MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas sp. VLB120

Total Repeats: 106201

< Previous12...201202203204205206207208209210211212213Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
106001	NC_022738	TGC	2	6	5634069	5634074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225826
106002	NC_022738	GCC	2	6	5634106	5634111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225826
106003	NC_022738	CCTTGA	2	12	5634117	5634128	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	557225826
106004	NC_022738	AGA	2	6	5634135	5634140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557225826
106005	NC_022738	GGT	2	6	5634190	5634195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557225826
106006	NC_022738	CG	3	6	5634202	5634207	0 %	0 %	50 %	50 %	557225826
106007	NC_022738	TCA	2	6	5634285	5634290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557225826
106008	NC_022738	CGA	2	6	5634393	5634398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225826
106009	NC_022738	GCC	2	6	5634409	5634414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225826
106010	NC_022738	CTT	2	6	5634433	5634438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557225826
106011	NC_022738	CGC	2	6	5634439	5634444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225826
106012	NC_022738	GTG	2	6	5634601	5634606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557225826
106013	NC_022738	CTG	2	6	5634630	5634635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225826
106014	NC_022738	TCA	2	6	5634679	5634684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557225827
106015	NC_022738	ACA	2	6	5634781	5634786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557225827
106016	NC_022738	ATC	2	6	5634798	5634803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557225827
106017	NC_022738	TGCC	2	8	5634805	5634812	0 %	25 %	25 %	50 %	557225827
106018	NC_022738	GCC	2	6	5634846	5634851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225827
106019	NC_022738	CAG	2	6	5635001	5635006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225827
106020	NC_022738	AGCA	2	8	5635225	5635232	50 %	0 %	25 %	25 %	557225828
106021	NC_022738	TTG	2	6	5635286	5635291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557225828
106022	NC_022738	ACA	2	6	5635451	5635456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557225828
106023	NC_022738	TCC	2	6	5635484	5635489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557225828
106024	NC_022738	TGA	2	6	5635548	5635553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225828
106025	NC_022738	GCA	2	6	5635575	5635580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225828
106026	NC_022738	CTG	3	9	5635624	5635632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225828
106027	NC_022738	CTG	2	6	5635648	5635653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225828
106028	NC_022738	ATGGCG	2	12	5635724	5635735	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	557225828
106029	NC_022738	TCG	2	6	5635739	5635744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225828
106030	NC_022738	GGCC	2	8	5635779	5635786	0 %	0 %	50 %	50 %	557225828
106031	NC_022738	GC	3	6	5635796	5635801	0 %	0 %	50 %	50 %	557225828
106032	NC_022738	GCG	2	6	5635804	5635809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557225828
106033	NC_022738	GAT	2	6	5635819	5635824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225828
106034	NC_022738	TTC	2	6	5635900	5635905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557225828
106035	NC_022738	CGCGG	2	10	5635926	5635935	0 %	0 %	60 %	40 %	557225828
106036	NC_022738	TTCT	2	8	5635981	5635988	0 %	75 %	0 %	25 %	557225828
106037	NC_022738	GC	3	6	5636016	5636021	0 %	0 %	50 %	50 %	557225828
106038	NC_022738	GTT	2	6	5636099	5636104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557225829
106039	NC_022738	GGCCAG	2	12	5636149	5636160	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	557225829
106040	NC_022738	CG	3	6	5636175	5636180	0 %	0 %	50 %	50 %	557225829
106041	NC_022738	GCT	2	6	5636265	5636270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225829
106042	NC_022738	GTT	2	6	5636305	5636310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557225829
106043	NC_022738	GCA	2	6	5636340	5636345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225829
106044	NC_022738	GTA	2	6	5636428	5636433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225829
106045	NC_022738	GGC	2	6	5636565	5636570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557225829
106046	NC_022738	CAG	2	6	5636590	5636595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225829
106047	NC_022738	CAC	2	6	5636596	5636601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225829
106048	NC_022738	CGG	2	6	5636607	5636612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557225829
