MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 15146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_002947	AGC	2	6	5222742	5222747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_002947	CGG	2	6	5222804	5222809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_002947	TC	3	6	5222925	5222930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13004	NC_002947	CAAA	2	8	5222933	5222940	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13005	NC_002947	GC	3	6	5224318	5224323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13006	NC_002947	CT	3	6	5224350	5224355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13007	NC_002947	AC	4	8	5224442	5224449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13008	NC_002947	GGC	2	6	5224502	5224507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_002947	CTTTT	2	10	5224529	5224538	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13010	NC_002947	TGC	2	6	5224586	5224591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_002947	GGCC	2	8	5224651	5224658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13012	NC_002947	CAT	2	6	5224667	5224672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_002947	GCT	2	6	5225673	5225678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_002947	GGCA	2	8	5225740	5225747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13015	NC_002947	ATT	2	6	5229080	5229085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_002947	AATC	2	8	5229089	5229096	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13017	NC_002947	GGC	2	6	5229165	5229170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_002947	G	6	6	5229197	5229202	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_002947	CTG	2	6	5233058	5233063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_002947	TAC	2	6	5233116	5233121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_002947	GACA	2	8	5234627	5234634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13022	NC_002947	CT	3	6	5234646	5234651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13023	NC_002947	GACCC	2	10	5234655	5234664	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13024	NC_002947	C	6	6	5237018	5237023	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13025	NC_002947	CAA	2	6	5237029	5237034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_002947	ATTT	2	8	5237038	5237045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_002947	ATTC	2	8	5237061	5237068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13028	NC_002947	CAG	2	6	5237185	5237190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_002947	GCA	2	6	5237232	5237237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_002947	GAA	2	6	5237264	5237269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_002947	CGA	2	6	5237299	5237304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_002947	CCA	2	6	5237365	5237370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13033	NC_002947	GCC	2	6	5237423	5237428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13034	NC_002947	GCA	2	6	5237472	5237477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_002947	GCG	2	6	5237481	5237486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_002947	GAT	2	6	5238429	5238434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_002947	CTT	2	6	5238559	5238564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_002947	GGCC	2	8	5238641	5238648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13039	NC_002947	CAC	2	6	5238680	5238685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13040	NC_002947	AGT	2	6	5238686	5238691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_002947	GCC	2	6	5238779	5238784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13042	NC_002947	AACC	2	8	5238893	5238900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13043	NC_002947	TA	3	6	5238917	5238922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_002947	TGA	2	6	5238965	5238970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_002947	CAC	2	6	5239273	5239278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13046	NC_002947	CAT	2	6	5239281	5239286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_002947	CGGCCT	2	12	5240353	5240364	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13048	NC_002947	CGC	3	9	5240368	5240376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13049	NC_002947	GT	3	6	5240420	5240425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_002947	CCTCC	2	10	5244581	5244590	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
13051	NC_002947	C	7	7	5248762	5248768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13052	NC_002947	T	8	8	5248856	5248863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_002947	CT	3	6	5249900	5249905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13054	NC_002947	CAG	2	6	5249926	5249931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_002947	GCCA	2	8	5249954	5249961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13056	NC_002947	TGA	2	6	5249965	5249970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_002947	GCC	2	6	5252577	5252582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13058	NC_002947	CACG	2	8	5253070	5253077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13059	NC_002947	GAA	2	6	5253090	5253095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_002947	CCA	2	6	5253100	5253105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13061	NC_002947	GCA	2	6	5253171	5253176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_002947	CGC	2	6	5253179	5253184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13063	NC_002947	CTG	2	6	5253214	5253219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_002947	CCG	2	6	5253231	5253236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13065	NC_002947	TGG	2	6	5253260	5253265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_002947	CAA	2	6	5253297	5253302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_002947	CAG	2	6	5253304	5253309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_002947	CCTGCA	2	12	5253351	5253362	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13069	NC_002947	TGC	2	6	5253398	5253403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_002947	TGC	2	6	5253500	5253505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_002947	CGG	2	6	5253561	5253566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_002947	GT	3	6	5253590	5253595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_002947	GAA	2	6	5253652	5253657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_002947	TCC	2	6	5253680	5253685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13075	NC_002947	TAC	2	6	5254699	5254704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_002947	TGCA	2	8	5254789	5254796	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13077	NC_002947	CAC	2	6	5254810	5254815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13078	NC_002947	ACA	2	6	5255447	5255452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_002947	GC	3	6	5256525	5256530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13080	NC_002947	CAA	2	6	5256612	5256617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_002947	CGG	2	6	5256618	5256623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_002947	GGCAG	2	10	5256636	5256645	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13083	NC_002947	CTTG	2	8	5256678	5256685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13084	NC_002947	GCT	2	6	5256708	5256713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_002947	GGCG	2	8	5256801	5256808	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13086	NC_002947	TGC	2	6	5256816	5256821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_002947	GC	3	6	5256832	5256837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13088	NC_002947	TTC	2	6	5259286	5259291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_002947	GCT	2	6	5259310	5259315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_002947	GAAA	2	8	5259378	5259385	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_002947	CCG	2	6	5259411	5259416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13092	NC_002947	GGC	2	6	5259422	5259427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_002947	AAC	3	9	5259448	5259456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_002947	AC	3	6	5260697	5260702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13095	NC_002947	CGT	2	6	5260723	5260728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_002947	GCA	2	6	5260763	5260768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_002947	TGAA	2	8	5261620	5261627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_002947	CAC	2	6	5261744	5261749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13099	NC_002947	TGG	2	6	5266624	5266629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_002947	TAGC	2	8	5267160	5267167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13101	NC_002947	AC	3	6	5267236	5267241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13102	NC_002947	CAA	2	6	5267388	5267393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_002947	AG	3	6	5267399	5267404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_002947	GAGC	2	8	5268941	5268948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13105	NC_002947	GCTC	2	8	5268951	5268958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13106	NC_002947	CAGT	2	8	5270428	5270435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13107	NC_002947	ACCTT	2	10	5270484	5270493	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13108	NC_002947	CTG	2	6	5270961	5270966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_002947	ACC	2	6	5271888	5271893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13110	NC_002947	GC	3	6	5273977	5273982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13111	NC_002947	TGTTC	2	10	5276783	5276792	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13112	NC_002947	AATG	2	8	5276852	5276859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_002947	GTG	2	6	5276896	5276901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_002947	GAT	2	6	5276990	5276995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_002947	C	6	6	5277004	5277009	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13116	NC_002947	CGC	2	6	5278274	5278279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13117	NC_002947	CATG	2	8	5278363	5278370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13118	NC_002947	ATG	2	6	5278376	5278381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_002947	T	6	6	5278388	5278393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_002947	CA	3	6	5278400	5278405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13121	NC_002947	GCT	2	6	5280882	5280887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_002947	CT	3	6	5282348	5282353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13123	NC_002947	CG	3	6	5282408	5282413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13124	NC_002947	TGA	2	6	5282414	5282419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_002947	CATA	2	8	5282439	5282446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13126	NC_002947	CTG	2	6	5283455	5283460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_002947	AAC	3	9	5283535	5283543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13129	NC_002947	AGG	2	6	5285601	5285606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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