MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 15146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002947	TCA	2	6	2553213	2553218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_002947	CGT	2	6	2553293	2553298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_002947	GCT	2	6	2553347	2553352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_002947	ACG	2	6	2553528	2553533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_002947	GT	3	6	2553546	2553551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_002947	TGG	2	6	2553638	2553643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_002947	GAC	2	6	2553752	2553757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_002947	ACC	2	6	2553772	2553777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_002947	ATCCC	2	10	2553780	2553789	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6010	NC_002947	AGT	2	6	2553796	2553801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_002947	TGG	2	6	2553914	2553919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_002947	A	7	7	2553922	2553928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_002947	GGC	2	6	2555996	2556001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_002947	GCG	2	6	2556028	2556033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_002947	AGC	2	6	2557380	2557385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_002947	GGT	2	6	2557426	2557431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_002947	AG	3	6	2557441	2557446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_002947	AACA	2	8	2557576	2557583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6019	NC_002947	ACC	2	6	2557633	2557638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_002947	GCC	2	6	2557646	2557651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_002947	GCC	2	6	2559981	2559986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_002947	CGA	2	6	2560025	2560030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_002947	T	7	7	2561482	2561488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_002947	TTA	2	6	2561510	2561515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_002947	GCG	2	6	2562162	2562167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_002947	AT	3	6	2562214	2562219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_002947	GCC	2	6	2563838	2563843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_002947	ACA	2	6	2563875	2563880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_002947	ACA	2	6	2564980	2564985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_002947	GCC	2	6	2564999	2565004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_002947	GACG	2	8	2567034	2567041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6032	NC_002947	CCT	2	6	2567930	2567935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_002947	GCT	2	6	2567952	2567957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_002947	GCC	2	6	2568488	2568493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_002947	G	7	7	2569569	2569575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_002947	GCT	2	6	2569605	2569610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_002947	CAG	2	6	2569630	2569635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_002947	GAG	2	6	2572436	2572441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_002947	ATT	2	6	2572499	2572504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_002947	GTGC	2	8	2572628	2572635	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_002947	GATC	2	8	2573037	2573044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_002947	TGA	2	6	2573063	2573068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_002947	GTCA	2	8	2573095	2573102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6044	NC_002947	CCTT	2	8	2573109	2573116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_002947	TCA	2	6	2576513	2576518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_002947	G	6	6	2576543	2576548	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_002947	CTG	2	6	2576586	2576591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_002947	GCG	2	6	2576593	2576598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_002947	CCG	2	6	2578399	2578404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_002947	GTT	2	6	2578411	2578416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_002947	ACA	2	6	2578563	2578568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_002947	TTC	2	6	2582495	2582500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_002947	TGC	2	6	2582517	2582522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_002947	GTG	2	6	2582595	2582600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_002947	GTTT	2	8	2582604	2582611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_002947	CTG	2	6	2582618	2582623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_002947	ACCTGC	2	12	2582634	2582645	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_002947	TGG	2	6	2582646	2582651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_002947	GCT	2	6	2582686	2582691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_002947	TGGC	2	8	2582702	2582709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6061	NC_002947	GGT	2	6	2582710	2582715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_002947	GAGC	2	8	2582730	2582737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6063	NC_002947	GGT	2	6	2584526	2584531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_002947	ACCG	2	8	2584535	2584542	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_002947	CGCT	2	8	2584558	2584565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_002947	A	8	8	2584591	2584598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_002947	GGT	2	6	2585568	2585573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_002947	AAT	2	6	2585597	2585602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_002947	T	6	6	2585608	2585613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_002947	GAC	2	6	2585627	2585632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_002947	CGC	2	6	2585655	2585660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_002947	GCAA	2	8	2585851	2585858	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_002947	TGG	2	6	2585877	2585882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_002947	GTG	2	6	2586013	2586018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6076	NC_002947	GCG	2	6	2586050	2586055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_002947	CAC	2	6	2586087	2586092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_002947	A	6	6	2586100	2586105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_002947	T	7	7	2586150	2586156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_002947	AG	3	6	2586211	2586216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_002947	TCG	2	6	2586297	2586302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_002947	TC	3	6	2586435	2586440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6083	NC_002947	GACT	2	8	2586447	2586454	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6084	NC_002947	T	6	6	2586474	2586479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_002947	G	6	6	2586480	2586485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_002947	ATG	2	6	2586607	2586612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_002947	C	7	7	2589335	2589341	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6088	NC_002947	ACC	2	6	2589463	2589468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6089	NC_002947	GCA	3	9	2589488	2589496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_002947	ACC	2	6	2589571	2589576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_002947	GA	3	6	2589702	2589707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_002947	CAAC	2	8	2589737	2589744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_002947	CGC	2	6	2589827	2589832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_002947	TTGA	2	8	2589837	2589844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_002947	GC	3	6	2589873	2589878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_002947	CA	4	8	2589895	2589902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6097	NC_002947	GCC	2	6	2591561	2591566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_002947	TGA	2	6	2594343	2594348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_002947	TCACT	2	10	2597436	2597445	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6100	NC_002947	AG	3	6	2597451	2597456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_002947	GAG	2	6	2597707	2597712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_002947	AG	3	6	2598383	2598388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_002947	T	7	7	2598513	2598519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_002947	TGT	2	6	2598528	2598533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6107	NC_002947	CGA	2	6	2603055	2603060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_002947	TGGA	2	8	2603077	2603084	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_002947	ACT	2	6	2603102	2603107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_002947	TCA	2	6	2603180	2603185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_002947	CCGT	2	8	2603205	2603212	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_002947	GGC	2	6	2603250	2603255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_002947	GACC	2	8	2603358	2603365	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_002947	CGTG	2	8	2603406	2603413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6115	NC_002947	CCGTAG	2	12	2603512	2603523	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_002947	CGC	2	6	2603573	2603578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_002947	AGCG	2	8	2603642	2603649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6118	NC_002947	GCC	2	6	2603739	2603744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_002947	TCC	2	6	2603819	2603824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_002947	GCTC	2	8	2603827	2603834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_002947	CTCA	2	8	2604849	2604856	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_002947	TG	3	6	2604867	2604872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_002947	T	8	8	2604877	2604884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6125	NC_002947	GAC	2	6	2607852	2607857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_002947	GCC	2	6	2607880	2607885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_002947	GAG	2	6	2607895	2607900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_002947	TCC	2	6	2607922	2607927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_002947	TCCG	2	8	2608142	2608149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_002947	GCTG	2	8	2608202	2608209	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6131	NC_002947	ACC	2	6	2615773	2615778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6132	NC_002947	T	7	7	2615812	2615818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_002947	CCA	2	6	2618001	2618006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6134	NC_002947	ACA	2	6	2618015	2618020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6247	NC_002947	T	6	6	2650653	2650658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6254	NC_002947	CAG	2	6	2652431	2652436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6257	NC_002947	CGG	2	6	2653574	2653579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6258	NC_002947	GCA	2	6	2653596	2653601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6259	NC_002947	GC	3	6	2653602	2653607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6260	NC_002947	AGCG	2	8	2653618	2653625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6261	NC_002947	GC	3	6	2653630	2653635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6262	NC_002947	GAG	2	6	2653672	2653677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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