106049	NC_022738	GCA	2	6	5636631	5636636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225829
106050	NC_022738	GCC	2	6	5636644	5636649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225829
106051	NC_022738	AGT	2	6	5636658	5636663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225829
106052	NC_022738	CAG	2	6	5636695	5636700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225829
106053	NC_022738	TGG	2	6	5636748	5636753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557225829
106054	NC_022738	CAG	2	6	5636779	5636784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225829
106055	NC_022738	ACG	2	6	5636788	5636793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225829
106056	NC_022738	CAGC	2	8	5636802	5636809	25 %	0 %	25 %	50 %	557225829
106057	NC_022738	TGC	2	6	5636812	5636817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225829
106058	NC_022738	GGT	3	9	5636830	5636838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557225829
106059	NC_022738	TTG	2	6	5636886	5636891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557225829
106060	NC_022738	GCG	2	6	5636914	5636919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557225830
106061	NC_022738	CAG	2	6	5636926	5636931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225830
106062	NC_022738	TGC	2	6	5637096	5637101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225830
106063	NC_022738	GAT	2	6	5637115	5637120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225830
106064	NC_022738	GCG	2	6	5637135	5637140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557225830
106065	NC_022738	TCT	2	6	5637222	5637227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557225830
106066	NC_022738	CCA	2	6	5637296	5637301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225830
106067	NC_022738	CACG	2	8	5637399	5637406	25 %	0 %	25 %	50 %	557225830
106068	NC_022738	CAG	2	6	5637457	5637462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225830
106069	NC_022738	CTG	2	6	5637469	5637474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225830
106070	NC_022738	GC	3	6	5637502	5637507	0 %	0 %	50 %	50 %	557225830
106071	NC_022738	CGGC	2	8	5637574	5637581	0 %	0 %	50 %	50 %	557225831
106072	NC_022738	T	6	6	5637588	5637593	0 %	100 %	0 %	0 %	557225831
106073	NC_022738	CGC	2	6	5637618	5637623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225831
106074	NC_022738	GTG	2	6	5637718	5637723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557225831
106075	NC_022738	CAGG	2	8	5637737	5637744	25 %	0 %	50 %	25 %	557225831
106076	NC_022738	TTC	2	6	5637777	5637782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557225831
106077	NC_022738	GAT	2	6	5637849	5637854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225831
106078	NC_022738	CAG	2	6	5637906	5637911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225831
106079	NC_022738	GCG	2	6	5637974	5637979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557225831
106080	NC_022738	GGC	2	6	5638050	5638055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557225831
106081	NC_022738	CG	3	6	5638060	5638065	0 %	0 %	50 %	50 %	557225831
106082	NC_022738	TCG	2	6	5638066	5638071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225831
106083	NC_022738	GTC	2	6	5638197	5638202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225831
106084	NC_022738	TCA	2	6	5638225	5638230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557225831
106085	NC_022738	CAG	2	6	5638287	5638292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225831
106086	NC_022738	CTT	2	6	5638307	5638312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557225831
106087	NC_022738	GGT	2	6	5638320	5638325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557225831
106088	NC_022738	GAA	2	6	5638344	5638349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557225831
106089	NC_022738	GCC	2	6	5638353	5638358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225831
106090	NC_022738	AGT	2	6	5638403	5638408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225831
106091	NC_022738	TG	3	6	5638439	5638444	0 %	50 %	50 %	0 %	557225831
106092	NC_022738	CCAGCT	2	12	5638472	5638483	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	557225831
106093	NC_022738	GGT	2	6	5638533	5638538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557225831
106094	NC_022738	TGG	2	6	5638564	5638569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557225831
106095	NC_022738	TCGA	2	8	5638603	5638610	25 %	25 %	25 %	25 %	557225831
106096	NC_022738	CG	3	6	5638696	5638701	0 %	0 %	50 %	50 %	557225831
106097	NC_022738	TCA	2	6	5638799	5638804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557225831
106098	NC_022738	CCG	2	6	5638963	5638968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225831
