MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 15146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002947	TCGG	2	8	575124	575131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_002947	GAA	2	6	575168	575173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_002947	CAT	2	6	575186	575191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_002947	ACC	2	6	575212	575217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_002947	GCC	2	6	575281	575286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_002947	GCA	2	6	575314	575319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_002947	TGA	2	6	575371	575376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_002947	GAA	2	6	575405	575410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_002947	CAC	2	6	575441	575446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_002947	GCT	2	6	575466	575471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_002947	GGCT	2	8	575480	575487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_002947	ACCA	2	8	575604	575611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_002947	GCA	2	6	575661	575666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_002947	CAA	2	6	575714	575719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_002947	ACT	2	6	575773	575778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_002947	GCACCG	2	12	575791	575802	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_002947	GGGC	2	8	575816	575823	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_002947	ACG	2	6	575941	575946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_002947	GT	3	6	575956	575961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_002947	GCA	2	6	576029	576034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_002947	TGA	2	6	576055	576060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_002947	AGC	2	6	576061	576066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_002947	ATG	2	6	576126	576131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_002947	CCT	2	6	576151	576156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_002947	GCA	2	6	576206	576211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_002947	GACC	2	8	576329	576336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_002947	CTG	2	6	576342	576347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_002947	CGC	2	6	576401	576406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_002947	GC	3	6	576419	576424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_002947	TGA	2	6	576490	576495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_002947	CGG	2	6	576520	576525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_002947	AAC	2	6	576528	576533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_002947	ACG	2	6	576574	576579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_002947	TGC	2	6	576580	576585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_002947	GAT	2	6	576596	576601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_002947	CGC	2	6	576650	576655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_002947	GCA	2	6	576681	576686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_002947	CAG	2	6	576854	576859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_002947	GCTG	2	8	576862	576869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_002947	GAGC	2	8	576929	576936	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_002947	CCTGCG	2	12	576941	576952	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_002947	G	7	7	576972	576978	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_002947	GAG	2	6	577026	577031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_002947	GGA	2	6	577040	577045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_002947	CCGAC	2	10	577087	577096	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1546	NC_002947	GCA	2	6	577156	577161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_002947	GCT	2	6	577171	577176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_002947	CGC	2	6	577221	577226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_002947	ACA	2	6	577228	577233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_002947	CTGGGC	2	12	577265	577276	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_002947	GGCC	2	8	577279	577286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_002947	CCG	2	6	577289	577294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_002947	GCAAG	2	10	577325	577334	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1554	NC_002947	TGG	2	6	577365	577370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_002947	CGC	2	6	577420	577425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_002947	TCA	2	6	577447	577452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_002947	TTC	2	6	577476	577481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_002947	AAG	2	6	577572	577577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_002947	CCA	2	6	577579	577584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_002947	CCGG	2	8	577590	577597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_002947	TG	3	6	577613	577618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_002947	GCAC	2	8	577630	577637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_002947	GCG	2	6	577653	577658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_002947	ACC	2	6	577659	577664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_002947	CACTTC	2	12	577680	577691	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_002947	AGCA	2	8	577695	577702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_002947	TCG	2	6	577738	577743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_002947	GCGGTG	2	12	577827	577838	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1569	NC_002947	CAA	2	6	577868	577873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_002947	CTT	2	6	580591	580596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_002947	GTA	2	6	580699	580704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_002947	AAGG	2	8	584060	584067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_002947	T	6	6	584158	584163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_002947	TCG	2	6	584216	584221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1576	NC_002947	GGC	2	6	585304	585309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1580	NC_002947	ATG	2	6	588686	588691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_002947	CAG	2	6	588692	588697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_002947	CAG	2	6	588706	588711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_002947	GGC	2	6	588775	588780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_002947	GCCAGC	2	12	588791	588802	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_002947	GAT	2	6	588808	588813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_002947	GA	3	6	588823	588828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_002947	GAA	2	6	588931	588936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_002947	ATG	2	6	588977	588982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_002947	GC	3	6	589027	589032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_002947	GGC	2	6	589066	589071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_002947	GATCAG	2	12	589072	589083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1592	NC_002947	GTG	2	6	589086	589091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_002947	ACGC	2	8	589094	589101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_002947	ACA	2	6	589301	589306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_002947	A	6	6	589347	589352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_002947	CAG	2	6	589442	589447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_002947	GCTTT	2	10	589569	589578	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1598	NC_002947	TG	3	6	589637	589642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_002947	CTGG	2	8	589650	589657	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_002947	TCTG	2	8	589736	589743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_002947	T	6	6	589839	589844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_002947	TCA	2	6	589846	589851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_002947	CTG	2	6	589864	589869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_002947	GCT	2	6	591695	591700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_002947	CAG	2	6	591701	591706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_002947	TTA	2	6	594156	594161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1608	NC_002947	GAC	2	6	597445	597450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_002947	GTTAT	2	10	597474	597483	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_002947	GC	3	6	597496	597501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_002947	CTTG	2	8	597926	597933	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_002947	TTC	2	6	598018	598023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_002947	CGG	2	6	599011	599016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_002947	CCA	2	6	599114	599119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_002947	CAG	2	6	599151	599156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_002947	A	7	7	599223	599229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_002947	GCT	2	6	599232	599237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_002947	TGC	2	6	599262	599267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_002947	GGCA	2	8	599276	599283	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_002947	CCA	2	6	599312	599317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_002947	GCA	3	9	599338	599346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_002947	TGCC	2	8	599390	599397	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_002947	CAG	2	6	599449	599454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1629	NC_002947	CAGC	2	8	607020	607027	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_002947	CTG	2	6	607042	607047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_002947	TACT	2	8	607074	607081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1633	NC_002947	GAG	3	9	610919	610927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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