MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 15146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_002947	AGTC	2	8	5411660	5411667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13502	NC_002947	G	6	6	5411681	5411686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_002947	TC	3	6	5414168	5414173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13504	NC_002947	CGG	2	6	5414190	5414195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13505	NC_002947	ATTT	2	8	5414251	5414258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_002947	GCGGG	2	10	5414275	5414284	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13507	NC_002947	CT	3	6	5414313	5414318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13508	NC_002947	A	6	6	5414325	5414330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_002947	TGT	2	6	5415778	5415783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_002947	AAGG	2	8	5415801	5415808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_002947	GTT	2	6	5415860	5415865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_002947	CG	3	6	5415866	5415871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13513	NC_002947	TGT	2	6	5415873	5415878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_002947	TG	3	6	5416078	5416083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_002947	TGA	2	6	5416149	5416154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_002947	TGG	2	6	5416183	5416188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_002947	GCG	2	6	5416203	5416208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_002947	G	6	6	5416219	5416224	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_002947	GGC	2	6	5416229	5416234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_002947	ACG	2	6	5416268	5416273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_002947	ACC	2	6	5416286	5416291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13522	NC_002947	CGGGT	2	10	5419083	5419092	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13523	NC_002947	GAG	2	6	5419112	5419117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_002947	CGCC	2	8	5421164	5421171	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13525	NC_002947	CAC	2	6	5421182	5421187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13526	NC_002947	AC	3	6	5421252	5421257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13527	NC_002947	CGG	2	6	5422718	5422723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13528	NC_002947	GAGC	2	8	5422734	5422741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13529	NC_002947	GCC	2	6	5422756	5422761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13530	NC_002947	GCG	2	6	5422765	5422770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13531	NC_002947	GGCGCG	2	12	5423477	5423488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_002947	GCC	2	6	5423507	5423512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13533	NC_002947	TGCC	2	8	5423566	5423573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13534	NC_002947	CCG	2	6	5423579	5423584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13535	NC_002947	GCC	2	6	5423695	5423700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13536	NC_002947	GGC	2	6	5423721	5423726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_002947	ACC	2	6	5423731	5423736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13538	NC_002947	TGGC	2	8	5423737	5423744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13539	NC_002947	CAA	2	6	5423779	5423784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13540	NC_002947	CTG	2	6	5423800	5423805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_002947	CGGTG	2	10	5423820	5423829	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13542	NC_002947	TGA	2	6	5423834	5423839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_002947	GAC	2	6	5423884	5423889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_002947	CAG	2	6	5423979	5423984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13545	NC_002947	CA	3	6	5424092	5424097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13546	NC_002947	CG	3	6	5424100	5424105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13547	NC_002947	CTGGTG	2	12	5424115	5424126	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13548	NC_002947	CAG	2	6	5424160	5424165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13549	NC_002947	CGG	2	6	5424174	5424179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_002947	ATGGCA	2	12	5424224	5424235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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13552	NC_002947	T	6	6	5425392	5425397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_002947	CTG	2	6	5425451	5425456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_002947	GGC	2	6	5428128	5428133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_002947	C	6	6	5429198	5429203	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13556	NC_002947	G	6	6	5430347	5430352	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_002947	CTG	2	6	5430353	5430358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13558	NC_002947	CG	3	6	5430396	5430401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13559	NC_002947	CAG	2	6	5430458	5430463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13560	NC_002947	CTG	2	6	5431308	5431313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_002947	T	6	6	5431323	5431328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_002947	AAG	2	6	5432394	5432399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_002947	CGC	2	6	5432551	5432556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13564	NC_002947	AGGC	2	8	5432622	5432629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13565	NC_002947	CGT	2	6	5432682	5432687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13566	NC_002947	T	6	6	5432701	5432706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_002947	GGT	2	6	5432722	5432727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_002947	TAAT	2	8	5436695	5436702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_002947	TCT	2	6	5437719	5437724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13570	NC_002947	GT	3	6	5437730	5437735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_002947	GGCC	2	8	5437765	5437772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13572	NC_002947	CCGC	2	8	5437777	5437784	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13573	NC_002947	GCA	2	6	5437922	5437927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13574	NC_002947	TTGC	2	8	5438429	5438436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13575	NC_002947	CCTGA	2	10	5438710	5438719	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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13578	NC_002947	CCG	2	6	5438835	5438840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13579	NC_002947	CCAG	2	8	5438876	5438883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13580	NC_002947	CGG	2	6	5438913	5438918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13581	NC_002947	TTC	2	6	5438940	5438945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13584	NC_002947	GCC	2	6	5439146	5439151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13585	NC_002947	CG	3	6	5439195	5439200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13588	NC_002947	CGG	2	6	5439299	5439304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13589	NC_002947	GCG	2	6	5439321	5439326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13591	NC_002947	TGCC	2	8	5440861	5440868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13592	NC_002947	G	6	6	5442583	5442588	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_002947	GA	3	6	5442610	5442615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_002947	GC	3	6	5442683	5442688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13595	NC_002947	GGT	2	6	5442715	5442720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13597	NC_002947	GGTG	2	8	5442737	5442744	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_002947	CAG	2	6	5442754	5442759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13599	NC_002947	GTCGC	2	10	5444801	5444810	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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13601	NC_002947	CAAT	2	8	5444959	5444966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13602	NC_002947	CGAT	2	8	5444975	5444982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13603	NC_002947	TGG	2	6	5445023	5445028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_002947	GA	3	6	5446481	5446486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_002947	AATA	2	8	5447883	5447890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_002947	CA	4	8	5447893	5447900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13607	NC_002947	CCAA	2	8	5447915	5447922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13608	NC_002947	GCT	2	6	5447956	5447961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13611	NC_002947	AAAAG	2	10	5453096	5453105	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_002947	GCC	2	6	5453127	5453132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13613	NC_002947	GT	4	8	5453185	5453192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_002947	GA	3	6	5453278	5453283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_002947	CG	3	6	5453310	5453315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13616	NC_002947	TGA	2	6	5454700	5454705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13621	NC_002947	TG	3	6	5455671	5455676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_002947	GAA	2	6	5455682	5455687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_002947	GC	3	6	5455691	5455696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13624	NC_002947	C	6	6	5456070	5456075	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13625	NC_002947	AGC	2	6	5456103	5456108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13627	NC_002947	CTG	2	6	5456163	5456168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13628	NC_002947	TCTCT	2	10	5456240	5456249	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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13630	NC_002947	CGT	2	6	5460625	5460630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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