MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 15146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_002947	TCA	2	6	3500105	3500110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_002947	TCT	2	6	3500261	3500266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_002947	GAC	2	6	3500292	3500297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_002947	TGA	2	6	3500298	3500303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_002947	A	6	6	3500334	3500339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_002947	GGC	2	6	3500362	3500367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_002947	CGC	2	6	3500374	3500379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_002947	GAC	2	6	3500386	3500391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_002947	CCA	2	6	3500417	3500422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_002947	CG	3	6	3500560	3500565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8011	NC_002947	CTG	2	6	3500574	3500579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_002947	AGT	2	6	3500588	3500593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_002947	ATG	2	6	3500615	3500620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_002947	ACG	2	6	3500622	3500627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_002947	GGT	2	6	3500740	3500745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_002947	G	6	6	3500746	3500751	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_002947	CTGG	2	8	3501074	3501081	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8018	NC_002947	ATTT	2	8	3501107	3501114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_002947	ATG	2	6	3501121	3501126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_002947	CTTTC	2	10	3501130	3501139	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8021	NC_002947	GCAG	2	8	3501141	3501148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8022	NC_002947	GC	3	6	3501178	3501183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8023	NC_002947	GCT	2	6	3501287	3501292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_002947	CGC	2	6	3501295	3501300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_002947	CCG	2	6	3501305	3501310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_002947	GCT	3	9	3501350	3501358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_002947	CTG	3	9	3501408	3501416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_002947	ATG	2	6	3501444	3501449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_002947	TGA	2	6	3501548	3501553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_002947	GACT	2	8	3501569	3501576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8031	NC_002947	T	6	6	3501629	3501634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_002947	TGCCG	2	10	3501823	3501832	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8033	NC_002947	ACAA	2	8	3501867	3501874	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8034	NC_002947	GCG	2	6	3501893	3501898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_002947	GGGC	2	8	3502042	3502049	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8036	NC_002947	AGT	2	6	3502064	3502069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_002947	CTG	2	6	3502070	3502075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_002947	CGA	2	6	3502080	3502085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_002947	GTG	2	6	3502112	3502117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_002947	TG	4	8	3502119	3502126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_002947	TCT	2	6	3502152	3502157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_002947	CGT	2	6	3502205	3502210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_002947	TGCG	2	8	3502248	3502255	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8044	NC_002947	AGTC	2	8	3502519	3502526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8045	NC_002947	TTTC	2	8	3502533	3502540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8046	NC_002947	GAA	2	6	3502606	3502611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_002947	GCA	2	6	3502616	3502621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_002947	CTT	2	6	3502676	3502681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_002947	ATTTTT	2	12	3502710	3502721	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_002947	ACTCC	2	10	3502743	3502752	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8051	NC_002947	ATCA	2	8	3502758	3502765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8052	NC_002947	ACTG	2	8	3502790	3502797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8053	NC_002947	TAA	2	6	3502896	3502901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_002947	GT	3	6	3502997	3503002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_002947	TGG	2	6	3503047	3503052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_002947	GGT	2	6	3503126	3503131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_002947	CCA	2	6	3503170	3503175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8058	NC_002947	TGTT	2	8	3503203	3503210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_002947	GTT	2	6	3503248	3503253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_002947	TCA	2	6	3503364	3503369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_002947	GGC	2	6	3503380	3503385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_002947	ATT	2	6	3503421	3503426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_002947	CGC	2	6	3503495	3503500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_002947	GGAA	2	8	3503531	3503538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_002947	CTG	2	6	3503557	3503562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_002947	AAGG	2	8	3503596	3503603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_002947	CAT	2	6	3503763	3503768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_002947	GCCC	2	8	3503857	3503864	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8069	NC_002947	ATC	2	6	3503865	3503870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_002947	GC	3	6	3503893	3503898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8071	NC_002947	CTG	2	6	3503979	3503984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_002947	CTT	2	6	3503990	3503995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_002947	AGCT	2	8	3504004	3504011	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8074	NC_002947	GCT	3	9	3504050	3504058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_002947	GGC	2	6	3504102	3504107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8077	NC_002947	CTG	2	6	3504194	3504199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_002947	TGGC	2	8	3504246	3504253	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8079	NC_002947	GATA	2	8	3505761	3505768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_002947	CG	3	6	3505805	3505810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8081	NC_002947	TTA	2	6	3505910	3505915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_002947	GTT	2	6	3505921	3505926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_002947	GCG	2	6	3505991	3505996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_002947	AGC	2	6	3505997	3506002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8086	NC_002947	TCA	2	6	3506219	3506224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_002947	GT	3	6	3506277	3506282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_002947	TCAT	2	8	3506412	3506419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8089	NC_002947	CGGC	2	8	3506497	3506504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_002947	GTT	2	6	3506539	3506544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_002947	TTGC	2	8	3506552	3506559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8092	NC_002947	GCT	2	6	3510321	3510326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_002947	ACC	2	6	3510453	3510458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8094	NC_002947	CCG	3	9	3510494	3510502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8095	NC_002947	CCT	2	6	3510605	3510610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8096	NC_002947	TGGC	2	8	3510774	3510781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8097	NC_002947	GTC	2	6	3515522	3515527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_002947	TGA	2	6	3515648	3515653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_002947	ACAA	2	8	3515670	3515677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8100	NC_002947	GAG	2	6	3515730	3515735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_002947	AAG	2	6	3515780	3515785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_002947	T	6	6	3515819	3515824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_002947	CTG	2	6	3515874	3515879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_002947	AT	3	6	3515882	3515887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_002947	A	7	7	3515912	3515918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_002947	AAT	2	6	3515930	3515935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_002947	GCTG	2	8	3515959	3515966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8108	NC_002947	TGGT	2	8	3515973	3515980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_002947	TTTG	2	8	3515981	3515988	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_002947	TAA	2	6	3516029	3516034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_002947	GTA	2	6	3516043	3516048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_002947	GCA	2	6	3516130	3516135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_002947	CG	3	6	3516194	3516199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8114	NC_002947	ACC	2	6	3516309	3516314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8115	NC_002947	GGC	2	6	3516338	3516343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8118	NC_002947	ATC	2	6	3516489	3516494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_002947	GCA	2	6	3516534	3516539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_002947	GC	3	6	3516548	3516553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_002947	ACG	2	6	3516555	3516560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_002947	CAT	2	6	3516643	3516648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8124	NC_002947	TAC	2	6	3516734	3516739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_002947	ACC	2	6	3516791	3516796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8126	NC_002947	TGC	2	6	3516825	3516830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_002947	AAC	2	6	3516934	3516939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_002947	CTGA	2	8	3516988	3516995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8130	NC_002947	GGCA	2	8	3517099	3517106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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