106099	NC_022738	GTC	2	6	5638981	5638986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225831
106100	NC_022738	CAC	2	6	5638989	5638994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225831
106101	NC_022738	GAA	2	6	5639004	5639009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557225831
106102	NC_022738	CGA	2	6	5639054	5639059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225831
106103	NC_022738	GTC	2	6	5639064	5639069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225831
106104	NC_022738	CTG	2	6	5639076	5639081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225831
106105	NC_022738	CAC	2	6	5639121	5639126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225831
106106	NC_022738	CGCA	2	8	5639163	5639170	25 %	0 %	25 %	50 %	557225831
106107	NC_022738	CGG	2	6	5639171	5639176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557225831
106108	NC_022738	GTT	2	6	5639187	5639192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557225831
106109	NC_022738	AC	3	6	5639195	5639200	50 %	0 %	0 %	50 %	557225831
106110	NC_022738	GCC	2	6	5639241	5639246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225831
106111	NC_022738	CAG	3	9	5639340	5639348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225831
106112	NC_022738	GCC	3	9	5639400	5639408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225831
106113	NC_022738	GGGAA	2	10	5639429	5639438	40 %	0 %	60 %	0 %	557225831
106114	NC_022738	CCA	2	6	5639441	5639446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225831
106115	NC_022738	TTAC	2	8	5640042	5640049	25 %	50 %	0 %	25 %	557225832
106116	NC_022738	GCA	2	6	5640302	5640307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225832
106117	NC_022738	TCG	2	6	5640322	5640327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225832
106118	NC_022738	CGT	2	6	5640359	5640364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225832
106119	NC_022738	CGC	2	6	5640389	5640394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225832
106120	NC_022738	CCA	3	9	5640503	5640511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225832
106121	NC_022738	T	6	6	5640563	5640568	0 %	100 %	0 %	0 %	557225832
106122	NC_022738	GTC	2	6	5640576	5640581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225832
106123	NC_022738	GTG	2	6	5640661	5640666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557225832
106124	NC_022738	GCCA	2	8	5640699	5640706	25 %	0 %	25 %	50 %	557225832
106125	NC_022738	TCC	2	6	5640874	5640879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557225832
106126	NC_022738	GCC	2	6	5640895	5640900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225832
106127	NC_022738	AG	3	6	5640970	5640975	50 %	0 %	50 %	0 %	557225832
106128	NC_022738	TGCG	2	8	5640986	5640993	0 %	25 %	50 %	25 %	557225832
106129	NC_022738	CTGG	2	8	5640996	5641003	0 %	25 %	50 %	25 %	557225832
106130	NC_022738	GC	3	6	5641092	5641097	0 %	0 %	50 %	50 %	557225832
106131	NC_022738	AGC	2	6	5641129	5641134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225832
106132	NC_022738	CAC	2	6	5641143	5641148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225832
106133	NC_022738	CCA	2	6	5641153	5641158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225832
106134	NC_022738	GAA	2	6	5641209	5641214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557225832
106135	NC_022738	TCG	2	6	5641249	5641254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225832
106136	NC_022738	GGC	2	6	5641320	5641325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557225832
106137	NC_022738	TACC	2	8	5641349	5641356	25 %	25 %	0 %	50 %	557225832
106138	NC_022738	AGC	3	9	5641502	5641510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106139	NC_022738	TGC	2	6	5641520	5641525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106140	NC_022738	TGC	2	6	5641531	5641536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106141	NC_022738	CTG	2	6	5641550	5641555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106142	NC_022738	GTT	2	6	5641571	5641576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557225833
106143	NC_022738	ACCAG	2	10	5641593	5641602	40 %	0 %	20 %	40 %	557225833
106144	NC_022738	GAA	3	9	5641616	5641624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557225833
106145	NC_022738	GAT	2	6	5641631	5641636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225833
106146	NC_022738	CAT	2	6	5641640	5641645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557225833
106147	NC_022738	CGG	2	6	5641673	5641678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557225833
106148	NC_022738	TGG	2	6	5641708	5641713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557225833
106149	NC_022738	ATG	2	6	5641719	5641724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225833
