MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 15146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_002947	AGCAGG	7	42	4233463	4233504	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10002	NC_002947	GCG	2	6	4235107	4235112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_002947	TGG	2	6	4235132	4235137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_002947	ACGA	2	8	4235201	4235208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10005	NC_002947	GAC	2	6	4238332	4238337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_002947	CCA	2	6	4238360	4238365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_002947	AC	3	6	4239254	4239259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10008	NC_002947	GCCCT	2	10	4239281	4239290	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10009	NC_002947	TGC	2	6	4239351	4239356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_002947	TG	3	6	4242915	4242920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_002947	GGT	2	6	4242921	4242926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_002947	T	6	6	4242929	4242934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_002947	CA	3	6	4243740	4243745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10014	NC_002947	CAG	2	6	4243772	4243777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_002947	CG	3	6	4243778	4243783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_002947	TCC	2	6	4243787	4243792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10017	NC_002947	GCG	2	6	4243801	4243806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_002947	GC	3	6	4246298	4246303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10019	NC_002947	GT	3	6	4246318	4246323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_002947	GCA	2	6	4246457	4246462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_002947	TCG	2	6	4246495	4246500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_002947	ACC	2	6	4246537	4246542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_002947	GCC	2	6	4246599	4246604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_002947	CACC	2	8	4246607	4246614	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10025	NC_002947	CCA	2	6	4246651	4246656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10026	NC_002947	GCCG	2	8	4246659	4246666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_002947	CAGC	2	8	4246704	4246711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10028	NC_002947	GCT	2	6	4246770	4246775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_002947	CGG	2	6	4246799	4246804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_002947	CCG	2	6	4246883	4246888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10031	NC_002947	GCA	2	6	4247025	4247030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_002947	CGC	2	6	4247034	4247039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_002947	CAC	2	6	4247098	4247103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_002947	TGG	2	6	4247173	4247178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_002947	TGC	2	6	4247237	4247242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_002947	GCG	2	6	4247297	4247302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_002947	ACC	2	6	4247366	4247371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10038	NC_002947	GCC	2	6	4247399	4247404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_002947	GC	4	8	4247468	4247475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_002947	GTC	2	6	4247491	4247496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_002947	GC	3	6	4247543	4247548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_002947	GCAG	2	8	4247565	4247572	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_002947	TGA	2	6	4247688	4247693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_002947	CG	3	6	4247723	4247728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10045	NC_002947	CAA	2	6	4247866	4247871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_002947	TGA	2	6	4251214	4251219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_002947	G	6	6	4252030	4252035	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_002947	GTT	2	6	4252043	4252048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_002947	GGA	2	6	4252060	4252065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_002947	TGA	2	6	4252068	4252073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_002947	GGC	2	6	4252202	4252207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_002947	CGA	3	9	4252251	4252259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_002947	GCG	2	6	4252263	4252268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_002947	ATT	2	6	4253744	4253749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_002947	ATT	2	6	4253798	4253803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_002947	GTT	2	6	4257641	4257646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_002947	AC	3	6	4257649	4257654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10058	NC_002947	CAG	2	6	4257661	4257666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_002947	ACA	2	6	4258373	4258378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_002947	CAC	2	6	4258405	4258410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_002947	CAA	3	9	4258431	4258439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_002947	AAC	2	6	4259222	4259227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_002947	GTT	2	6	4259242	4259247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_002947	TGGGT	2	10	4263437	4263446	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_002947	GATC	2	8	4263500	4263507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10066	NC_002947	GAC	2	6	4263529	4263534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_002947	GCC	2	6	4263546	4263551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_002947	TAAA	2	8	4263675	4263682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_002947	TGC	2	6	4266507	4266512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_002947	TGT	2	6	4266518	4266523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_002947	GTT	2	6	4266676	4266681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_002947	TTC	2	6	4266698	4266703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_002947	TGC	2	6	4266762	4266767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_002947	GTG	2	6	4266776	4266781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_002947	CAG	2	6	4266814	4266819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_002947	CTG	2	6	4266929	4266934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_002947	ACTG	2	8	4266951	4266958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10078	NC_002947	GC	3	6	4267054	4267059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10079	NC_002947	GCA	2	6	4267131	4267136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10081	NC_002947	GCT	2	6	4267200	4267205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_002947	GGCC	2	8	4267324	4267331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10083	NC_002947	CAC	2	6	4267372	4267377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10084	NC_002947	GCA	2	6	4267390	4267395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_002947	GGC	2	6	4267396	4267401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_002947	TCG	2	6	4267404	4267409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_002947	CAA	2	6	4267433	4267438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_002947	CGC	2	6	4267478	4267483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10089	NC_002947	GCCCG	2	10	4267486	4267495	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10090	NC_002947	GTC	2	6	4267502	4267507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10092	NC_002947	GGC	2	6	4267685	4267690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_002947	AGT	3	9	4267717	4267725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_002947	AAG	2	6	4267758	4267763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_002947	C	6	6	4267764	4267769	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10096	NC_002947	CAT	2	6	4267850	4267855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_002947	TAT	2	6	4267856	4267861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_002947	GCA	2	6	4267883	4267888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_002947	GGA	2	6	4269364	4269369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_002947	AGG	2	6	4269442	4269447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_002947	T	6	6	4269565	4269570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_002947	ATAA	2	8	4269571	4269578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_002947	CAAC	2	8	4269600	4269607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10104	NC_002947	A	6	6	4269661	4269666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_002947	TCA	2	6	4269681	4269686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_002947	CA	3	6	4269741	4269746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10107	NC_002947	GCCA	2	8	4269753	4269760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10108	NC_002947	CG	4	8	4269822	4269829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10109	NC_002947	GCC	2	6	4271764	4271769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_002947	GTG	2	6	4271770	4271775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_002947	CG	3	6	4272507	4272512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10112	NC_002947	CCAG	2	8	4272612	4272619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10113	NC_002947	CCG	2	6	4272644	4272649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10114	NC_002947	CGG	2	6	4273046	4273051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_002947	CAGA	2	8	4273899	4273906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10116	NC_002947	GAA	2	6	4273930	4273935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_002947	GCACGC	2	12	4273978	4273989	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10118	NC_002947	CAA	4	12	4274010	4274021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_002947	TCC	2	6	4278778	4278783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_002947	CGGCT	2	10	4281462	4281471	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10121	NC_002947	GCG	2	6	4281574	4281579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_002947	GCT	2	6	4281720	4281725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_002947	GC	3	6	4281741	4281746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_002947	GC	3	6	4281796	4281801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_002947	CGC	2	6	4281866	4281871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10126	NC_002947	TGC	2	6	4281879	4281884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10128	NC_002947	CCA	2	6	4282004	4282009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10129	NC_002947	GTT	2	6	4283269	4283274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_002947	GCC	2	6	4283334	4283339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10131	NC_002947	CGT	2	6	4292632	4292637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_002947	TGT	2	6	4292638	4292643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_002947	CG	3	6	4292785	4292790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10134	NC_002947	TGCCC	2	10	4294002	4294011	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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10167	NC_002947	TCCA	2	8	4302041	4302048	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10251	NC_002947	CG	3	6	4333070	4333075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10252	NC_002947	TGC	2	6	4333132	4333137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10255	NC_002947	CGCC	2	8	4338692	4338699	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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