MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 15146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_002947	GAA	2	6	6149296	6149301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_002947	AGC	2	6	6149306	6149311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_002947	CG	3	6	6149393	6149398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15004	NC_002947	GCC	2	6	6149447	6149452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15005	NC_002947	TCA	2	6	6149511	6149516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_002947	ACC	2	6	6149573	6149578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15007	NC_002947	GGT	2	6	6149616	6149621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_002947	TCC	2	6	6149654	6149659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15009	NC_002947	GGC	2	6	6149719	6149724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_002947	GC	3	6	6149737	6149742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15011	NC_002947	GTC	2	6	6149834	6149839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15012	NC_002947	CGC	2	6	6149884	6149889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15013	NC_002947	CACG	2	8	6149952	6149959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15014	NC_002947	GCCC	2	8	6149971	6149978	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15015	NC_002947	TG	3	6	6150020	6150025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_002947	GCA	2	6	6150033	6150038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15017	NC_002947	TGG	2	6	6150047	6150052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_002947	CCA	2	6	6150097	6150102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15019	NC_002947	GCG	2	6	6150106	6150111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_002947	CCG	2	6	6150249	6150254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15021	NC_002947	AGT	2	6	6150519	6150524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_002947	TGT	2	6	6150531	6150536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_002947	CAA	2	6	6150616	6150621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15024	NC_002947	ACA	2	6	6150676	6150681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15025	NC_002947	GATC	2	8	6150760	6150767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15026	NC_002947	ACTCT	2	10	6150879	6150888	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15027	NC_002947	AGA	2	6	6151889	6151894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_002947	GAA	2	6	6151923	6151928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_002947	GGA	2	6	6151953	6151958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_002947	GAA	2	6	6152010	6152015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_002947	CCT	2	6	6152024	6152029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15032	NC_002947	ATC	2	6	6152031	6152036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15034	NC_002947	GGA	2	6	6152180	6152185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_002947	ATT	2	6	6152251	6152256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_002947	CCA	2	6	6152307	6152312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15037	NC_002947	CCT	2	6	6152313	6152318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15038	NC_002947	AGC	2	6	6152320	6152325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15039	NC_002947	TTGGT	2	10	6152341	6152350	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_002947	CAG	2	6	6152511	6152516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15041	NC_002947	AG	3	6	6152515	6152520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_002947	CGT	2	6	6152529	6152534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15043	NC_002947	GA	3	6	6152573	6152578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_002947	A	6	6	6152653	6152658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_002947	GGC	2	6	6152662	6152667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_002947	TCG	3	9	6152672	6152680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_002947	TG	3	6	6152769	6152774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_002947	GTA	2	6	6152895	6152900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15051	NC_002947	GCT	2	6	6155376	6155381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15052	NC_002947	ACTGA	2	10	6156460	6156469	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15053	NC_002947	AAT	2	6	6156477	6156482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_002947	GGT	2	6	6156528	6156533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_002947	TGAT	2	8	6158305	6158312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_002947	GAA	2	6	6158341	6158346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_002947	GCCG	2	8	6158351	6158358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15058	NC_002947	CGC	2	6	6158413	6158418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15059	NC_002947	AC	3	6	6158440	6158445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15060	NC_002947	AGCG	2	8	6158447	6158454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15061	NC_002947	CA	3	6	6158455	6158460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15062	NC_002947	TG	3	6	6158516	6158521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_002947	CCG	2	6	6158532	6158537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15064	NC_002947	GTG	2	6	6158637	6158642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_002947	AACC	2	8	6158654	6158661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15066	NC_002947	GGT	2	6	6158666	6158671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15084	NC_002947	GCC	2	6	6159374	6159379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15089	NC_002947	A	7	7	6159470	6159476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_002947	CAT	2	6	6159483	6159488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15093	NC_002947	GCA	2	6	6160328	6160333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_002947	CAGAC	2	10	6160620	6160629	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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15098	NC_002947	GAA	2	6	6160765	6160770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_002947	GCAA	2	8	6160830	6160837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15100	NC_002947	TCT	2	6	6160911	6160916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_002947	CAG	2	6	6160987	6160992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15105	NC_002947	GC	3	6	6161402	6161407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15106	NC_002947	CTA	2	6	6161408	6161413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15111	NC_002947	GGA	2	6	6166416	6166421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_002947	TAGC	2	8	6166504	6166511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15113	NC_002947	GTC	2	6	6166513	6166518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15114	NC_002947	TTTC	2	8	6166523	6166530	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15115	NC_002947	CCG	2	6	6166553	6166558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15122	NC_002947	T	6	6	6168601	6168606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_002947	ACA	2	6	6168668	6168673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15124	NC_002947	GCC	2	6	6168674	6168679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15127	NC_002947	TCC	2	6	6168789	6168794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15128	NC_002947	CAG	2	6	6168796	6168801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15129	NC_002947	GCC	2	6	6168922	6168927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15130	NC_002947	TTG	2	6	6168934	6168939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15131	NC_002947	GCC	2	6	6168952	6168957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15132	NC_002947	AAC	2	6	6168989	6168994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15133	NC_002947	GCTG	2	8	6168998	6169005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15134	NC_002947	AAGGAC	2	12	6169028	6169039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15135	NC_002947	GAGC	2	8	6170316	6170323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15136	NC_002947	TTCGA	2	10	6173084	6173093	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15137	NC_002947	CG	3	6	6173123	6173128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15138	NC_002947	A	6	6	6173205	6173210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15139	NC_002947	AGAAAA	2	12	6174677	6174688	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15140	NC_002947	CTG	2	6	6179072	6179077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15141	NC_002947	CTCG	2	8	6180117	6180124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15142	NC_002947	GTG	2	6	6180151	6180156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15143	NC_002947	TCC	2	6	6180426	6180431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15144	NC_002947	CGT	2	6	6180441	6180446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15145	NC_002947	C	6	6	6180523	6180528	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15146	NC_002947	CAGG	2	8	6180532	6180539	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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