106150	NC_022738	GAA	2	6	5641736	5641741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557225833
106151	NC_022738	CAG	2	6	5641808	5641813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106152	NC_022738	AGC	2	6	5641861	5641866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106153	NC_022738	TCT	2	6	5641882	5641887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557225833
106154	NC_022738	CAT	2	6	5641904	5641909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557225833
106155	NC_022738	TCT	2	6	5641921	5641926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557225833
106156	NC_022738	GAA	2	6	5642021	5642026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557225833
106157	NC_022738	TGA	2	6	5642035	5642040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225833
106158	NC_022738	GAT	2	6	5642054	5642059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225833
106159	NC_022738	CAG	2	6	5642078	5642083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106160	NC_022738	GCA	2	6	5642098	5642103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106161	NC_022738	AGA	2	6	5642107	5642112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557225833
106162	NC_022738	CCA	2	6	5642235	5642240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225833
106163	NC_022738	GCCGG	2	10	5642256	5642265	0 %	0 %	60 %	40 %	557225833
106164	NC_022738	GAT	2	6	5642273	5642278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225833
106165	NC_022738	GAC	2	6	5642309	5642314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106166	NC_022738	TTG	2	6	5642316	5642321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557225833
106167	NC_022738	AGT	2	6	5642353	5642358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225833
106168	NC_022738	GCC	2	6	5642378	5642383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225833
106169	NC_022738	TTTC	2	8	5642392	5642399	0 %	75 %	0 %	25 %	557225833
106170	NC_022738	GGC	2	6	5642462	5642467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557225833
106171	NC_022738	AGGT	2	8	5642472	5642479	25 %	25 %	50 %	0 %	557225833
106172	NC_022738	CGA	2	6	5642501	5642506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106173	NC_022738	AGGT	2	8	5642583	5642590	25 %	25 %	50 %	0 %	557225833
106174	NC_022738	TGAAGC	2	12	5642617	5642628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	557225833
106175	NC_022738	ACC	2	6	5642670	5642675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225833
106176	NC_022738	GTT	2	6	5642677	5642682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557225833
106177	NC_022738	GAC	2	6	5642731	5642736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106178	NC_022738	CCA	2	6	5642802	5642807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225833
106179	NC_022738	TGGAA	2	10	5642820	5642829	40 %	20 %	40 %	0 %	557225833
106180	NC_022738	GAC	2	6	5642845	5642850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106181	NC_022738	CCAC	2	8	5642886	5642893	25 %	0 %	0 %	75 %	557225833
106182	NC_022738	CCGG	2	8	5643024	5643031	0 %	0 %	50 %	50 %	557225833
106183	NC_022738	GCA	2	6	5643066	5643071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106184	NC_022738	CGA	2	6	5643151	5643156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
106185	NC_022738	GAA	2	6	5643197	5643202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557225834
106186	NC_022738	AGGA	2	8	5643210	5643217	50 %	0 %	50 %	0 %	557225834
106187	NC_022738	G	6	6	5643220	5643225	0 %	0 %	100 %	0 %	557225834
106188	NC_022738	ACC	2	6	5643238	5643243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225834
106189	NC_022738	CGA	2	6	5643272	5643277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225834
106190	NC_022738	CCAC	2	8	5643286	5643293	25 %	0 %	0 %	75 %	557225834
106191	NC_022738	TG	3	6	5643481	5643486	0 %	50 %	50 %	0 %	557225835
106192	NC_022738	TATC	2	8	5643532	5643539	25 %	50 %	0 %	25 %	557225835
106193	NC_022738	GC	3	6	5643554	5643559	0 %	0 %	50 %	50 %	557225835
106194	NC_022738	CTG	2	6	5643590	5643595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225835
106195	NC_022738	GGAA	2	8	5643604	5643611	50 %	0 %	50 %	0 %	557225835
106196	NC_022738	CTT	2	6	5643662	5643667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557225835
106197	NC_022738	CAG	2	6	5643722	5643727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225835
106198	NC_022738	CAC	2	6	5643821	5643826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225835
106199	NC_022738	ACG	3	9	5643870	5643878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225836
106200	NC_022738	GC	5	10	5643933	5643942	0 %	0 %	50 %	50 %	557225836
106201	NC_022738	TTGG	2	8	5643953	5643960	0 %	50 %	50 %	0 %	557225836

< Previous12...201202203204205206207208209210211212213Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.