MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 15146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002947	GGT	2	6	174661	174666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_002947	TGA	2	6	174710	174715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_002947	CGA	2	6	174731	174736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_002947	GGT	2	6	174811	174816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_002947	GA	3	6	174841	174846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_002947	TTA	2	6	174967	174972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_002947	CGG	2	6	175091	175096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_002947	GGC	2	6	175172	175177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_002947	TGAAAT	2	12	175200	175211	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_002947	ACC	2	6	175362	175367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_002947	TGG	2	6	175422	175427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_002947	TCC	2	6	175448	175453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_002947	GGA	2	6	175465	175470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_002947	GC	3	6	175526	175531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_002947	GGT	2	6	175585	175590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_002947	CGG	2	6	175672	175677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_002947	TCA	2	6	175700	175705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_002947	CGT	2	6	175780	175785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_002947	GCT	2	6	175834	175839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_002947	ACG	2	6	176015	176020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_002947	GT	3	6	176033	176038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_002947	GGT	2	6	176127	176132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_002947	GAC	2	6	176240	176245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_002947	ACC	2	6	176260	176265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_002947	ATCCC	2	10	176268	176277	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
526	NC_002947	AGT	2	6	176284	176289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_002947	GGT	2	6	176461	176466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_002947	TAT	2	6	176488	176493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_002947	CGA	2	6	176504	176509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_002947	GA	3	6	176508	176513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_002947	A	6	6	176555	176560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_002947	GC	3	6	176604	176609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_002947	GGC	2	6	176839	176844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_002947	GCG	2	6	176897	176902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_002947	TGG	2	6	177048	177053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_002947	CGA	2	6	177072	177077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_002947	GAT	2	6	177097	177102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_002947	GCA	2	6	177146	177151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_002947	GT	3	6	177199	177204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_002947	GAA	2	6	177205	177210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_002947	GGA	2	6	177241	177246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_002947	CAG	2	6	177314	177319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_002947	GC	3	6	177370	177375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_002947	GGT	2	6	177379	177384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_002947	GTG	2	6	177463	177468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_002947	AGGA	2	8	177503	177510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_002947	ACC	2	6	177529	177534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_002947	GAA	2	6	177768	177773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_002947	TGC	2	6	177844	177849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_002947	GTC	2	6	177856	177861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_002947	TCGTG	2	10	177865	177874	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
552	NC_002947	TGG	2	6	177934	177939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_002947	GGA	2	6	177970	177975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_002947	TCA	2	6	177995	178000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_002947	AC	3	6	178021	178026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_002947	AC	3	6	178190	178195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_002947	GGA	2	6	178250	178255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_002947	CCT	2	6	178331	178336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_002947	CGA	2	6	178341	178346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_002947	CTG	2	6	178354	178359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_002947	GATA	2	8	178491	178498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_002947	CTG	2	6	178519	178524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_002947	GTC	2	6	178592	178597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_002947	GAA	2	6	178639	178644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_002947	CAGC	2	8	178760	178767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_002947	TAG	2	6	178870	178875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_002947	GCGA	2	8	178878	178885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
568	NC_002947	G	6	6	179027	179032	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
569	NC_002947	TCC	2	6	179037	179042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_002947	TAC	2	6	179052	179057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_002947	TGAC	2	8	179058	179065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_002947	ACTG	2	8	179339	179346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
573	NC_002947	ACCGA	2	10	179351	179360	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
574	NC_002947	AC	3	6	179564	179569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_002947	CGTC	2	8	179582	179589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
576	NC_002947	AAC	2	6	179601	179606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_002947	AGG	2	6	179675	179680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_002947	AGC	2	6	179691	179696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_002947	AAAG	2	8	179705	179712	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
580	NC_002947	AGTCG	2	10	179727	179736	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
581	NC_002947	ATC	2	6	179788	179793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_002947	ATG	3	9	179796	179804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_002947	GTTG	2	8	180072	180079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_002947	GGT	2	6	180091	180096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_002947	TGA	2	6	180140	180145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_002947	GGT	2	6	180241	180246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_002947	GA	3	6	180271	180276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_002947	TTA	2	6	180397	180402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_002947	CGG	2	6	180521	180526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_002947	GGC	2	6	180602	180607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_002947	TGAAAT	2	12	180630	180641	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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594	NC_002947	TGG	2	6	180852	180857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_002947	TCC	2	6	180878	180883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_002947	GGA	2	6	180895	180900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_002947	GC	3	6	180956	180961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_002947	GGT	2	6	181015	181020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_002947	CGG	2	6	181102	181107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_002947	TCA	2	6	181130	181135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_002947	CGT	2	6	181210	181215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_002947	GCT	2	6	181264	181269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_002947	ACG	2	6	181445	181450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_002947	GT	3	6	181463	181468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_002947	GGT	2	6	181557	181562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_002947	GAC	2	6	181670	181675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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608	NC_002947	ATCCC	2	10	181698	181707	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
609	NC_002947	AGT	2	6	181714	181719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_002947	CA	3	6	181880	181885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_002947	GAC	2	6	181895	181900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_002947	ACC	2	6	181915	181920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_002947	ATCCC	2	10	181923	181932	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
614	NC_002947	CAG	2	6	181938	181943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_002947	TTG	2	6	186165	186170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_002947	GCCT	2	8	186920	186927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
617	NC_002947	TGG	2	6	187025	187030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_002947	GCT	2	6	187155	187160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_002947	GCT	2	6	189925	189930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_002947	CT	3	6	193523	193528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_002947	TGG	2	6	193538	193543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_002947	GTGGG	2	10	193544	193553	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
623	NC_002947	CGT	2	6	193559	193564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_002947	TGC	2	6	193599	193604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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628	NC_002947	TTG	2	6	193846	193851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_002947	CTT	2	6	193906	193911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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632	NC_002947	GCT	2	6	193998	194003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_002947	CTGG	2	8	194045	194052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_002947	GTCG	2	8	194170	194177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_002947	CGC	2	6	194178	194183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_002947	GCT	2	6	194194	194199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_002947	TGA	2	6	194244	194249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_002947	ACATT	2	10	194303	194312	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
639	NC_002947	ATC	2	6	194411	194416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_002947	ACC	2	6	220546	220551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
641	NC_002947	GC	3	6	220619	220624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
642	NC_002947	TGC	2	6	220642	220647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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644	NC_002947	AAC	2	6	220664	220669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_002947	GCAAC	2	10	220699	220708	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
646	NC_002947	GCC	2	6	220709	220714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
647	NC_002947	TGC	2	6	220722	220727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_002947	CAAA	2	8	220837	220844	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
651	NC_002947	GC	3	6	220932	220937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
652	NC_002947	GCT	2	6	220945	220950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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659	NC_002947	CCG	2	6	225006	225011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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663	NC_002947	AAC	2	6	226623	226628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_002947	GAC	2	6	226659	226664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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667	NC_002947	GGC	2	6	234535	234540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
668	NC_002947	GAT	2	6	236861	236866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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670	NC_002947	GA	3	6	236902	236907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
671	NC_002947	GCACCT	2	12	237881	237892	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
672	NC_002947	TTC	2	6	242149	242154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
673	NC_002947	CCT	2	6	242160	242165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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681	NC_002947	TGC	2	6	242970	242975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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691	NC_002947	AGG	2	6	251810	251815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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