MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 15146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_002947	TGC	2	6	5662174	5662179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14002	NC_002947	ACAGC	2	10	5662658	5662667	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14003	NC_002947	GGC	2	6	5663156	5663161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_002947	CTT	2	6	5665702	5665707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_002947	AT	3	6	5665734	5665739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_002947	G	6	6	5665748	5665753	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_002947	GAA	2	6	5665778	5665783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_002947	TCA	2	6	5665919	5665924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_002947	ATG	2	6	5667724	5667729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_002947	TCG	2	6	5667767	5667772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_002947	CGG	2	6	5667803	5667808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_002947	GCA	2	6	5667884	5667889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_002947	GCTC	2	8	5667921	5667928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14014	NC_002947	CTG	2	6	5668004	5668009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_002947	GCC	2	6	5668045	5668050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14016	NC_002947	CAT	2	6	5668068	5668073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14017	NC_002947	CCG	2	6	5668181	5668186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14018	NC_002947	GTC	2	6	5668230	5668235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_002947	TCT	2	6	5668244	5668249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14020	NC_002947	GCC	3	9	5668264	5668272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14021	NC_002947	CGC	3	9	5668278	5668286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14022	NC_002947	GAA	2	6	5668321	5668326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_002947	GTG	2	6	5668335	5668340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_002947	GCCA	2	8	5668367	5668374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14025	NC_002947	CGA	2	6	5668395	5668400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14026	NC_002947	GGT	2	6	5668402	5668407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_002947	CTG	2	6	5668420	5668425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_002947	AAG	2	6	5668429	5668434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_002947	ACC	3	9	5668477	5668485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14030	NC_002947	CTG	2	6	5668498	5668503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_002947	TCAACG	2	12	5668541	5668552	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_002947	ACA	2	6	5668577	5668582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_002947	ACC	2	6	5668631	5668636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14034	NC_002947	ACG	2	6	5668811	5668816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14035	NC_002947	CTG	2	6	5668843	5668848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_002947	ACC	3	9	5668870	5668878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14037	NC_002947	ACG	2	6	5669065	5669070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_002947	CTG	2	6	5669082	5669087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14039	NC_002947	GCC	2	6	5669095	5669100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14040	NC_002947	CAT	2	6	5669138	5669143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_002947	GCCG	2	8	5669210	5669217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14042	NC_002947	AAAG	2	8	5669219	5669226	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_002947	TGC	2	6	5669248	5669253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_002947	GAA	2	6	5669255	5669260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_002947	CGA	2	6	5669264	5669269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_002947	CGG	2	6	5669300	5669305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14047	NC_002947	AGC	2	6	5669326	5669331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_002947	CTA	2	6	5669387	5669392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_002947	GGCA	2	8	5669417	5669424	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14050	NC_002947	ACG	2	6	5669475	5669480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_002947	AG	3	6	5671632	5671637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_002947	ATGC	2	8	5671700	5671707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14053	NC_002947	CCCG	2	8	5672554	5672561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14054	NC_002947	GCCCA	2	10	5672723	5672732	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14055	NC_002947	GCT	2	6	5674649	5674654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14056	NC_002947	GAA	2	6	5675983	5675988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_002947	A	6	6	5675995	5676000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_002947	CA	3	6	5678147	5678152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14059	NC_002947	CAC	2	6	5678217	5678222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14060	NC_002947	GCA	2	6	5678250	5678255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14061	NC_002947	CCTGC	2	10	5678302	5678311	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14062	NC_002947	CGC	2	6	5678342	5678347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14063	NC_002947	CAC	2	6	5679790	5679795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14064	NC_002947	CGG	2	6	5679867	5679872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_002947	TC	3	6	5679913	5679918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14066	NC_002947	CCT	2	6	5681286	5681291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14067	NC_002947	TGT	2	6	5681309	5681314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_002947	CTG	2	6	5681408	5681413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_002947	ACC	2	6	5681452	5681457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14070	NC_002947	AGC	2	6	5690388	5690393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14071	NC_002947	TTTC	2	8	5690527	5690534	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14072	NC_002947	GCC	2	6	5690553	5690558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14073	NC_002947	ACC	2	6	5690565	5690570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14074	NC_002947	ATG	2	6	5691559	5691564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_002947	GCT	2	6	5691583	5691588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14076	NC_002947	CGG	2	6	5692601	5692606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14077	NC_002947	GCC	2	6	5693695	5693700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14078	NC_002947	GAG	2	6	5693724	5693729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_002947	CAC	2	6	5696577	5696582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14080	NC_002947	C	6	6	5696644	5696649	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14081	NC_002947	C	7	7	5696669	5696675	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14082	NC_002947	C	6	6	5696689	5696694	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14083	NC_002947	CCA	2	6	5698746	5698751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14084	NC_002947	GGGC	2	8	5698782	5698789	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14085	NC_002947	TCCC	2	8	5698813	5698820	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14086	NC_002947	TCA	2	6	5698842	5698847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14087	NC_002947	GA	3	6	5698854	5698859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_002947	GCA	2	6	5699405	5699410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_002947	CGT	2	6	5699506	5699511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14090	NC_002947	GGC	2	6	5701207	5701212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_002947	GCT	2	6	5703840	5703845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14092	NC_002947	CTG	2	6	5704469	5704474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_002947	GAA	2	6	5704560	5704565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_002947	CTCATG	2	12	5705803	5705814	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14095	NC_002947	GTG	2	6	5705816	5705821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_002947	GAA	2	6	5705863	5705868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_002947	GTC	2	6	5705890	5705895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14098	NC_002947	TA	3	6	5705907	5705912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_002947	T	6	6	5711134	5711139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_002947	GCT	2	6	5712548	5712553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_002947	GTG	2	6	5712585	5712590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_002947	CTG	2	6	5712612	5712617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_002947	TGC	2	6	5712631	5712636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_002947	TGG	2	6	5712639	5712644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_002947	GCTG	2	8	5712676	5712683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14106	NC_002947	GC	4	8	5712712	5712719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14107	NC_002947	TCA	2	6	5712754	5712759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14108	NC_002947	GCT	2	6	5712770	5712775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14109	NC_002947	CGC	2	6	5712783	5712788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14110	NC_002947	C	6	6	5712798	5712803	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14111	NC_002947	CGA	2	6	5712812	5712817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_002947	GGCCTC	2	12	5712938	5712949	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14113	NC_002947	CGC	2	6	5712965	5712970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14114	NC_002947	GGT	3	9	5712992	5713000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_002947	GGT	2	6	5713004	5713009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_002947	CCTGG	2	10	5713043	5713052	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14117	NC_002947	GCC	2	6	5713071	5713076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14118	NC_002947	CGG	2	6	5713087	5713092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_002947	TCG	2	6	5713120	5713125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14120	NC_002947	A	6	6	5713135	5713140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_002947	ACG	2	6	5713147	5713152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14122	NC_002947	CTG	2	6	5713161	5713166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14123	NC_002947	GCCA	2	8	5713182	5713189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14124	NC_002947	GCG	2	6	5713193	5713198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14125	NC_002947	GCC	2	6	5713252	5713257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14126	NC_002947	GCT	2	6	5713340	5713345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_002947	GCG	2	6	5713354	5713359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14248	NC_002947	C	6	6	5758420	5758425	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14249	NC_002947	CAGG	2	8	5758460	5758467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14250	NC_002947	CAA	2	6	5759492	5759497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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