MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 15146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_002947	CCG	2	6	4414687	4414692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10502	NC_002947	TAC	2	6	4414726	4414731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_002947	AT	3	6	4414784	4414789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_002947	TAC	2	6	4414860	4414865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_002947	CTC	2	6	4414904	4414909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10506	NC_002947	GCC	2	6	4414915	4414920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10507	NC_002947	CGG	2	6	4414945	4414950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_002947	T	6	6	4414971	4414976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_002947	ACC	2	6	4415790	4415795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10510	NC_002947	T	7	7	4416092	4416098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_002947	ACC	2	6	4416125	4416130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10512	NC_002947	GGC	2	6	4416681	4416686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_002947	TCT	2	6	4416760	4416765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_002947	AGC	2	6	4416787	4416792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_002947	CGA	2	6	4416796	4416801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_002947	CCG	2	6	4416808	4416813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10517	NC_002947	GCC	2	6	4416818	4416823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10518	NC_002947	CAC	2	6	4417671	4417676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10519	NC_002947	CGGC	2	8	4418427	4418434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10520	NC_002947	GCC	2	6	4418454	4418459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10521	NC_002947	ACC	2	6	4420242	4420247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10522	NC_002947	CTC	2	6	4422766	4422771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10523	NC_002947	GC	3	6	4422827	4422832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10524	NC_002947	TTC	2	6	4422877	4422882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_002947	CGC	2	6	4422930	4422935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10526	NC_002947	CCT	2	6	4422951	4422956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10527	NC_002947	A	7	7	4422980	4422986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_002947	ATT	2	6	4423020	4423025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_002947	TTG	2	6	4423053	4423058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_002947	GGC	2	6	4423093	4423098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_002947	CCT	2	6	4423511	4423516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10532	NC_002947	GCT	2	6	4423517	4423522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10535	NC_002947	CTG	2	6	4423595	4423600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10536	NC_002947	CGG	2	6	4423622	4423627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_002947	AACCC	2	10	4423703	4423712	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
10538	NC_002947	CGG	2	6	4423735	4423740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_002947	TGA	2	6	4423748	4423753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_002947	GAGG	2	8	4424535	4424542	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_002947	GCAA	2	8	4424548	4424555	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10542	NC_002947	GAC	2	6	4424573	4424578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_002947	A	6	6	4424587	4424592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_002947	ATC	2	6	4424606	4424611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_002947	GAAT	2	8	4424650	4424657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_002947	GA	3	6	4424660	4424665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_002947	CCG	2	6	4424678	4424683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10548	NC_002947	TCG	2	6	4424873	4424878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_002947	TGA	2	6	4424879	4424884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_002947	CGC	2	6	4424925	4424930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10551	NC_002947	CTTA	2	8	4424952	4424959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10552	NC_002947	AG	3	6	4424978	4424983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_002947	GATA	2	8	4424985	4424992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_002947	GATA	2	8	4425045	4425052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_002947	CAG	2	6	4425102	4425107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_002947	GGGCT	2	10	4425140	4425149	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10557	NC_002947	CAG	2	6	4425155	4425160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_002947	GC	3	6	4425275	4425280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10559	NC_002947	TCG	2	6	4425307	4425312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_002947	ATC	2	6	4425339	4425344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10562	NC_002947	A	6	6	4425510	4425515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_002947	AG	3	6	4425639	4425644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_002947	CGT	2	6	4425685	4425690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_002947	CCG	2	6	4425732	4425737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10566	NC_002947	GC	3	6	4427465	4427470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10567	NC_002947	TGG	2	6	4427513	4427518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10571	NC_002947	T	6	6	4428893	4428898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10575	NC_002947	T	8	8	4430094	4430101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10580	NC_002947	CG	4	8	4432964	4432971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10581	NC_002947	A	7	7	4432991	4432997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_002947	CG	3	6	4433008	4433013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10583	NC_002947	CTG	2	6	4433017	4433022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10585	NC_002947	GCG	2	6	4433073	4433078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10590	NC_002947	CCCG	2	8	4433170	4433177	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10591	NC_002947	TCA	2	6	4433267	4433272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10593	NC_002947	CGCA	2	8	4433434	4433441	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10594	NC_002947	A	6	6	4433462	4433467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_002947	GGCA	2	8	4433486	4433493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10596	NC_002947	CGC	2	6	4433892	4433897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10597	NC_002947	GACG	2	8	4433973	4433980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10598	NC_002947	GCC	2	6	4434302	4434307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10599	NC_002947	GCG	2	6	4434314	4434319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10602	NC_002947	ACTG	2	8	4434821	4434828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10603	NC_002947	ACC	2	6	4436766	4436771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10604	NC_002947	AC	3	6	4436780	4436785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10605	NC_002947	CG	3	6	4436873	4436878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10606	NC_002947	TCGCTG	2	12	4436953	4436964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_002947	CTG	2	6	4436997	4437002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_002947	TGGC	2	8	4437045	4437052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10610	NC_002947	GCA	2	6	4440095	4440100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10611	NC_002947	T	6	6	4440124	4440129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_002947	GGA	2	6	4440711	4440716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_002947	ATT	2	6	4440742	4440747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10615	NC_002947	GCT	2	6	4440822	4440827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10619	NC_002947	GA	3	6	4442604	4442609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_002947	CCTGC	2	10	4442635	4442644	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10621	NC_002947	GGCG	2	8	4443993	4444000	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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10626	NC_002947	ACC	2	6	4444110	4444115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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