2	6	40261	40266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_002947	CAG	2	6	40344	40349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_002947	GCAA	2	8	40444	40451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_002947	TTC	2	6	40459	40464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_002947	TCA	2	6	41765	41770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_002947	TGG	2	6	41933	41938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002947	GCAA	2	8	41943	41950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_002947	C	6	6	43107	43112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
147	NC_002947	GCC	2	6	43163	43168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_002947	TACTTC	2	12	43474	43485	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_002947	GTTG	2	8	45585	45592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002947	TAA	2	6	45661	45666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_002947	ATC	2	6	49380	49385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_002947	TG	3	6	50690	50695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_002947	AAT	2	6	104959	104964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_002947	TCA	2	6	166437	166442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_002947	CGA	2	6	166513	166518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_002947	CGCGG	2	10	166550	166559	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
432	NC_002947	CCA	2	6	166635	166640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
433	NC_002947	CGG	2	6	166722	166727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_002947	GGC	2	6	166774	166779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_002947	C	6	6	166791	166796	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
436	NC_002947	AC	3	6	166948	166953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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441	NC_002947	A	9	9	167159	167167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_002947	ATAC	2	8	167283	167290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
443	NC_002947	AAT	2	6	167307	167312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_002947	CGC	2	6	168336	168341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
445	NC_002947	AGT	2	6	170974	170979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_002947	GA	3	6	171078	171083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
448	NC_002947	A	6	6	171125	171130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_002947	GC	3	6	171174	171179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
450	NC_002947	GGC	2	6	171409	171414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_002947	GCG	2	6	171467	171472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_002947	TGG	2	6	171618	171623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
453	NC_002947	CGA	2	6	171642	171647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_002947	GAT	2	6	171667	171672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
455	NC_002947	GCA	2	6	171716	171721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_002947	GGT	2	6	171949	171954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
462	NC_002947	GTG	2	6	172033	172038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_002947	ACC	2	6	172099	172104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
465	NC_002947	GAA	2	6	172338	172343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
466	NC_002947	TGC	2	6	172414	172419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_002947	GGA	2	6	172540	172545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_002947	AC	3	6	172760	172765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
474	NC_002947	GGA	2	6	172820	172825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
475	NC_002947	CCT	2	6	172901	172906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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490	NC_002947	ACCGA	2	10	173921	173930	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
491	NC_002947	AC	3	6	174134	174139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
492	NC_002947	CGTC	2	8	174152	174159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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